RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513095.5

SH3BP2-226, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP2, Length 609 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-226ENST00000513095 PPP2R1AP30153 589 aa19.13■□□□□ 0.65
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SH3BP2-226ENST00000513095 PARD3Q8TEW0 1356 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP2-226ENST00000513095 DEFB132Q7Z7B7 95 aa19.12■□□□□ 0.65
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SH3BP2-226ENST00000513095 PKD1L3Q7Z443 1732 aa19.1■□□□□ 0.65
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SH3BP2-226ENST00000513095 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa19.07■□□□□ 0.64
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SH3BP2-226ENST00000513095 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa18.98■□□□□ 0.63
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SH3BP2-226ENST00000513095 PALLDQ8WX93 1383 aa18.84■□□□□ 0.61
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SH3BP2-226ENST00000513095 SLC27A3Q5K4L6 730 aa18.84■□□□□ 0.61
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SH3BP2-226ENST00000513095 ASAP1Q9ULH1 1129 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP2-226ENST00000513095 PAPPAQ13219 1627 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP2-226ENST00000513095 PLEKHF1Q96S99 279 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP2-226ENST00000513095 ATG3Q9NT62 314 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP2-226ENST00000513095 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
SH3BP2-226ENST00000513095 SLC52A2Q9HAB3 445 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP2-226ENST00000513095 MRC1P22897 1456 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP2-226ENST00000513095 IL17REQ8NFR9 667 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP2-226ENST00000513095 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
SH3BP2-226ENST00000513095 STK32BQ9NY57 414 aa18.8■□□□□ 0.6
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