RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506932.1

SH3BP2-211, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP2, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-211ENST00000506932 NBPF14Q5TI25 921 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2-211ENST00000506932 TXNRD1Q16881 649 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-211ENST00000506932 PANK3Q9H999 370 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-211ENST00000506932 KAT6BQ8WYB5 2073 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-211ENST00000506932 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-211ENST00000506932 CASZ1Q86V15 1759 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-211ENST00000506932 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-211ENST00000506932 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-211ENST00000506932 PAPPAQ13219 1627 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-211ENST00000506932 POLKQ9UBT6 870 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-211ENST00000506932 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-211ENST00000506932 NCAPD2Q15021 1401 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-211ENST00000506932 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-211ENST00000506932 NSD2O96028 1365 aa21.58■■□□□ 1.04
SH3BP2-211ENST00000506932 PKD1L3Q7Z443 1732 aa21.58■■□□□ 1.04
SH3BP2-211ENST00000506932 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-211ENST00000506932 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-211ENST00000506932 TATP17735 454 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-211ENST00000506932 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-211ENST00000506932 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-211ENST00000506932 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-211ENST00000506932 LRRC4BQ9NT99 713 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-211ENST00000506932 LY75O60449 1722 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-211ENST00000506932 EYA1Q99502 592 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-211ENST00000506932 STK32BQ9NY57 414 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-211ENST00000506932 SLC15A2Q16348 729 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-211ENST00000506932 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa21.52■■□□□ 1.03
SH3BP2-211ENST00000506932 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa21.52■■□□□ 1.03
SH3BP2-211ENST00000506932 CYP27B1O15528 508 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-211ENST00000506932 KCNQ4P56696 695 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-211ENST00000506932 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-211ENST00000506932 ZNF827Q17R98 1081 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-211ENST00000506932 ZBTB7AO95365 584 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP2-211ENST00000506932 SPON1Q9HCB6 807 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP2-211ENST00000506932 ITGB4P16144 1822 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP2-211ENST00000506932 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP2-211ENST00000506932 MORC1Q86VD1 984 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP2-211ENST00000506932 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP2-211ENST00000506932 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SH3BP2-211ENST00000506932 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-211ENST00000506932 IGSF1Q8N6C5 1336 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-211ENST00000506932 QSER1Q2KHR3 1735 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-211ENST00000506932 SLC27A3Q5K4L6 730 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-211ENST00000506932 AKT1S1Q96B36 256 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-211ENST00000506932 PTGER2P43116 358 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-211ENST00000506932 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-211ENST00000506932 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-211ENST00000506932 SPG7Q9UQ90 795 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-211ENST00000506932 C5P01031 1676 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-211ENST00000506932 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-211ENST00000506932 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-211ENST00000506932 AEBP1Q8IUX7 1158 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-211ENST00000506932 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-211ENST00000506932 TAF1LQ8IZX4 1826 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-211ENST00000506932 PALLDQ8WX93 1383 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-211ENST00000506932 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-211ENST00000506932 PHKG2P15735 406 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-211ENST00000506932 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-211ENST00000506932 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP21.38■■□□□ 1.01
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SH3BP2-211ENST00000506932 SGIP1Q9BQI5 828 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-211ENST00000506932 IFNL2Q8IZJ0 200 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-211ENST00000506932 IL13P35225 146 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-211ENST00000506932 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-211ENST00000506932 MTHFSP49914 203 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-211ENST00000506932 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa21.33■■□□□ 1
SH3BP2-211ENST00000506932 COL24A1Q17RW2 1714 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP2-211ENST00000506932 C4BP0C0L5 1744 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP2-211ENST00000506932 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
SH3BP2-211ENST00000506932 SULT6B1Q6IMI4 303 aa21.31■■□□□ 1
SH3BP2-211ENST00000506932 TMOD3Q9NYL9 352 aa21.31■■□□□ 1
SH3BP2-211ENST00000506932 KDRP35968 1356 aa21.31■■□□□ 1
SH3BP2-211ENST00000506932 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
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SH3BP2-211ENST00000506932 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
SH3BP2-211ENST00000506932 ASAP1Q9ULH1 1129 aa21.29■■□□□ 1
SH3BP2-211ENST00000506932 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
SH3BP2-211ENST00000506932 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa21.28■■□□□ 1
SH3BP2-211ENST00000506932 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
SH3BP2-211ENST00000506932 AMIGO3Q86WK7 504 aa21.27■■□□□ 1
SH3BP2-211ENST00000506932 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
SH3BP2-211ENST00000506932 UBR3Q6ZT12 1888 aa21.26■□□□□ 0.99
SH3BP2-211ENST00000506932 SMIM5Q71RC9 77 aa21.26■□□□□ 0.99
SH3BP2-211ENST00000506932 ARXQ96QS3 562 aa21.26■□□□□ 0.99
SH3BP2-211ENST00000506932 ATG3Q9NT62 314 aa21.26■□□□□ 0.99
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SH3BP2-211ENST00000506932 SIK1P57059 783 aa21.25■□□□□ 0.99
SH3BP2-211ENST00000506932 AMOTQ4VCS5 1084 aa21.25■□□□□ 0.99
SH3BP2-211ENST00000506932 LINC00116Q8NCU8 138 aa21.25■□□□□ 0.99
SH3BP2-211ENST00000506932 SLC16A10Q8TF71 515 aa21.25■□□□□ 0.99
SH3BP2-211ENST00000506932 DCAF5Q96JK2 942 aa21.25■□□□□ 0.99
SH3BP2-211ENST00000506932 SYT17Q9BSW7 474 aa21.25■□□□□ 0.99
SH3BP2-211ENST00000506932 MSH5O43196 834 aa21.24■□□□□ 0.99
SH3BP2-211ENST00000506932 ITPK1Q13572 414 aa21.24■□□□□ 0.99
SH3BP2-211ENST00000506932 SCN11AQ9UI33 1791 aa21.23■□□□□ 0.99
SH3BP2-211ENST00000506932 MSL1Q68DK7 614 aa21.23■□□□□ 0.99
SH3BP2-211ENST00000506932 ERVV-2B6SEH9 535 aa21.22■□□□□ 0.99
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