RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399415.2

RPL23AP59-201, Transcript of ribosomal protein L23a pseudogene 59, humanhuman

BASIC

Gene RPL23AP59, Length 461 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23AP59-201ENST00000399415 SCARF1Q14162 830 aa8.38□□□□□ -1.07
RPL23AP59-201ENST00000399415 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RPL23AP59-201ENST00000399415 USTQ9Y2C2 406 aa8.38□□□□□ -1.07
RPL23AP59-201ENST00000399415 CADPSQ9ULU8 1353 aa8.37□□□□□ -1.07
RPL23AP59-201ENST00000399415 TMEM88BA6NKF7 163 aa8.37□□□□□ -1.07
RPL23AP59-201ENST00000399415 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
RPL23AP59-201ENST00000399415 NR3C2P08235 984 aa8.37□□□□□ -1.07
RPL23AP59-201ENST00000399415 SKIP12755 728 aa8.37□□□□□ -1.07
RPL23AP59-201ENST00000399415 VEGFBP49765 207 aa8.37□□□□□ -1.07
RPL23AP59-201ENST00000399415 PDXDC2PQ6P474 469 aa8.37□□□□□ -1.07
RPL23AP59-201ENST00000399415 DEPDC4Q8N2C3 294 aa8.37□□□□□ -1.07
RPL23AP59-201ENST00000399415 VRTNQ9H8Y1 702 aa8.37□□□□□ -1.07
RPL23AP59-201ENST00000399415 NR5A1Q13285 461 aa8.36□□□□□ -1.07
RPL23AP59-201ENST00000399415 NBPF14Q5TI25 921 aa8.36□□□□□ -1.07
RPL23AP59-201ENST00000399415 CEP126Q9P2H0 1117 aa8.36□□□□□ -1.07
RPL23AP59-201ENST00000399415 USP17L3A6NCW0 530 aa8.35□□□□□ -1.07
RPL23AP59-201ENST00000399415 USP17L4A6NCW7 530 aa8.35□□□□□ -1.07
RPL23AP59-201ENST00000399415 BRD1O95696 1058 aa8.35□□□□□ -1.07
RPL23AP59-201ENST00000399415 GRM5P41594 1212 aa8.35□□□□□ -1.07
RPL23AP59-201ENST00000399415 PTK2Q05397 1052 aa8.35□□□□□ -1.07
RPL23AP59-201ENST00000399415 USP17L2Q6R6M4 530 aa8.35□□□□□ -1.07
RPL23AP59-201ENST00000399415 USP17L1Q7RTZ2 530 aa8.35□□□□□ -1.07
RPL23AP59-201ENST00000399415 ITPKCQ96DU7 683 aa8.35□□□□□ -1.07
RPL23AP59-201ENST00000399415 ZFAND3Q9H8U3 227 aa8.35□□□□□ -1.07
RPL23AP59-201ENST00000399415 STK17AQ9UEE5 414 aa8.35□□□□□ -1.07
RPL23AP59-201ENST00000399415 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa8.35□□□□□ -1.07
RPL23AP59-201ENST00000399415 ERCC6Q03468 1493 aa8.34□□□□□ -1.07
RPL23AP59-201ENST00000399415 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa8.34□□□□□ -1.07
RPL23AP59-201ENST00000399415 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa8.34□□□□□ -1.07
RPL23AP59-201ENST00000399415 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
RPL23AP59-201ENST00000399415 NPAS3Q8IXF0 933 aa8.34□□□□□ -1.07
RPL23AP59-201ENST00000399415 USP17L5A8MUK1 530 aa8.33□□□□□ -1.08
RPL23AP59-201ENST00000399415 FSHRP23945 695 aa8.33□□□□□ -1.08
RPL23AP59-201ENST00000399415 TSGA10IPQ3SY00 556 aa8.33□□□□□ -1.08
RPL23AP59-201ENST00000399415 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RPL23AP59-201ENST00000399415 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa8.33□□□□□ -1.08
RPL23AP59-201ENST00000399415 PHTF2Q8N3S3 785 aa8.33□□□□□ -1.08
RPL23AP59-201ENST00000399415 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa8.33□□□□□ -1.08
RPL23AP59-201ENST00000399415 ADAM32Q8TC27 787 aa8.33□□□□□ -1.08
RPL23AP59-201ENST00000399415 IRF7Q92985 503 aa8.33□□□□□ -1.08
RPL23AP59-201ENST00000399415 GPSM3Q9Y4H4 160 aa8.33□□□□□ -1.08
RPL23AP59-201ENST00000399415 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa8.32□□□□□ -1.08
RPL23AP59-201ENST00000399415 SOBPA7XYQ1 873 aa8.32□□□□□ -1.08
RPL23AP59-201ENST00000399415 H3BM21 787 aa8.32□□□□□ -1.08
RPL23AP59-201ENST00000399415 GMPRP36959 345 aa8.32□□□□□ -1.08
RPL23AP59-201ENST00000399415 C6orf118Q5T5N4 469 aa8.32□□□□□ -1.08
RPL23AP59-201ENST00000399415 STK32AQ8WU08 396 aa8.32□□□□□ -1.08
RPL23AP59-201ENST00000399415 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP8.32□□□□□ -1.08
RPL23AP59-201ENST00000399415 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa8.32□□□□□ -1.08
RPL23AP59-201ENST00000399415 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa8.32□□□□□ -1.08
RPL23AP59-201ENST00000399415 CARD14Q9BXL6 1004 aa8.32□□□□□ -1.08
RPL23AP59-201ENST00000399415 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa8.32□□□□□ -1.08
RPL23AP59-201ENST00000399415 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
RPL23AP59-201ENST00000399415 NCOA4Q13772 614 aa8.31□□□□□ -1.08
RPL23AP59-201ENST00000399415 SLFNL1Q499Z3 407 aa8.31□□□□□ -1.08
RPL23AP59-201ENST00000399415 TMCO4Q5TGY1 634 aa8.31□□□□□ -1.08
RPL23AP59-201ENST00000399415 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa8.31□□□□□ -1.08
RPL23AP59-201ENST00000399415 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
RPL23AP59-201ENST00000399415 CUX2O14529 1486 aa8.31□□□□□ -1.08
RPL23AP59-201ENST00000399415 PDS5BQ9NTI5 1447 aa8.3□□□□□ -1.08
RPL23AP59-201ENST00000399415 UPP2O95045 317 aa8.3□□□□□ -1.08
RPL23AP59-201ENST00000399415 KCNA1Q09470 495 aa8.3□□□□□ -1.08
RPL23AP59-201ENST00000399415 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RPL23AP59-201ENST00000399415 TMEM164Q5U3C3 297 aa8.3□□□□□ -1.08
RPL23AP59-201ENST00000399415 RNF135Q8IUD6 432 aa8.3□□□□□ -1.08
RPL23AP59-201ENST00000399415 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RPL23AP59-201ENST00000399415 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa8.3□□□□□ -1.08
RPL23AP59-201ENST00000399415 CCDC88BA6NC98 1476 aa8.3□□□□□ -1.08
RPL23AP59-201ENST00000399415 CFTRP13569 1480 aa8.3□□□□□ -1.08
RPL23AP59-201ENST00000399415 ERBB4Q15303 1308 aa8.29□□□□□ -1.08
RPL23AP59-201ENST00000399415 MAN1A2O60476 641 aa8.29□□□□□ -1.08
RPL23AP59-201ENST00000399415 BMP2P12643 396 aa8.29□□□□□ -1.08
RPL23AP59-201ENST00000399415 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RPL23AP59-201ENST00000399415 ZBTB33Q86T24 672 aa8.29□□□□□ -1.08
RPL23AP59-201ENST00000399415 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.29□□□□□ -1.08
RPL23AP59-201ENST00000399415 PLPP7Q8NBV4 271 aa8.29□□□□□ -1.08
RPL23AP59-201ENST00000399415 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RPL23AP59-201ENST00000399415 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa8.28□□□□□ -1.08
RPL23AP59-201ENST00000399415 USP17L15C9J2P7 530 aa8.27□□□□□ -1.09
RPL23AP59-201ENST00000399415 USP17L10C9JJH3 530 aa8.27□□□□□ -1.09
RPL23AP59-201ENST00000399415 USP17L13C9JLJ4 530 aa8.27□□□□□ -1.09
RPL23AP59-201ENST00000399415 USP17L12C9JPN9 530 aa8.27□□□□□ -1.09
RPL23AP59-201ENST00000399415 USP17L11C9JVI0 530 aa8.27□□□□□ -1.09
RPL23AP59-201ENST00000399415 USP17L21D6R901 530 aa8.27□□□□□ -1.09
RPL23AP59-201ENST00000399415 USP17L18D6R9N7 530 aa8.27□□□□□ -1.09
RPL23AP59-201ENST00000399415 USP17L22D6RA61 530 aa8.27□□□□□ -1.09
RPL23AP59-201ENST00000399415 USP17L17D6RBQ6 530 aa8.27□□□□□ -1.09
RPL23AP59-201ENST00000399415 USP17L19D6RCP7 530 aa8.27□□□□□ -1.09
RPL23AP59-201ENST00000399415 USP17L20D6RJB6 530 aa8.27□□□□□ -1.09
RPL23AP59-201ENST00000399415 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
RPL23AP59-201ENST00000399415 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
RPL23AP59-201ENST00000399415 USP17L24Q0WX57 530 aa8.27□□□□□ -1.09
RPL23AP59-201ENST00000399415 PTK7Q13308 1070 aa8.27□□□□□ -1.09
RPL23AP59-201ENST00000399415 ERFEQ4G0M1 354 aa8.27□□□□□ -1.09
RPL23AP59-201ENST00000399415 CCDC116Q8IYX3 515 aa8.27□□□□□ -1.09
RPL23AP59-201ENST00000399415 MEIOBQ8N635 442 aa8.27□□□□□ -1.09
RPL23AP59-201ENST00000399415 RGS22Q8NE09 1264 aa8.27□□□□□ -1.09
RPL23AP59-201ENST00000399415 SLAIN2Q9P270 581 aa8.27□□□□□ -1.09
RPL23AP59-201ENST00000399415 CHIC2Q9UKJ5 165 aa8.27□□□□□ -1.09
RPL23AP59-201ENST00000399415 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84 ms