RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TATP17735 454 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 USHBP1Q8N6Y0 703 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NSD2O96028 1365 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 STK32BQ9NY57 414 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC15A2Q16348 729 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPON1Q9HCB6 807 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KNSTRNQ9Y448 316 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BTAF1O14981 1849 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NCAPD2Q15021 1401 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KIF7Q2M1P5 1343 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC27A3Q5K4L6 730 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EYA1Q99502 592 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SHANK3Q9BYB0 1731 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MORC1Q86VD1 984 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP23.04■■□□□ 1.28
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LRRC4BQ9NT99 713 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CYP27B1O15528 508 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPG7Q9UQ90 795 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CASZ1Q86V15 1759 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PAPPAQ13219 1627 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AKT1S1Q96B36 256 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZBTB7AO95365 584 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF827Q17R98 1081 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MTFR1LQ9H019 292 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LY75O60449 1722 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PTGER2P43116 358 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PHKG2P15735 406 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KCNQ4P56696 695 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PIGBQ92521 554 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SGIP1Q9BQI5 828 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IL13P35225 146 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PALLDQ8WX93 1383 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MTHFSP49914 203 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ITGB4P16144 1822 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
HOXC-AS3-202ENST00000513165 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DCAF5Q96JK2 942 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KDRP35968 1356 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARXQ96QS3 562 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SIK1P57059 783 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SYT17Q9BSW7 474 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
HOXC-AS3-202ENST00000513165 POLD1P28340 1107 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXC-AS3-202ENST00000513165 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ATG3Q9NT62 314 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C5P01031 1676 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MSH5O43196 834 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CABP4P57796 275 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAP3K5Q99683 1374 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ATP6V1AP38606 617 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AK7Q96M32 723 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXC-AS3-202ENST00000513165 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.72■■□□□ 1.23
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