RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423339.2

CCDC82-202, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC82, Length 1,878 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-202ENST00000423339 ACDQ96AP0 544 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC82-202ENST00000423339 FAM117AQ9C073 453 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC82-202ENST00000423339 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CCDC82-202ENST00000423339 TUSC1Q2TAM9 212 aa6.62□□□□□ -1.35
CCDC82-202ENST00000423339 ZBTB33Q86T24 672 aa6.62□□□□□ -1.35
CCDC82-202ENST00000423339 PTGIRP43119 386 aa6.62□□□□□ -1.35
CCDC82-202ENST00000423339 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CCDC82-202ENST00000423339 KRBA1A5PL33 1030 aa6.61□□□□□ -1.35
CCDC82-202ENST00000423339 OIP5O43482 229 aa6.61□□□□□ -1.35
CCDC82-202ENST00000423339 MAP2K3P46734 347 aa6.61□□□□□ -1.35
CCDC82-202ENST00000423339 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CCDC82-202ENST00000423339 MX2P20592 715 aa6.6□□□□□ -1.35
CCDC82-202ENST00000423339 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa6.6□□□□□ -1.35
CCDC82-202ENST00000423339 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa6.6□□□□□ -1.35
CCDC82-202ENST00000423339 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.6□□□□□ -1.35
CCDC82-202ENST00000423339 IL27Q8NEV9 243 aa6.6□□□□□ -1.35
CCDC82-202ENST00000423339 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CCDC82-202ENST00000423339 NBPF20Q3BBV1 942 aa6.6□□□□□ -1.35
CCDC82-202ENST00000423339 GPR25O00155 361 aa6.59□□□□□ -1.35
CCDC82-202ENST00000423339 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CCDC82-202ENST00000423339 DDRGK1Q96HY6 314 aa6.58□□□□□ -1.36
CCDC82-202ENST00000423339 DYRK1BQ9Y463 629 aa6.58□□□□□ -1.36
CCDC82-202ENST00000423339 TMEM132AQ24JP5 1023 aa6.58□□□□□ -1.36
CCDC82-202ENST00000423339 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CCDC82-202ENST00000423339 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CCDC82-202ENST00000423339 LILRB3O75022 631 aa6.57□□□□□ -1.36
CCDC82-202ENST00000423339 GPC1P35052 558 aa6.57□□□□□ -1.36
CCDC82-202ENST00000423339 PTK2Q05397 1052 aa6.57□□□□□ -1.36
CCDC82-202ENST00000423339 DBN1Q16643 649 aa6.57□□□□□ -1.36
CCDC82-202ENST00000423339 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa6.57□□□□□ -1.36
CCDC82-202ENST00000423339 GPSM3Q9Y4H4 160 aa6.57□□□□□ -1.36
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CCDC82-202ENST00000423339 RRAGCQ9HB90 399 aa6.56□□□□□ -1.36
CCDC82-202ENST00000423339 RHOQP17081 205 aa6.56□□□□□ -1.36
CCDC82-202ENST00000423339 FKBPLQ9UIM3 349 aa6.56□□□□□ -1.36
CCDC82-202ENST00000423339 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CCDC82-202ENST00000423339 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CCDC82-202ENST00000423339 MYSM1Q5VVJ2 828 aa6.55□□□□□ -1.36
CCDC82-202ENST00000423339 PNMA1Q8ND90 353 aa6.54□□□□□ -1.36
CCDC82-202ENST00000423339 POLR3EQ9NVU0 708 aa6.54□□□□□ -1.36
CCDC82-202ENST00000423339 PHF24Q9UPV7 400 aa6.54□□□□□ -1.36
CCDC82-202ENST00000423339 GRIN2CQ14957 1233 aa6.53□□□□□ -1.36
CCDC82-202ENST00000423339 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa6.53□□□□□ -1.36
CCDC82-202ENST00000423339 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CCDC82-202ENST00000423339 CFHR5Q9BXR6 569 aa6.53□□□□□ -1.36
CCDC82-202ENST00000423339 RSPH6AQ9H0K4 717 aa6.53□□□□□ -1.36
CCDC82-202ENST00000423339 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa6.53□□□□□ -1.36
CCDC82-202ENST00000423339 LILRA1O75019 489 aa6.53□□□□□ -1.36
CCDC82-202ENST00000423339 QPCTQ16769 361 aa6.53□□□□□ -1.36
CCDC82-202ENST00000423339 LCE3BQ5TA77 95 aa6.53□□□□□ -1.36
CCDC82-202ENST00000423339 BTBD11A6QL63 1104 aa6.52□□□□□ -1.37
CCDC82-202ENST00000423339 COL8A1P27658 744 aa6.52□□□□□ -1.37
CCDC82-202ENST00000423339 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CCDC82-202ENST00000423339 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CCDC82-202ENST00000423339 LIMD1Q9UGP4 676 aa6.52□□□□□ -1.37
CCDC82-202ENST00000423339 WDR44Q5JSH3 913 aa6.51□□□□□ -1.37
CCDC82-202ENST00000423339 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa6.51□□□□□ -1.37
CCDC82-202ENST00000423339 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa6.51□□□□□ -1.37
CCDC82-202ENST00000423339 ADD1P35611 737 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CCDC82-202ENST00000423339 CLK2P49760 499 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CCDC82-202ENST00000423339 RAB15P59190 212 aa6.51□□□□□ -1.37
CCDC82-202ENST00000423339 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CCDC82-202ENST00000423339 SH3D19Q5HYK7 790 aa6.51□□□□□ -1.37
CCDC82-202ENST00000423339 PPP2R2DQ66LE6 453 aa6.51□□□□□ -1.37
CCDC82-202ENST00000423339 EDARADDQ8WWZ3 215 aa6.51□□□□□ -1.37
CCDC82-202ENST00000423339 SEMA6BQ9H3T3 888 aa6.51□□□□□ -1.37
CCDC82-202ENST00000423339 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CCDC82-202ENST00000423339 ERVH48-1M5A8F1 160 aa6.5□□□□□ -1.37
CCDC82-202ENST00000423339 GNB5O14775 395 aa6.5□□□□□ -1.37
CCDC82-202ENST00000423339 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CCDC82-202ENST00000423339 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CCDC82-202ENST00000423339 SEPT12Q8IYM1 358 aa6.5□□□□□ -1.37
CCDC82-202ENST00000423339 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CCDC82-202ENST00000423339 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CCDC82-202ENST00000423339 ADAM32Q8TC27 787 aa6.5□□□□□ -1.37
CCDC82-202ENST00000423339 SHISA8B8ZZ34 492 aa6.49□□□□□ -1.37
CCDC82-202ENST00000423339 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa6.49□□□□□ -1.37
CCDC82-202ENST00000423339 AMPD1P23109 780 aa6.49□□□□□ -1.37
CCDC82-202ENST00000423339 SLC27A3Q5K4L6 730 aa6.49□□□□□ -1.37
CCDC82-202ENST00000423339 CCDC125Q86Z20 511 aa6.49□□□□□ -1.37
CCDC82-202ENST00000423339 NLRP3Q96P20 1036 aa6.49□□□□□ -1.37
CCDC82-202ENST00000423339 MEN1O00255 615 aa6.49□□□□□ -1.37
CCDC82-202ENST00000423339 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.48□□□□□ -1.37
CCDC82-202ENST00000423339 F11P03951 625 aa6.48□□□□□ -1.37
CCDC82-202ENST00000423339 KLRG1Q96E93 195 aa6.48□□□□□ -1.37
CCDC82-202ENST00000423339 CD163Q86VB7 1156 aa6.47□□□□□ -1.37
CCDC82-202ENST00000423339 GOPCQ9HD26 462 aa6.47□□□□□ -1.37
CCDC82-202ENST00000423339 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa6.47□□□□□ -1.37
CCDC82-202ENST00000423339 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa6.47□□□□□ -1.37
CCDC82-202ENST00000423339 ESPNB1AK53 854 aa6.47□□□□□ -1.37
CCDC82-202ENST00000423339 POU4F2Q12837 409 aa6.47□□□□□ -1.37
CCDC82-202ENST00000423339 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CCDC82-202ENST00000423339 LINC00114Q6XXX2 140 aa6.47□□□□□ -1.37
CCDC82-202ENST00000423339 NBPF15Q8N660 670 aa6.47□□□□□ -1.37
CCDC82-202ENST00000423339 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CCDC82-202ENST00000423339 CYLDQ9NQC7 956 aa6.47□□□□□ -1.37
CCDC82-202ENST00000423339 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa6.46□□□□□ -1.38
CCDC82-202ENST00000423339 LBRQ14739 615 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CCDC82-202ENST00000423339 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CCDC82-202ENST00000423339 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.46□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.6 ms