RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515295.5

POLK-217, Transcript of DNA polymerase kappa, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene POLK, Length 1,438 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLK-217ENST00000515295 CDC14CA4D256 554 aa6.78□□□□□ -1.32
POLK-217ENST00000515295 ARHGEF15O94989 841 aa6.78□□□□□ -1.32
POLK-217ENST00000515295 GPC1P35052 558 aa6.78□□□□□ -1.32
POLK-217ENST00000515295 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
POLK-217ENST00000515295 BANK1Q8NDB2 785 aa6.78□□□□□ -1.32
POLK-217ENST00000515295 WHAMMQ8TF30 809 aa6.78□□□□□ -1.32
POLK-217ENST00000515295 TRIM52Q96A61 297 aa6.78□□□□□ -1.32
POLK-217ENST00000515295 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa6.77□□□□□ -1.33
POLK-217ENST00000515295 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
POLK-217ENST00000515295 NR1H3Q13133 447 aa6.77□□□□□ -1.33
POLK-217ENST00000515295 GAS6Q14393 721 aa6.76□□□□□ -1.33
POLK-217ENST00000515295 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa6.76□□□□□ -1.33
POLK-217ENST00000515295 RNF20Q5VTR2 975 aa6.76□□□□□ -1.33
POLK-217ENST00000515295 MTMR14Q8NCE2 650 aa6.76□□□□□ -1.33
POLK-217ENST00000515295 A0A1W2PRU2 124 aa6.75□□□□□ -1.33
POLK-217ENST00000515295 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa6.75□□□□□ -1.33
POLK-217ENST00000515295 TRAK2O60296 914 aa6.74□□□□□ -1.33
POLK-217ENST00000515295 ADAMTS2O95450 1211 aa6.74□□□□□ -1.33
POLK-217ENST00000515295 RHOQP17081 205 aa6.74□□□□□ -1.33
POLK-217ENST00000515295 SCTRP47872 440 aa6.74□□□□□ -1.33
POLK-217ENST00000515295 RASSF7Q02833 373 aa6.74□□□□□ -1.33
POLK-217ENST00000515295 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
POLK-217ENST00000515295 SVOPQ8N4V2 548 aa6.74□□□□□ -1.33
POLK-217ENST00000515295 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
POLK-217ENST00000515295 GMCL1Q96IK5 515 aa6.74□□□□□ -1.33
POLK-217ENST00000515295 GRIP2Q9C0E4 1043 aa6.74□□□□□ -1.33
POLK-217ENST00000515295 CLN3Q13286 438 aa6.73□□□□□ -1.33
POLK-217ENST00000515295 TRIM22Q8IYM9 498 aa6.73□□□□□ -1.33
POLK-217ENST00000515295 TMEM151AQ8N4L1 468 aa6.73□□□□□ -1.33
POLK-217ENST00000515295 ZNF592Q92610 1267 aa6.73□□□□□ -1.33
POLK-217ENST00000515295 OSBPL3Q9H4L5 887 aa6.73□□□□□ -1.33
POLK-217ENST00000515295 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa6.73□□□□□ -1.33
POLK-217ENST00000515295 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa6.72□□□□□ -1.33
POLK-217ENST00000515295 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
POLK-217ENST00000515295 MEN1O00255 615 aa6.72□□□□□ -1.33
POLK-217ENST00000515295 DBN1Q16643 649 aa6.72□□□□□ -1.33
POLK-217ENST00000515295 LYPD4Q6UWN0 246 aa6.72□□□□□ -1.33
POLK-217ENST00000515295 CYP2U1Q7Z449 544 aa6.72□□□□□ -1.33
POLK-217ENST00000515295 KCTD17Q8N5Z5 321 aa6.72□□□□□ -1.33
POLK-217ENST00000515295 SNRKQ9NRH2 765 aa6.72□□□□□ -1.33
POLK-217ENST00000515295 DYRK1BQ9Y463 629 aa6.72□□□□□ -1.33
POLK-217ENST00000515295 GDF11O95390 407 aa6.71□□□□□ -1.34
POLK-217ENST00000515295 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
POLK-217ENST00000515295 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa6.71□□□□□ -1.34
POLK-217ENST00000515295 POU4F2Q12837 409 aa6.7□□□□□ -1.34
POLK-217ENST00000515295 WDR44Q5JSH3 913 aa6.7□□□□□ -1.34
POLK-217ENST00000515295 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
POLK-217ENST00000515295 TPRNQ4KMQ1 711 aa6.69□□□□□ -1.34
POLK-217ENST00000515295 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
POLK-217ENST00000515295 NBPF15Q8N660 670 aa6.69□□□□□ -1.34
POLK-217ENST00000515295 MBIPQ9NS73 344 aa6.69□□□□□ -1.34
POLK-217ENST00000515295 NLRP3Q96P20 1036 aa6.68□□□□□ -1.34
POLK-217ENST00000515295 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
POLK-217ENST00000515295 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa6.68□□□□□ -1.34
POLK-217ENST00000515295 HRH3Q9Y5N1 445 aa6.68□□□□□ -1.34
POLK-217ENST00000515295 H7C1W4 665 aa6.67□□□□□ -1.34
POLK-217ENST00000515295 GPR25O00155 361 aa6.67□□□□□ -1.34
POLK-217ENST00000515295 APBB1O00213 710 aa6.67□□□□□ -1.34
POLK-217ENST00000515295 GNRH1P01148 92 aa6.67□□□□□ -1.34
POLK-217ENST00000515295 SLC27A3Q5K4L6 730 aa6.67□□□□□ -1.34
POLK-217ENST00000515295 CEP126Q9P2H0 1117 aa6.67□□□□□ -1.34
POLK-217ENST00000515295 IL2RAP01589 272 aa6.67□□□□□ -1.34
POLK-217ENST00000515295 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa6.67□□□□□ -1.34
POLK-217ENST00000515295 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa6.67□□□□□ -1.34
POLK-217ENST00000515295 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
POLK-217ENST00000515295 IGF1RP08069 1367 aa6.66□□□□□ -1.34
POLK-217ENST00000515295 WASLO00401 505 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
POLK-217ENST00000515295 THBS1P07996 1170 aa6.66□□□□□ -1.34
POLK-217ENST00000515295 IRS1P35568 1242 aa6.66□□□□□ -1.34
POLK-217ENST00000515295 MARSP56192 900 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
POLK-217ENST00000515295 KANK3Q6NY19 840 aa6.66□□□□□ -1.34
POLK-217ENST00000515295 TAS1R3Q7RTX0 852 aa6.66□□□□□ -1.34
POLK-217ENST00000515295 PHTF2Q8N3S3 785 aa6.66□□□□□ -1.34
POLK-217ENST00000515295 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
POLK-217ENST00000515295 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
POLK-217ENST00000515295 XAGE2Q96GT9 111 aa6.66□□□□□ -1.34
POLK-217ENST00000515295 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
POLK-217ENST00000515295 F11P03951 625 aa6.65□□□□□ -1.35
POLK-217ENST00000515295 MAP3K10Q02779 954 aa6.65□□□□□ -1.35
POLK-217ENST00000515295 CENPCQ03188 943 aa6.65□□□□□ -1.35
POLK-217ENST00000515295 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
POLK-217ENST00000515295 FOXR1Q6PIV2 292 aa6.65□□□□□ -1.35
POLK-217ENST00000515295 CNKSR1Q969H4 720 aa6.65□□□□□ -1.35
POLK-217ENST00000515295 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
POLK-217ENST00000515295 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
POLK-217ENST00000515295 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa6.65□□□□□ -1.35
POLK-217ENST00000515295 CHIC2Q9UKJ5 165 aa6.65□□□□□ -1.35
POLK-217ENST00000515295 IRF5Q13568 498 aa6.64□□□□□ -1.35
POLK-217ENST00000515295 ACDQ96AP0 544 aa6.64□□□□□ -1.35
POLK-217ENST00000515295 RAB6BQ9NRW1 208 aa6.64□□□□□ -1.35
POLK-217ENST00000515295 LRRC4BQ9NT99 713 aa6.64□□□□□ -1.35
POLK-217ENST00000515295 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa6.64□□□□□ -1.35
POLK-217ENST00000515295 BCRP11274 1271 aa6.63□□□□□ -1.35
POLK-217ENST00000515295 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
POLK-217ENST00000515295 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
POLK-217ENST00000515295 ENAMQ9NRM1 1142 aa6.63□□□□□ -1.35
POLK-217ENST00000515295 MYCP01106 439 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
POLK-217ENST00000515295 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
POLK-217ENST00000515295 TSGA10IPQ3SY00 556 aa6.62□□□□□ -1.35
POLK-217ENST00000515295 TRERF1Q96PN7 1200 aa6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms