RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP34■■■■□ 3.03
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TATP17735 454 aaPredicted RBP33.99■■■■□ 3.03
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SHANK3Q9BYB0 1731 aa33.97■■■■□ 3.03
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KCNQ2O43526 872 aa33.97■■■■□ 3.03
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MTHFSP49914 203 aa33.97■■■■□ 3.03
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ACSBG1Q96GR2 724 aa33.96■■■■□ 3.03
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP33.95■■■■□ 3.03
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IGSF1Q8N6C5 1336 aa33.94■■■■□ 3.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IL13P35225 146 aa33.91■■■■□ 3.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PARD3Q8TEW0 1356 aa33.9■■■■□ 3.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NHSQ6T4R5 1651 aa33.9■■■■□ 3.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PLSCR1O15162 318 aa33.88■■■■□ 3.01
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa33.86■■■■□ 3.01
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa33.86■■■■□ 3.01
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CYP27B1O15528 508 aa33.86■■■■□ 3.01
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PKD1L3Q7Z443 1732 aa33.85■■■■□ 3.01
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AEBP1Q8IUX7 1158 aa33.85■■■■□ 3.01
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RREB1Q92766 1687 aa33.84■■■■□ 3.01
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PROM2Q8N271 834 aa33.83■■■■□ 3.01
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP33.82■■■■□ 3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP33.81■■■■□ 3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPG7Q9UQ90 795 aa33.81■■■■□ 3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP33.8■■■■□ 3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa33.8■■■■□ 3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP33.8■■■■□ 3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SULT6B1Q6IMI4 303 aa33.79■■■■□ 3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KDRP35968 1356 aa33.78■■■■□ 3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DOT1LQ8TEK3 1739 aa33.78■■■■□ 3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa33.77■■■■□ 3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NUP188Q5SRE5 1749 aa33.77■■■■□ 3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP33.77■■■■□ 3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PPP2R1AP30153 589 aa33.77■■■■□ 3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP33.77■■■■□ 3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP33.77■■■■□ 3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BTAF1O14981 1849 aa33.76■■■□□ 2.99
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP33.75■■■□□ 2.99
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP33.75■■■□□ 2.99
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PHKG2P15735 406 aa33.73■■■□□ 2.99
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TXNRD1Q16881 649 aa33.73■■■□□ 2.99
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KAT6BQ8WYB5 2073 aa33.72■■■□□ 2.99
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa33.71■■■□□ 2.99
HOXD-AS2-201ENST00000426965 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP33.71■■■□□ 2.99
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IFNL2Q8IZJ0 200 aa33.7■■■□□ 2.99
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HMOX1P09601 288 aa33.69■■■□□ 2.98
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP33.69■■■□□ 2.98
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa33.69■■■□□ 2.98
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AMOTQ4VCS5 1084 aa33.67■■■□□ 2.98
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NBPF14Q5TI25 921 aa33.66■■■□□ 2.98
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP33.66■■■□□ 2.98
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa33.64■■■□□ 2.98
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP33.63■■■□□ 2.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CFAP53Q96M91 514 aa33.63■■■□□ 2.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LRRC4BQ9NT99 713 aa33.63■■■□□ 2.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP33.62■■■□□ 2.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PIGBQ92521 554 aa33.6■■■□□ 2.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP33.57■■■□□ 2.96
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KCNQ4P56696 695 aa33.57■■■□□ 2.96
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ITGB4P16144 1822 aa33.57■■■□□ 2.96
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC27A3Q5K4L6 730 aa33.56■■■□□ 2.96
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DCAF5Q96JK2 942 aa33.56■■■□□ 2.96
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PAPPAQ13219 1627 aa33.55■■■□□ 2.96
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP33.55■■■□□ 2.96
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LY75O60449 1722 aa33.54■■■□□ 2.96
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RALBP1Q15311 655 aa33.54■■■□□ 2.96
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C1orf141Q5JVX7 400 aa33.54■■■□□ 2.96
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP33.53■■■□□ 2.96
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMOD3Q9NYL9 352 aa33.53■■■□□ 2.96
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC15A2Q16348 729 aa33.52■■■□□ 2.96
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PALLDQ8WX93 1383 aa33.51■■■□□ 2.96
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ERVV-2B6SEH9 535 aa33.51■■■□□ 2.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 STK32BQ9NY57 414 aa33.51■■■□□ 2.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NUDCQ9Y266 331 aa33.51■■■□□ 2.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AKAP4Q5JQC9 854 aa33.5■■■□□ 2.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RSPH6AQ9H0K4 717 aa33.5■■■□□ 2.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP33.5■■■□□ 2.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF827Q17R98 1081 aa33.49■■■□□ 2.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP33.48■■■□□ 2.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ASAP1Q9ULH1 1129 aa33.48■■■□□ 2.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP33.47■■■□□ 2.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP33.47■■■□□ 2.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP33.47■■■□□ 2.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AKT1S1Q96B36 256 aa33.47■■■□□ 2.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP33.46■■■□□ 2.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ATG3Q9NT62 314 aa33.46■■■□□ 2.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRKAR2BP31323 418 aa33.45■■■□□ 2.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PHACTR3Q96KR7 559 aa33.45■■■□□ 2.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LGR6Q9HBX8 967 aa33.44■■■□□ 2.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CABP4P57796 275 aa33.43■■■□□ 2.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa33.41■■■□□ 2.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CASZ1Q86V15 1759 aa33.4■■■□□ 2.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP33.4■■■□□ 2.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RNMTO43148 476 aaKnown RBP33.4■■■□□ 2.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FCHSD2O94868 740 aa33.4■■■□□ 2.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LRP5O75197 1615 aa33.39■■■□□ 2.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GAS2L2Q8NHY3 880 aa33.38■■■□□ 2.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP33.38■■■□□ 2.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SCN11AQ9UI33 1791 aa33.38■■■□□ 2.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa33.37■■■□□ 2.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SIK1P57059 783 aa33.37■■■□□ 2.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC52A2Q9HAB3 445 aa33.36■■■□□ 2.93
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