RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.84■□□□□ 0.93
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HCLS1-202ENST00000428394 OVOS2Q6IE36 1432 aa20.83■□□□□ 0.93
HCLS1-202ENST00000428394 CHL1O00533 1208 aa20.82■□□□□ 0.92
HCLS1-202ENST00000428394 KLHL40Q2TBA0 621 aa20.82■□□□□ 0.92
HCLS1-202ENST00000428394 C8orf58Q8NAV2 365 aa20.82■□□□□ 0.92
HCLS1-202ENST00000428394 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
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HCLS1-202ENST00000428394 RTL1A6NKG5 1358 aa20.81■□□□□ 0.92
HCLS1-202ENST00000428394 USP31Q70CQ4 1352 aa20.81■□□□□ 0.92
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HCLS1-202ENST00000428394 FMN2Q9NZ56 1722 aa20.8■□□□□ 0.92
HCLS1-202ENST00000428394 REC8O95072 547 aa20.8■□□□□ 0.92
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HCLS1-202ENST00000428394 ST18O60284 1047 aa20.77■□□□□ 0.92
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HCLS1-202ENST00000428394 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
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HCLS1-202ENST00000428394 PTPRUQ92729 1446 aa20.7■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 BABAM1Q9NWV8 329 aa20.7■□□□□ 0.9
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HCLS1-202ENST00000428394 ERC2O15083 957 aa20.69■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 SSFA2P28290 1259 aa20.69■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa20.69■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 ANAPC15P60006 121 aa20.68■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 AOX1Q06278 1338 aa20.68■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 SDSP20132 328 aa20.68■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
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HCLS1-202ENST00000428394 KLHL34Q8N239 644 aa20.68■□□□□ 0.9
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HCLS1-202ENST00000428394 MCCP23508 829 aa20.65■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa20.65■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 GNAI3P08754 354 aa20.64■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 TERF1P54274 439 aa20.64■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 ZRANB1Q9UGI0 708 aa20.64■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 TPM2P07951 284 aa20.63■□□□□ 0.89
HCLS1-202ENST00000428394 ROBO2Q9HCK4 1378 aa20.63■□□□□ 0.89
HCLS1-202ENST00000428394 MBD3O95983 291 aa20.63■□□□□ 0.89
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