RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533653.5

GMDS-AS1-211, humanhuman

TSL 2

Gene GMDS-AS1, Length 568 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.24■■□□□ 1.15
GMDS-AS1-211ENST00000533653 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.23■■□□□ 1.15
GMDS-AS1-211ENST00000533653 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
GMDS-AS1-211ENST00000533653 EXOC5O00471 708 aa22.22■■□□□ 1.15
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MTHFSP49914 203 aa22.21■■□□□ 1.15
GMDS-AS1-211ENST00000533653 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.21■■□□□ 1.15
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.2■■□□□ 1.14
GMDS-AS1-211ENST00000533653 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NHSQ6T4R5 1651 aa22.19■■□□□ 1.14
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.19■■□□□ 1.14
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SLC4A2P04920 1241 aa22.18■■□□□ 1.14
GMDS-AS1-211ENST00000533653 EYA1Q99502 592 aa22.18■■□□□ 1.14
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KDRP35968 1356 aa22.17■■□□□ 1.14
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
GMDS-AS1-211ENST00000533653 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.16■■□□□ 1.14
GMDS-AS1-211ENST00000533653 IL13P35225 146 aa22.15■■□□□ 1.14
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RALBP1Q15311 655 aa22.15■■□□□ 1.14
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PPP2R1AP30153 589 aa22.14■■□□□ 1.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CFAP53Q96M91 514 aa22.14■■□□□ 1.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.13■■□□□ 1.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.13■■□□□ 1.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.131e-12■■■□□ 15
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.13■■□□□ 1.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FAM182BQ5T319 152 aa22.12■■□□□ 1.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RREB1Q92766 1687 aa22.08■■□□□ 1.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SPG7Q9UQ90 795 aa22.08■■□□□ 1.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BAG6P46379 1132 aa22.07■■□□□ 1.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BTAF1O14981 1849 aa22.07■■□□□ 1.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TRIM37O94972 964 aa22.06■■□□□ 1.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.06■■□□□ 1.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.05■■□□□ 1.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.05■■□□□ 1.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.05■■□□□ 1.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NUDCQ9Y266 331 aa22.04■■□□□ 1.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.03■■□□□ 1.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ITGB4P16144 1822 aa22.03■■□□□ 1.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CYP27B1O15528 508 aa22.01■■□□□ 1.11
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NUP188Q5SRE5 1749 aa22■■□□□ 1.11
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
GMDS-AS1-211ENST00000533653 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22■■□□□ 1.11
GMDS-AS1-211ENST00000533653 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SCN11AQ9UI33 1791 aa21.99■■□□□ 1.11
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GMDS-AS1-211ENST00000533653 APBA3O96018 575 aa21.98■■□□□ 1.11
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PHKG2P15735 406 aa21.98■■□□□ 1.11
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa21.98■■□□□ 1.11
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LY75O60449 1722 aa21.97■■□□□ 1.11
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PLSCR1O15162 318 aa21.97■■□□□ 1.11
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DEFB132Q7Z7B7 95 aa21.97■■□□□ 1.11
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HMOX1P09601 288 aa21.96■■□□□ 1.11
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CAMKK2Q96RR4 588 aa21.95■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-211ENST00000533653 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ACSBG1Q96GR2 724 aa21.94■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KCNQ2O43526 872 aa21.93■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-211ENST00000533653 C1orf141Q5JVX7 400 aa21.93■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.93■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FCHSD2O94868 740 aa21.92■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-211ENST00000533653 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-211ENST00000533653 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.92■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DCAF5Q96JK2 942 aa21.92■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MRC1P22897 1456 aa21.91■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-211ENST00000533653 AKAP4Q5JQC9 854 aa21.9■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PTF1AQ7RTS3 328 aa21.9■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GAS2L2Q8NHY3 880 aa21.9■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PAPPAQ13219 1627 aa21.89■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ERVV-2B6SEH9 535 aa21.89■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-211ENST00000533653 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PRKAR2BP31323 418 aa21.88■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ANP32CO43423 234 aa21.87■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZNF831Q5JPB2 1677 aa21.87■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TMOD3Q9NYL9 352 aa21.86■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MAP3K5Q99683 1374 aa21.86■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DLG5Q8TDM6 1919 aa21.84■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NEFMP07197 916 aa21.84■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SLC27A3Q5K4L6 730 aa21.84■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-211ENST00000533653 C5P01031 1676 aa21.84■■□□□ 1.09
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