RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460297.1

NME4-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 5

Gene NME4, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-209ENST00000460297 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP31.77■■■□□ 2.68
NME4-209ENST00000460297 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP31.77■■■□□ 2.68
NME4-209ENST00000460297 AMOTQ4VCS5 1084 aa31.76■■■□□ 2.68
NME4-209ENST00000460297 LMOD3Q0VAK6 560 aa31.76■■■□□ 2.67
NME4-209ENST00000460297 USP35Q9P2H5 1018 aa31.76■■■□□ 2.67
NME4-209ENST00000460297 PKD1L3Q7Z443 1732 aa31.75■■■□□ 2.67
NME4-209ENST00000460297 BCL9LQ86UU0 1499 aa31.75■■■□□ 2.67
NME4-209ENST00000460297 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP31.75■■■□□ 2.67
NME4-209ENST00000460297 FBXO41Q8TF61 875 aa31.75■■■□□ 2.67
NME4-209ENST00000460297 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa31.75■■■□□ 2.67
NME4-209ENST00000460297 SLFN5Q08AF3 891 aa31.74■■■□□ 2.67
NME4-209ENST00000460297 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP31.74■■■□□ 2.67
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NME4-209ENST00000460297 DCTN1Q14203 1278 aa31.73■■■□□ 2.67
NME4-209ENST00000460297 UNC5CLQ8IV45 518 aa31.73■■■□□ 2.67
NME4-209ENST00000460297 MAP3K5Q99683 1374 aa31.72■■■□□ 2.67
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NME4-209ENST00000460297 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP31.72■■■□□ 2.67
NME4-209ENST00000460297 GNAT3A8MTJ3 354 aa31.71■■■□□ 2.67
NME4-209ENST00000460297 IL2RBP14784 551 aa31.71■■■□□ 2.67
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NME4-209ENST00000460297 WNK3Q9BYP7 1800 aa31.7■■■□□ 2.67
NME4-209ENST00000460297 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP31.7■■■□□ 2.66
NME4-209ENST00000460297 E9PSI1 815 aa31.7■■■□□ 2.66
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NME4-209ENST00000460297 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa31.69■■■□□ 2.66
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NME4-209ENST00000460297 IL16Q14005 1332 aa31.68■■■□□ 2.66
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NME4-209ENST00000460297 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa31.67■■■□□ 2.66
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NME4-209ENST00000460297 LRRC37A3O60309 1634 aa31.65■■■□□ 2.66
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NME4-209ENST00000460297 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa31.6■■■□□ 2.65
NME4-209ENST00000460297 ZNF853P0CG23 659 aa31.6■■■□□ 2.65
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NME4-209ENST00000460297 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa31.59■■■□□ 2.65
NME4-209ENST00000460297 IFNL2Q8IZJ0 200 aa31.59■■■□□ 2.65
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NME4-209ENST00000460297 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa31.57■■■□□ 2.64
NME4-209ENST00000460297 GNAI1P63096 354 aa31.57■■■□□ 2.64
NME4-209ENST00000460297 BARGINQ6ZT62 677 aa31.56■■■□□ 2.64
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NME4-209ENST00000460297 CHL1O00533 1208 aa31.52■■■□□ 2.64
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NME4-209ENST00000460297 GLI3P10071 1580 aa31.51■■■□□ 2.63
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NME4-209ENST00000460297 EXOC5O00471 708 aa31.49■■■□□ 2.63
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NME4-209ENST00000460297 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP31.47■■■□□ 2.63
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NME4-209ENST00000460297 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP31.43■■■□□ 2.62
NME4-209ENST00000460297 KDM3BQ7LBC6 1761 aa31.42■■■□□ 2.62
NME4-209ENST00000460297 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa31.42■■■□□ 2.62
NME4-209ENST00000460297 BABAM1Q9NWV8 329 aa31.42■■■□□ 2.62
NME4-209ENST00000460297 SLC52A2Q9HAB3 445 aa31.41■■■□□ 2.62
NME4-209ENST00000460297 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP31.41■■■□□ 2.62
NME4-209ENST00000460297 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa31.38■■■□□ 2.61
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