RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477768.1

URGCP-211, Transcript of upregulator of cell proliferation, humanhuman

TSL 4

Gene URGCP, Length 500 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URGCP-211ENST00000477768 TATP17735 454 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
URGCP-211ENST00000477768 APBA3O96018 575 aa29.26■■■□□ 2.27
URGCP-211ENST00000477768 BAG6P46379 1132 aa29.26■■■□□ 2.27
URGCP-211ENST00000477768 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
URGCP-211ENST00000477768 IL13P35225 146 aa29.24■■■□□ 2.27
URGCP-211ENST00000477768 ACSBG1Q96GR2 724 aa29.24■■■□□ 2.27
URGCP-211ENST00000477768 IGSF1Q8N6C5 1336 aa29.23■■■□□ 2.27
URGCP-211ENST00000477768 KCNQ2O43526 872 aa29.23■■■□□ 2.27
URGCP-211ENST00000477768 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
URGCP-211ENST00000477768 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
URGCP-211ENST00000477768 CAMKK2Q96RR4 588 aa29.21■■■□□ 2.27
URGCP-211ENST00000477768 AEBP1Q8IUX7 1158 aa29.19■■■□□ 2.26
URGCP-211ENST00000477768 PKD1L3Q7Z443 1732 aa29.17■■■□□ 2.26
URGCP-211ENST00000477768 NHSQ6T4R5 1651 aa29.16■■■□□ 2.26
URGCP-211ENST00000477768 CYP27B1O15528 508 aa29.16■■■□□ 2.26
URGCP-211ENST00000477768 PPP2R1AP30153 589 aa29.16■■■□□ 2.26
URGCP-211ENST00000477768 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
URGCP-211ENST00000477768 SULT6B1Q6IMI4 303 aa29.14■■■□□ 2.26
URGCP-211ENST00000477768 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
URGCP-211ENST00000477768 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa29.13■■■□□ 2.25
URGCP-211ENST00000477768 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa29.13■■■□□ 2.25
URGCP-211ENST00000477768 DOT1LQ8TEK3 1739 aa29.12■■■□□ 2.25
URGCP-211ENST00000477768 SPG7Q9UQ90 795 aa29.11■■■□□ 2.25
URGCP-211ENST00000477768 BTAF1O14981 1849 aa29.1■■■□□ 2.25
URGCP-211ENST00000477768 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
URGCP-211ENST00000477768 PARD3Q8TEW0 1356 aa29.1■■■□□ 2.25
URGCP-211ENST00000477768 PLSCR1O15162 318 aa29.09■■■□□ 2.25
URGCP-211ENST00000477768 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP29.09■■■□□ 2.25
URGCP-211ENST00000477768 RREB1Q92766 1687 aa29.09■■■□□ 2.25
URGCP-211ENST00000477768 HMOX1P09601 288 aa29.08■■■□□ 2.25
URGCP-211ENST00000477768 PROM2Q8N271 834 aa29.08■■■□□ 2.25
URGCP-211ENST00000477768 KDRP35968 1356 aa29.08■■■□□ 2.25
URGCP-211ENST00000477768 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
URGCP-211ENST00000477768 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
URGCP-211ENST00000477768 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa29.05■■■□□ 2.24
URGCP-211ENST00000477768 NUP188Q5SRE5 1749 aa29.05■■■□□ 2.24
URGCP-211ENST00000477768 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa29.05■■■□□ 2.24
URGCP-211ENST00000477768 PHKG2P15735 406 aa29.04■■■□□ 2.24
URGCP-211ENST00000477768 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
URGCP-211ENST00000477768 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
URGCP-211ENST00000477768 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
URGCP-211ENST00000477768 IFNL2Q8IZJ0 200 aa29.02■■■□□ 2.24
URGCP-211ENST00000477768 CFAP53Q96M91 514 aa29.02■■■□□ 2.24
URGCP-211ENST00000477768 ITGB4P16144 1822 aa29.01■■■□□ 2.24
URGCP-211ENST00000477768 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
URGCP-211ENST00000477768 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa29.01■■■□□ 2.23
URGCP-211ENST00000477768 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
URGCP-211ENST00000477768 TXNRD1Q16881 649 aa28.99■■■□□ 2.23
URGCP-211ENST00000477768 AMOTQ4VCS5 1084 aa28.99■■■□□ 2.23
URGCP-211ENST00000477768 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
URGCP-211ENST00000477768 RALBP1Q15311 655 aa28.97■■■□□ 2.23
URGCP-211ENST00000477768 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa28.97■■■□□ 2.23
URGCP-211ENST00000477768 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
URGCP-211ENST00000477768 PIGBQ92521 554 aa28.93■■■□□ 2.22
URGCP-211ENST00000477768 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
URGCP-211ENST00000477768 LRRC4BQ9NT99 713 aa28.92■■■□□ 2.22
URGCP-211ENST00000477768 KCNQ4P56696 695 aa28.91■■■□□ 2.22
URGCP-211ENST00000477768 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
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URGCP-211ENST00000477768 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
URGCP-211ENST00000477768 LY75O60449 1722 aa28.9■■■□□ 2.22
URGCP-211ENST00000477768 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
URGCP-211ENST00000477768 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP28.9■■■□□ 2.22
URGCP-211ENST00000477768 RSPH6AQ9H0K4 717 aa28.9■■■□□ 2.22
URGCP-211ENST00000477768 C1orf141Q5JVX7 400 aa28.89■■■□□ 2.22
URGCP-211ENST00000477768 NBPF14Q5TI25 921 aa28.89■■■□□ 2.22
URGCP-211ENST00000477768 DCAF5Q96JK2 942 aa28.89■■■□□ 2.22
URGCP-211ENST00000477768 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
URGCP-211ENST00000477768 PHACTR3Q96KR7 559 aa28.87■■■□□ 2.21
URGCP-211ENST00000477768 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa28.87■■■□□ 2.21
URGCP-211ENST00000477768 PRKAR2BP31323 418 aa28.86■■■□□ 2.21
URGCP-211ENST00000477768 AKAP4Q5JQC9 854 aa28.86■■■□□ 2.21
URGCP-211ENST00000477768 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
URGCP-211ENST00000477768 TMOD3Q9NYL9 352 aa28.86■■■□□ 2.21
URGCP-211ENST00000477768 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
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URGCP-211ENST00000477768 LGR6Q9HBX8 967 aa28.84■■■□□ 2.21
URGCP-211ENST00000477768 ASAP1Q9ULH1 1129 aa28.84■■■□□ 2.21
URGCP-211ENST00000477768 PALLDQ8WX93 1383 aa28.83■■■□□ 2.21
URGCP-211ENST00000477768 PAPPAQ13219 1627 aa28.83■■■□□ 2.21
URGCP-211ENST00000477768 SLC27A3Q5K4L6 730 aa28.82■■■□□ 2.2
URGCP-211ENST00000477768 FCHSD2O94868 740 aa28.81■■■□□ 2.2
URGCP-211ENST00000477768 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
URGCP-211ENST00000477768 CABP4P57796 275 aa28.8■■■□□ 2.2
URGCP-211ENST00000477768 ATG3Q9NT62 314 aa28.8■■■□□ 2.2
URGCP-211ENST00000477768 SLC15A2Q16348 729 aa28.79■■■□□ 2.2
URGCP-211ENST00000477768 ZNF827Q17R98 1081 aa28.79■■■□□ 2.2
URGCP-211ENST00000477768 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa28.79■■■□□ 2.2
URGCP-211ENST00000477768 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
URGCP-211ENST00000477768 STK32BQ9NY57 414 aa28.79■■■□□ 2.2
URGCP-211ENST00000477768 RNMTO43148 476 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
URGCP-211ENST00000477768 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
URGCP-211ENST00000477768 GAS2L2Q8NHY3 880 aa28.77■■■□□ 2.2
URGCP-211ENST00000477768 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa28.75■■■□□ 2.19
URGCP-211ENST00000477768 AKT1S1Q96B36 256 aa28.75■■■□□ 2.19
URGCP-211ENST00000477768 TAF1LQ8IZX4 1826 aa28.74■■■□□ 2.19
URGCP-211ENST00000477768 IL17REQ8NFR9 667 aa28.73■■■□□ 2.19
URGCP-211ENST00000477768 PLEKHF1Q96S99 279 aa28.73■■■□□ 2.19
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