RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455157.6

SSUH2-208, Transcript of ssu-2 homolog (C. elegans), human

TSL 2

Gene SSUH2, Length 3,219 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSUH2-208	ENST00000455157	IFT57	Q9NWB7	429 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SSUH2-208	ENST00000455157	SHPRH	Q149N8	1683 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SSUH2-208	ENST00000455157	TTC22	Q5TAA0	569 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SSUH2-208	ENST00000455157	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
SSUH2-208	ENST00000455157	ATP2B3	Q16720	1220 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SSUH2-208	ENST00000455157	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SSUH2-208	ENST00000455157	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
SSUH2-208	ENST00000455157	SDS	P20132	328 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SSUH2-208	ENST00000455157	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SSUH2-208	ENST00000455157	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SSUH2-208	ENST00000455157	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
SSUH2-208	ENST00000455157	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
SSUH2-208	ENST00000455157	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SSUH2-208	ENST00000455157	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SSUH2-208	ENST00000455157	NECTIN2	Q92692	538 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SSUH2-208	ENST00000455157	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SSUH2-208	ENST00000455157	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SSUH2-208	ENST00000455157	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SSUH2-208	ENST00000455157	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SSUH2-208	ENST00000455157	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SSUH2-208	ENST00000455157	HMMR	O75330	724 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SSUH2-208	ENST00000455157	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	13.8	□□□□□ -0.2
SSUH2-208	ENST00000455157	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
SSUH2-208	ENST00000455157	MCM5	P33992	734 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SSUH2-208	ENST00000455157	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
SSUH2-208	ENST00000455157	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SSUH2-208	ENST00000455157	MCM10	Q7L590	875 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SSUH2-208	ENST00000455157	RBSN	Q9H1K0	784 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SSUH2-208	ENST00000455157	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SSUH2-208	ENST00000455157	USP26	Q9BXU7	913 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC4A2	P04920	1241 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SSUH2-208	ENST00000455157	MCC	P23508	829 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SSUH2-208	ENST00000455157	MEIS3	Q99687	375 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SSUH2-208	ENST00000455157	ERC2	O15083	957 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SSUH2-208	ENST00000455157	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
SSUH2-208	ENST00000455157	DCTPP1	Q9H773	170 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SSUH2-208	ENST00000455157	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SSUH2-208	ENST00000455157	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SSUH2-208	ENST00000455157		F6X3S4	739 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SSUH2-208	ENST00000455157	ASXL2	Q76L83	1435 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SSUH2-208	ENST00000455157	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	MROH2A	A6NES4	1674 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	ABCC4	O15439	1325 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	AK9	Q5TCS8	1911 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC20A2	Q08357	652 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	CEP85	Q6P2H3	762 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	ADGRB3	O60242	1522 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	13.74	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	STK31	Q9BXU1	1019 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	TSC1	Q92574	1164 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF445	P59923	1031 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	ADGRB1	O14514	1584 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	GLI2	P10070	1586 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	IL13	P35225	146 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	GPT2	Q8TD30	523 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	TMX3	Q96JJ7	454 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	DEPDC5	O75140	1603 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	MBD3	O95983	291 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	RGS22	Q8NE09	1264 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	IGSF3	O75054	1194 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SSUH2-208	ENST00000455157	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		13.71	□□□□□ -0.22
SSUH2-208	ENST00000455157	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
SSUH2-208	ENST00000455157	TSPY26P	Q9H489	355 aa		13.71	□□□□□ -0.22
SSUH2-208	ENST00000455157	MSH6	P52701	1360 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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