RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-211ENST00000489450 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-211ENST00000489450 ERVK-9P63128 1117 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-211ENST00000489450 USP4Q13107 963 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-211ENST00000489450 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-211ENST00000489450 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-211ENST00000489450 ARXQ96QS3 562 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-211ENST00000489450 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa6.22□□□□□ -1.41
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RABGGTB-211ENST00000489450 USP17L10C9JJH3 530 aa6.21□□□□□ -1.42
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RABGGTB-211ENST00000489450 USP17L18D6R9N7 530 aa6.21□□□□□ -1.42
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RABGGTB-211ENST00000489450 ITPKCQ96DU7 683 aa6.21□□□□□ -1.42
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RABGGTB-211ENST00000489450 KIAA1024Q9UPX6 916 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-211ENST00000489450 AXIN1O15169 862 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-211ENST00000489450 ATG7O95352 703 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-211ENST00000489450 TIMP2P16035 220 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-211ENST00000489450 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-211ENST00000489450 CBLBQ13191 982 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-211ENST00000489450 CTC1Q2NKJ3 1217 aa6.2□□□□□ -1.42
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RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-211ENST00000489450 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-211ENST00000489450 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-211ENST00000489450 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-211ENST00000489450 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-211ENST00000489450 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM196BA6NMK8 535 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-211ENST00000489450 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-211ENST00000489450 ATP1A2P50993 1020 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-211ENST00000489450 PSME1Q06323 249 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-211ENST00000489450 PTK7Q13308 1070 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-211ENST00000489450 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-211ENST00000489450 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa6.19□□□□□ -1.42
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RABGGTB-211ENST00000489450 STAU1O95793 577 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-211ENST00000489450 STK32AQ8WU08 396 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-211ENST00000489450 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-211ENST00000489450 DKK1O94907 266 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-211ENST00000489450 DPYDQ12882 1025 aa6.17□□□□□ -1.42
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RABGGTB-211ENST00000489450 CCDC102BQ68D86 513 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-211ENST00000489450 CYP2U1Q7Z449 544 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-211ENST00000489450 ANKMY2Q8IV38 441 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-211ENST00000489450 LARGE2Q8N3Y3 721 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-211ENST00000489450 TPCN2Q8NHX9 752 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-211ENST00000489450 TRIM52Q96A61 297 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-211ENST00000489450 WFS1O76024 890 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-211ENST00000489450 ADH1AP07327 375 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-211ENST00000489450 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-211ENST00000489450 Q6ZVU0 165 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-211ENST00000489450 SIX5Q8N196 739 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-211ENST00000489450 AGBL1Q96MI9 1066 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-211ENST00000489450 RAB6BQ9NRW1 208 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-211ENST00000489450 SFI1A8K8P3 1242 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM229AB2RXF0 380 aa6.15□□□□□ -1.42
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RABGGTB-211ENST00000489450 RELBQ01201 579 aa6.15□□□□□ -1.42
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RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM164Q5U3C3 297 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-211ENST00000489450 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-211ENST00000489450 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM200AQ8TCP9 573 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-211ENST00000489450 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM88BA6NKF7 163 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-211ENST00000489450 GNRH1P01148 92 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-211ENST00000489450 GDF10P55107 478 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-211ENST00000489450 MEIOBQ8N635 442 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-211ENST00000489450 ETNK1Q9HBU6 452 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-211ENST00000489450 LGR5O75473 907 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-211ENST00000489450 IL2RAP01589 272 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-211ENST00000489450 PTGIRP43119 386 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-211ENST00000489450 SEC13P55735 322 aa6.13□□□□□ -1.43
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