RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439197.1

RPS29P10-201, Transcript of ribosomal protein S29 pseudogene 10, humanhuman

BASIC

Gene RPS29P10, Length 166 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P10-201ENST00000439197 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RPS29P10-201ENST00000439197 PLCH1Q4KWH8 1693 aa6.85□□□□□ -1.31
RPS29P10-201ENST00000439197 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RPS29P10-201ENST00000439197 APAF1O14727 1248 aa6.85□□□□□ -1.31
RPS29P10-201ENST00000439197 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RPS29P10-201ENST00000439197 RXRBP28702 533 aa6.85□□□□□ -1.31
RPS29P10-201ENST00000439197 RIPK4P57078 832 aa6.85□□□□□ -1.31
RPS29P10-201ENST00000439197 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RPS29P10-201ENST00000439197 NFE2L2Q16236 605 aa6.85□□□□□ -1.31
RPS29P10-201ENST00000439197 DDB1Q16531 1140 aa6.85□□□□□ -1.31
RPS29P10-201ENST00000439197 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RPS29P10-201ENST00000439197 BARGINQ6ZT62 677 aa6.85□□□□□ -1.31
RPS29P10-201ENST00000439197 NGEFQ8N5V2 710 aa6.85□□□□□ -1.31
RPS29P10-201ENST00000439197 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RPS29P10-201ENST00000439197 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
RPS29P10-201ENST00000439197 BCL9LQ86UU0 1499 aa6.85□□□□□ -1.31
RPS29P10-201ENST00000439197 KDRP35968 1356 aa6.84□□□□□ -1.31
RPS29P10-201ENST00000439197 LMO7Q8WWI1 1683 aa6.84□□□□□ -1.31
RPS29P10-201ENST00000439197 GNAT3A8MTJ3 354 aa6.84□□□□□ -1.31
RPS29P10-201ENST00000439197 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
RPS29P10-201ENST00000439197 IFNL2Q8IZJ0 200 aa6.84□□□□□ -1.31
RPS29P10-201ENST00000439197 PHACTR3Q96KR7 559 aa6.84□□□□□ -1.31
RPS29P10-201ENST00000439197 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
RPS29P10-201ENST00000439197 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa6.83□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa6.83□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa6.83□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 TMPOP42166 694 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 AKAP4Q5JQC9 854 aa6.83□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 PLEKHF1Q96S99 279 aa6.83□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 RGPD2P0DJD1 1756 aa6.82□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 TEFQ10587 303 aa6.82□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 SEPT12Q8IYM1 358 aa6.82□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 ATRNO75882 1429 aa6.82□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa6.82□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa6.81□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 DCAF5Q96JK2 942 aa6.81□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 RGPD1P0DJD0 1748 aa6.81□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 NRAPQ86VF7 1730 aa6.81□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 MAP3K5Q99683 1374 aa6.81□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa6.8□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 PHKG2P15735 406 aa6.8□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 CABP4P57796 275 aa6.8□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 GOLGA2Q08379 1002 aa6.8□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 NCAPD2Q15021 1401 aa6.8□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 CCDC27Q2M243 656 aa6.8□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 MCM10Q7L590 875 aa6.8□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 KRT27Q7Z3Y8 459 aa6.8□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 WDR63Q8IWG1 891 aa6.8□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 MEGF6O75095 1541 aa6.8□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 ERVV-2B6SEH9 535 aa6.79□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 CYP27B1O15528 508 aa6.79□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 GNAI1P63096 354 aa6.79□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 DCTN1Q14203 1278 aa6.79□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 POTEAQ6S8J7 498 aa6.79□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 WWC1Q8IX03 1113 aa6.79□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 MYH16Q9H6N6 1097 aa6.79□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 KAT6BQ8WYB5 2073 aa6.79□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 ZBED9Q6R2W3 1325 aa6.78□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 E9PSI1 815 aa6.78□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 RNMTO43148 476 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 FAM196AQ6ZSG2 479 aa6.78□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 TTC5Q8N0Z6 440 aa6.78□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa6.78□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 LGR6Q9HBX8 967 aa6.78□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 TMOD3Q9NYL9 352 aa6.78□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 TRIM35Q9UPQ4 493 aa6.78□□□□□ -1.32
RPS29P10-201ENST00000439197 DISP2A7MBM2 1401 aa6.77□□□□□ -1.33
RPS29P10-201ENST00000439197 TNS2Q63HR2 1409 aa6.77□□□□□ -1.33
RPS29P10-201ENST00000439197 BTBD11A6QL63 1104 aa6.77□□□□□ -1.33
RPS29P10-201ENST00000439197 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
RPS29P10-201ENST00000439197 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
RPS29P10-201ENST00000439197 IL17REQ8NFR9 667 aa6.77□□□□□ -1.33
RPS29P10-201ENST00000439197 ACSBG1Q96GR2 724 aa6.77□□□□□ -1.33
RPS29P10-201ENST00000439197 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
RPS29P10-201ENST00000439197 CHMP4AQ9BY43 222 aa6.77□□□□□ -1.33
RPS29P10-201ENST00000439197 SLC52A2Q9HAB3 445 aa6.77□□□□□ -1.33
RPS29P10-201ENST00000439197 IFT57Q9NWB7 429 aa6.77□□□□□ -1.33
RPS29P10-201ENST00000439197 BABAM1Q9NWV8 329 aa6.77□□□□□ -1.33
RPS29P10-201ENST00000439197 TSPYL4Q9UJ04 414 aa6.77□□□□□ -1.33
RPS29P10-201ENST00000439197 IL16Q14005 1332 aa6.76□□□□□ -1.33
RPS29P10-201ENST00000439197 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RPS29P10-201ENST00000439197 CFAP44Q96MT7 982 aa6.76□□□□□ -1.33
RPS29P10-201ENST00000439197 GLI3P10071 1580 aa6.76□□□□□ -1.33
RPS29P10-201ENST00000439197 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RPS29P10-201ENST00000439197 FAM182BQ5T319 152 aa6.75□□□□□ -1.33
RPS29P10-201ENST00000439197 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RPS29P10-201ENST00000439197 MIS18AQ9NYP9 233 aa6.75□□□□□ -1.33
RPS29P10-201ENST00000439197 PKD1L3Q7Z443 1732 aa6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms