RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492545.1

CTDSP1-211, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 634 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-211ENST00000492545 NHSQ6T4R5 1651 aa32.46■■■□□ 2.79
CTDSP1-211ENST00000492545 MEGF6O75095 1541 aa32.46■■■□□ 2.79
CTDSP1-211ENST00000492545 USHBP1Q8N6Y0 703 aa32.46■■■□□ 2.79
CTDSP1-211ENST00000492545 KNSTRNQ9Y448 316 aa32.45■■■□□ 2.79
CTDSP1-211ENST00000492545 RGPD2P0DJD1 1756 aa32.43■■■□□ 2.78
CTDSP1-211ENST00000492545 KIF7Q2M1P5 1343 aa32.43■■■□□ 2.78
CTDSP1-211ENST00000492545 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP32.41■■■□□ 2.78
CTDSP1-211ENST00000492545 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa32.4■■■□□ 2.78
CTDSP1-211ENST00000492545 KAT6BQ8WYB5 2073 aa32.39■■■□□ 2.78
CTDSP1-211ENST00000492545 MORC1Q86VD1 984 aa32.39■■■□□ 2.78
CTDSP1-211ENST00000492545 STK32BQ9NY57 414 aa32.39■■■□□ 2.78
CTDSP1-211ENST00000492545 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP32.38■■■□□ 2.77
CTDSP1-211ENST00000492545 NCAPD2Q15021 1401 aa32.38■■■□□ 2.77
CTDSP1-211ENST00000492545 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa32.38■■■□□ 2.77
CTDSP1-211ENST00000492545 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa32.38■■■□□ 2.77
CTDSP1-211ENST00000492545 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP32.38■■■□□ 2.77
CTDSP1-211ENST00000492545 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP32.38■■■□□ 2.77
CTDSP1-211ENST00000492545 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP32.36■■■□□ 2.77
CTDSP1-211ENST00000492545 EYA1Q99502 592 aa32.36■■■□□ 2.77
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC15A2Q16348 729 aa32.34■■■□□ 2.77
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC27A3Q5K4L6 730 aa32.34■■■□□ 2.77
CTDSP1-211ENST00000492545 SPON1Q9HCB6 807 aa32.34■■■□□ 2.77
CTDSP1-211ENST00000492545 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP32.34■■■□□ 2.77
CTDSP1-211ENST00000492545 SPG7Q9UQ90 795 aa32.33■■■□□ 2.77
CTDSP1-211ENST00000492545 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP32.32■■■□□ 2.76
CTDSP1-211ENST00000492545 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP32.32■■■□□ 2.76
CTDSP1-211ENST00000492545 BTAF1O14981 1849 aa32.32■■■□□ 2.76
CTDSP1-211ENST00000492545 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa32.31■■■□□ 2.76
CTDSP1-211ENST00000492545 SHANK3Q9BYB0 1731 aa32.29■■■□□ 2.76
CTDSP1-211ENST00000492545 CYP27B1O15528 508 aa32.28■■■□□ 2.76
CTDSP1-211ENST00000492545 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP32.27■■■□□ 2.76
CTDSP1-211ENST00000492545 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP32.26■■■□□ 2.75
CTDSP1-211ENST00000492545 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP32.26■■■□□ 2.75
CTDSP1-211ENST00000492545 LRRC4BQ9NT99 713 aa32.26■■■□□ 2.75
CTDSP1-211ENST00000492545 IGSF1Q8N6C5 1336 aa32.24■■■□□ 2.75
CTDSP1-211ENST00000492545 DOT1LQ8TEK3 1739 aa32.22■■■□□ 2.75
CTDSP1-211ENST00000492545 IFNL2Q8IZJ0 200 aa32.19■■■□□ 2.74
CTDSP1-211ENST00000492545 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP32.19■■■□□ 2.74
CTDSP1-211ENST00000492545 PKD1L3Q7Z443 1732 aa32.19■■■□□ 2.74
CTDSP1-211ENST00000492545 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP32.18■■■□□ 2.74
CTDSP1-211ENST00000492545 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa32.17■■■□□ 2.74
CTDSP1-211ENST00000492545 AKT1S1Q96B36 256 aa32.17■■■□□ 2.74
CTDSP1-211ENST00000492545 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP32.17■■■□□ 2.74
CTDSP1-211ENST00000492545 PAPPAQ13219 1627 aa32.17■■■□□ 2.74
CTDSP1-211ENST00000492545 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa32.17■■■□□ 2.74
CTDSP1-211ENST00000492545 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP32.16■■■□□ 2.74
CTDSP1-211ENST00000492545 MTFR1LQ9H019 292 aa32.16■■■□□ 2.74
CTDSP1-211ENST00000492545 CASZ1Q86V15 1759 aa32.16■■■□□ 2.74
CTDSP1-211ENST00000492545 ZBTB7AO95365 584 aa32.15■■■□□ 2.74
CTDSP1-211ENST00000492545 PHKG2P15735 406 aa32.15■■■□□ 2.74
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF827Q17R98 1081 aa32.15■■■□□ 2.74
CTDSP1-211ENST00000492545 AMOTQ4VCS5 1084 aa32.14■■■□□ 2.74
CTDSP1-211ENST00000492545 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP32.14■■■□□ 2.74
CTDSP1-211ENST00000492545 IL13P35225 146 aa32.12■■■□□ 2.73
CTDSP1-211ENST00000492545 MTHFSP49914 203 aa32.12■■■□□ 2.73
CTDSP1-211ENST00000492545 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP32.11■■■□□ 2.73
CTDSP1-211ENST00000492545 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP32.11■■■□□ 2.73
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC16A10Q8TF71 515 aa32.11■■■□□ 2.73
CTDSP1-211ENST00000492545 LY75O60449 1722 aa32.1■■■□□ 2.73
CTDSP1-211ENST00000492545 PIGBQ92521 554 aa32.1■■■□□ 2.73
CTDSP1-211ENST00000492545 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa32.1■■■□□ 2.73
CTDSP1-211ENST00000492545 PTGER2P43116 358 aa32.09■■■□□ 2.73
CTDSP1-211ENST00000492545 KCNQ4P56696 695 aa32.09■■■□□ 2.73
CTDSP1-211ENST00000492545 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP32.09■■■□□ 2.73
CTDSP1-211ENST00000492545 PALLDQ8WX93 1383 aa32.08■■■□□ 2.73
CTDSP1-211ENST00000492545 TMOD3Q9NYL9 352 aa32.08■■■□□ 2.73
CTDSP1-211ENST00000492545 SULT6B1Q6IMI4 303 aa32.07■■■□□ 2.72
CTDSP1-211ENST00000492545 KDRP35968 1356 aa32.07■■■□□ 2.72
CTDSP1-211ENST00000492545 DCAF5Q96JK2 942 aa32.05■■■□□ 2.72
CTDSP1-211ENST00000492545 ERVV-2B6SEH9 535 aa32.04■■■□□ 2.72
CTDSP1-211ENST00000492545 AEBP1Q8IUX7 1158 aa32.04■■■□□ 2.72
CTDSP1-211ENST00000492545 SGIP1Q9BQI5 828 aa32.03■■■□□ 2.72
CTDSP1-211ENST00000492545 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa32.02■■■□□ 2.72
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP32.02■■■□□ 2.72
CTDSP1-211ENST00000492545 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa32■■■□□ 2.71
CTDSP1-211ENST00000492545 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP32■■■□□ 2.71
CTDSP1-211ENST00000492545 C1orf141Q5JVX7 400 aa32■■■□□ 2.71
CTDSP1-211ENST00000492545 ITGB4P16144 1822 aa31.99■■■□□ 2.71
CTDSP1-211ENST00000492545 FLAD1Q8NFF5 587 aa31.99■■■□□ 2.71
CTDSP1-211ENST00000492545 QSER1Q2KHR3 1735 aa31.98■■■□□ 2.71
CTDSP1-211ENST00000492545 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa31.97■■■□□ 2.71
CTDSP1-211ENST00000492545 DCAF8L1A6NGE4 600 aa31.97■■■□□ 2.71
CTDSP1-211ENST00000492545 SIK1P57059 783 aa31.97■■■□□ 2.71
CTDSP1-211ENST00000492545 ARXQ96QS3 562 aa31.96■■■□□ 2.71
CTDSP1-211ENST00000492545 ASAP1Q9ULH1 1129 aa31.96■■■□□ 2.71
CTDSP1-211ENST00000492545 POLD1P28340 1107 aa31.94■■■□□ 2.7
CTDSP1-211ENST00000492545 ATG3Q9NT62 314 aa31.94■■■□□ 2.7
CTDSP1-211ENST00000492545 CABP4P57796 275 aa31.93■■■□□ 2.7
CTDSP1-211ENST00000492545 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP31.91■■■□□ 2.7
CTDSP1-211ENST00000492545 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP31.9■■■□□ 2.7
CTDSP1-211ENST00000492545 AKAP4Q5JQC9 854 aa31.9■■■□□ 2.7
CTDSP1-211ENST00000492545 AK7Q96M32 723 aa31.9■■■□□ 2.7
CTDSP1-211ENST00000492545 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP31.9■■■□□ 2.7
CTDSP1-211ENST00000492545 MSH5O43196 834 aa31.89■■■□□ 2.7
CTDSP1-211ENST00000492545 HMOX1P09601 288 aa31.89■■■□□ 2.7
CTDSP1-211ENST00000492545 SYT17Q9BSW7 474 aa31.89■■■□□ 2.7
CTDSP1-211ENST00000492545 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP31.89■■■□□ 2.7
CTDSP1-211ENST00000492545 ATP6V1AP38606 617 aa31.88■■■□□ 2.69
CTDSP1-211ENST00000492545 C5P01031 1676 aa31.88■■■□□ 2.69
CTDSP1-211ENST00000492545 MAP3K5Q99683 1374 aa31.87■■■□□ 2.69
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