RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496465.1

TM2D1-211, Transcript of TM2 domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene TM2D1, Length 577 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D1-211ENST00000496465 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
TM2D1-211ENST00000496465 DOT1LQ8TEK3 1739 aa25.19■■□□□ 1.62
TM2D1-211ENST00000496465 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.18■■□□□ 1.62
TM2D1-211ENST00000496465 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25.18■■□□□ 1.62
TM2D1-211ENST00000496465 PAPPAQ13219 1627 aa25.17■■□□□ 1.62
TM2D1-211ENST00000496465 USHBP1Q8N6Y0 703 aa25.17■■□□□ 1.62
TM2D1-211ENST00000496465 SPON1Q9HCB6 807 aa25.17■■□□□ 1.62
TM2D1-211ENST00000496465 SLC15A2Q16348 729 aa25.15■■□□□ 1.62
TM2D1-211ENST00000496465 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa25.15■■□□□ 1.62
TM2D1-211ENST00000496465 STK32BQ9NY57 414 aa25.15■■□□□ 1.62
TM2D1-211ENST00000496465 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.13■■□□□ 1.61
TM2D1-211ENST00000496465 NCAPD2Q15021 1401 aa25.12■■□□□ 1.61
TM2D1-211ENST00000496465 LY75O60449 1722 aa25.12■■□□□ 1.61
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TM2D1-211ENST00000496465 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
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TM2D1-211ENST00000496465 POLKQ9UBT6 870 aa25.11■■□□□ 1.61
TM2D1-211ENST00000496465 PKD1L3Q7Z443 1732 aa25.11■■□□□ 1.61
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TM2D1-211ENST00000496465 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.08■■□□□ 1.61
TM2D1-211ENST00000496465 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
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TM2D1-211ENST00000496465 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.08■■□□□ 1.6
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TM2D1-211ENST00000496465 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
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TM2D1-211ENST00000496465 ITGB4P16144 1822 aa25.04■■□□□ 1.6
TM2D1-211ENST00000496465 CYP27B1O15528 508 aa25.02■■□□□ 1.6
TM2D1-211ENST00000496465 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
TM2D1-211ENST00000496465 ZNF827Q17R98 1081 aa25.02■■□□□ 1.6
TM2D1-211ENST00000496465 AKT1S1Q96B36 256 aa25.02■■□□□ 1.6
TM2D1-211ENST00000496465 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.01■■□□□ 1.59
TM2D1-211ENST00000496465 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa25.01■■□□□ 1.59
TM2D1-211ENST00000496465 PTGER2P43116 358 aa25.01■■□□□ 1.59
TM2D1-211ENST00000496465 MTFR1LQ9H019 292 aa25■■□□□ 1.59
TM2D1-211ENST00000496465 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
TM2D1-211ENST00000496465 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP24.99■■□□□ 1.59
TM2D1-211ENST00000496465 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
TM2D1-211ENST00000496465 SPG7Q9UQ90 795 aa24.98■■□□□ 1.59
TM2D1-211ENST00000496465 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.97■■□□□ 1.59
TM2D1-211ENST00000496465 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
TM2D1-211ENST00000496465 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa24.96■■□□□ 1.59
TM2D1-211ENST00000496465 KCNQ4P56696 695 aa24.96■■□□□ 1.59
TM2D1-211ENST00000496465 SGIP1Q9BQI5 828 aa24.96■■□□□ 1.59
TM2D1-211ENST00000496465 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.96■■□□□ 1.59
TM2D1-211ENST00000496465 TAF1LQ8IZX4 1826 aa24.96■■□□□ 1.59
TM2D1-211ENST00000496465 COL24A1Q17RW2 1714 aa24.95■■□□□ 1.59
TM2D1-211ENST00000496465 MORC1Q86VD1 984 aa24.95■■□□□ 1.58
TM2D1-211ENST00000496465 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
TM2D1-211ENST00000496465 C5P01031 1676 aa24.94■■□□□ 1.58
TM2D1-211ENST00000496465 IGSF1Q8N6C5 1336 aa24.93■■□□□ 1.58
TM2D1-211ENST00000496465 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa24.92■■□□□ 1.58
TM2D1-211ENST00000496465 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa24.92■■□□□ 1.58
TM2D1-211ENST00000496465 SLC16A10Q8TF71 515 aa24.92■■□□□ 1.58
TM2D1-211ENST00000496465 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
TM2D1-211ENST00000496465 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa24.91■■□□□ 1.58
TM2D1-211ENST00000496465 PALLDQ8WX93 1383 aa24.9■■□□□ 1.58
TM2D1-211ENST00000496465 IFNL2Q8IZJ0 200 aa24.89■■□□□ 1.58
TM2D1-211ENST00000496465 PHKG2P15735 406 aa24.88■■□□□ 1.57
TM2D1-211ENST00000496465 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
TM2D1-211ENST00000496465 PIGBQ92521 554 aa24.88■■□□□ 1.57
TM2D1-211ENST00000496465 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
TM2D1-211ENST00000496465 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
TM2D1-211ENST00000496465 ARXQ96QS3 562 aa24.86■■□□□ 1.57
TM2D1-211ENST00000496465 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
TM2D1-211ENST00000496465 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.84■■□□□ 1.57
TM2D1-211ENST00000496465 SYT17Q9BSW7 474 aa24.84■■□□□ 1.57
TM2D1-211ENST00000496465 MAP3K5Q99683 1374 aa24.83■■□□□ 1.57
TM2D1-211ENST00000496465 C4BP0C0L5 1744 aa24.83■■□□□ 1.57
TM2D1-211ENST00000496465 TMOD3Q9NYL9 352 aa24.82■■□□□ 1.56
TM2D1-211ENST00000496465 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
TM2D1-211ENST00000496465 UBR3Q6ZT12 1888 aa24.81■■□□□ 1.56
TM2D1-211ENST00000496465 IL13P35225 146 aa24.8■■□□□ 1.56
TM2D1-211ENST00000496465 AMOTQ4VCS5 1084 aa24.8■■□□□ 1.56
TM2D1-211ENST00000496465 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
TM2D1-211ENST00000496465 KDRP35968 1356 aa24.8■■□□□ 1.56
TM2D1-211ENST00000496465 POLD1P28340 1107 aa24.79■■□□□ 1.56
TM2D1-211ENST00000496465 AEBP1Q8IUX7 1158 aa24.79■■□□□ 1.56
TM2D1-211ENST00000496465 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
TM2D1-211ENST00000496465 ASAP1Q9ULH1 1129 aa24.78■■□□□ 1.56
TM2D1-211ENST00000496465 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa24.77■■□□□ 1.56
TM2D1-211ENST00000496465 ERVV-2B6SEH9 535 aa24.77■■□□□ 1.56
TM2D1-211ENST00000496465 SIK1P57059 783 aa24.77■■□□□ 1.56
TM2D1-211ENST00000496465 SULT6B1Q6IMI4 303 aa24.77■■□□□ 1.56
TM2D1-211ENST00000496465 FLAD1Q8NFF5 587 aa24.77■■□□□ 1.56
TM2D1-211ENST00000496465 DCAF5Q96JK2 942 aa24.77■■□□□ 1.56
TM2D1-211ENST00000496465 ZNF831Q5JPB2 1677 aa24.77■■□□□ 1.56
TM2D1-211ENST00000496465 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa24.77■■□□□ 1.56
TM2D1-211ENST00000496465 MTHFSP49914 203 aa24.76■■□□□ 1.55
TM2D1-211ENST00000496465 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
TM2D1-211ENST00000496465 MSH5O43196 834 aa24.75■■□□□ 1.55
TM2D1-211ENST00000496465 ATG3Q9NT62 314 aa24.75■■□□□ 1.55
TM2D1-211ENST00000496465 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
TM2D1-211ENST00000496465 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
TM2D1-211ENST00000496465 AK7Q96M32 723 aa24.73■■□□□ 1.55
TM2D1-211ENST00000496465 SCN11AQ9UI33 1791 aa24.72■■□□□ 1.55
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