RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 NSD2O96028 1365 aa15.77■□□□□ 0.12
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ACTB-209ENST00000473257 FYB1O15117 783 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-209ENST00000473257 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
ACTB-209ENST00000473257 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
ACTB-209ENST00000473257 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa15.75■□□□□ 0.11
ACTB-209ENST00000473257 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa15.75■□□□□ 0.11
ACTB-209ENST00000473257 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa15.74■□□□□ 0.11
ACTB-209ENST00000473257 USP47Q96K76 1375 aa15.74■□□□□ 0.11
ACTB-209ENST00000473257 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa15.73■□□□□ 0.11
ACTB-209ENST00000473257 SLC27A3Q5K4L6 730 aa15.73■□□□□ 0.11
ACTB-209ENST00000473257 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
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ACTB-209ENST00000473257 CARD14Q9BXL6 1004 aa15.71■□□□□ 0.11
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ACTB-209ENST00000473257 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa15.63■□□□□ 0.09
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ACTB-209ENST00000473257 PALLDQ8WX93 1383 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-209ENST00000473257 WWC3Q9ULE0 1092 aa15.62■□□□□ 0.09
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ACTB-209ENST00000473257 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa15.62■□□□□ 0.09
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ACTB-209ENST00000473257 SLC24A1O60721 1099 aa15.61■□□□□ 0.09
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ACTB-209ENST00000473257 TAF1LQ8IZX4 1826 aa15.58■□□□□ 0.08
ACTB-209ENST00000473257 LINC00116Q8NCU8 138 aa15.56■□□□□ 0.08
ACTB-209ENST00000473257 AK7Q96M32 723 aa15.56■□□□□ 0.08
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ACTB-209ENST00000473257 ASAP1Q9ULH1 1129 aa15.56■□□□□ 0.08
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ACTB-209ENST00000473257 PKD1L3Q7Z443 1732 aa15.56■□□□□ 0.08
ACTB-209ENST00000473257 NCAPD2Q15021 1401 aa15.54■□□□□ 0.08
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ACTB-209ENST00000473257 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
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ACTB-209ENST00000473257 SIK1P57059 783 aa15.52■□□□□ 0.08
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ACTB-209ENST00000473257 TMOD3Q9NYL9 352 aa15.52■□□□□ 0.08
ACTB-209ENST00000473257 UBR3Q6ZT12 1888 aa15.52■□□□□ 0.07
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ACTB-209ENST00000473257 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
ACTB-209ENST00000473257 ATG3Q9NT62 314 aa15.51■□□□□ 0.07
ACTB-209ENST00000473257 GNPATO15228 680 aa15.5■□□□□ 0.07
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ACTB-209ENST00000473257 CD2APQ9Y5K6 639 aa15.5■□□□□ 0.07
ACTB-209ENST00000473257 ATP10DQ9P241 1426 aa15.5■□□□□ 0.07
ACTB-209ENST00000473257 ATP6V1AP38606 617 aa15.49■□□□□ 0.07
ACTB-209ENST00000473257 SLC4A9Q96Q91 983 aa15.49■□□□□ 0.07
ACTB-209ENST00000473257 IGSF1Q8N6C5 1336 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-209ENST00000473257 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
ACTB-209ENST00000473257 IFNL2Q8IZJ0 200 aa15.48■□□□□ 0.07
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