RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482597.5

PTPRVP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRVP, Length 3,999 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-201ENST00000482597 ANO2Q9NQ90 1003 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 NPHP3Q7Z494 1330 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 FLT4P35916 1363 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 FLIIQ13045 1269 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 CCDC27Q2M243 656 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 NBPF6Q5VWK0 638 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 NBPF4Q96M43 638 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 KIF1BO60333 1816 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 ALDH1L2Q3SY69 923 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 CHD1LQ86WJ1 897 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 GPATCH3Q96I76 525 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 LGR6Q9HBX8 967 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 CEP152O94986 1710 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 C22orf23Q9BZE7 217 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 PI4KAP2A4QPH2 592 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 GOLGA6L22H0YM25 854 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 CCT4P50991 539 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 AMOTQ4VCS5 1084 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 MEIS3Q99687 375 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 RNF123Q5XPI4 1314 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 IP6K1Q92551 441 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 TSHZ3Q63HK5 1081 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 G2E3Q7L622 706 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRVP-201ENST00000482597 AAMPQ13685 434 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 CHPF2Q9P2E5 772 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 ABCA6Q8N139 1617 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 IL16Q14005 1332 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 NUTM1Q86Y26 1132 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 GCC1Q96CN9 775 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 IFNL2Q8IZJ0 200 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 SIRT1Q96EB6 747 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 NGLY1Q96IV0 654 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 ZBTB3Q9H5J0 574 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 TMEM94Q12767 1356 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 MYD88Q99836 296 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 SLAIN2Q9P270 581 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 PLEKHF1Q96S99 279 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 MADDQ8WXG6 1647 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 UBAP1LF5GYI3 381 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 LRRCC1Q9C099 1032 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 DNAAF4Q8WXU2 420 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 TMOD3Q9NYL9 352 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 KCNQ3O43525 872 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 ZFYVE9O95405 1425 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 ACSBG1Q96GR2 724 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 NLRP1Q9C000 1473 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 CDC45O75419 566 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 BICDL1Q6ZP65 573 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 TOMM22Q9NS69 142 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 BRPF3Q9ULD4 1205 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 SBNO1A3KN83 1393 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 REC8O95072 547 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 GPTP24298 496 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 IL17REQ8NFR9 667 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 ADGRB3O60242 1522 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 EXOC5O00471 708 aa11.77□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 AKAP4Q5JQC9 854 aa11.77□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 BTG4Q9NY30 223 aa11.77□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 ST18O60284 1047 aa11.77□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 COPS6Q7L5N1 327 aa11.77□□□□□ -0.52
PTPRVP-201ENST00000482597 ALKQ9UM73 1620 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 CHL1O00533 1208 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF521Q96K83 1311 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 KIF6Q6ZMV9 814 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 AACSQ86V21 672 aa11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms