RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436022.2

EFCC1-201, Transcript of EF-hand and coiled-coil domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene EFCC1, Length 2,691 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCC1-201ENST00000436022 ESCO1Q5FWF5 840 aa28.06■■■□□ 2.08
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EFCC1-201ENST00000436022 SMC5Q8IY18 1101 aa28.05■■■□□ 2.08
EFCC1-201ENST00000436022 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
EFCC1-201ENST00000436022 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
EFCC1-201ENST00000436022 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa28.03■■■□□ 2.08
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EFCC1-201ENST00000436022 HSPA2P54652 639 aa27.67■■■□□ 2.02
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EFCC1-201ENST00000436022 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
EFCC1-201ENST00000436022 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
EFCC1-201ENST00000436022 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
EFCC1-201ENST00000436022 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
EFCC1-201ENST00000436022 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
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