RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392991.8

OLFM1-208, Transcript of olfactomedin 1, human

TSL 2 BASIC

Gene OLFM1, Length 1,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
OLFM1-208	ENST00000392991	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	43.05	■■■■■ 4.48
OLFM1-208	ENST00000392991	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	43.05	■■■■■ 4.48
OLFM1-208	ENST00000392991	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		43.04	■■■■■ 4.48
OLFM1-208	ENST00000392991	BAG6	P46379	1132 aa		43.02	■■■■■ 4.48
OLFM1-208	ENST00000392991	PPP2R1A	P30153	589 aa		43	■■■■■ 4.47
OLFM1-208	ENST00000392991	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		43	■■■■■ 4.47
OLFM1-208	ENST00000392991	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		43	■■■■■ 4.47
OLFM1-208	ENST00000392991	NHS	Q6T4R5	1651 aa		42.98	■■■■■ 4.47
OLFM1-208	ENST00000392991	APBA3	O96018	575 aa		42.96	■■■■■ 4.47
OLFM1-208	ENST00000392991	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	42.96	■■■■■ 4.47
OLFM1-208	ENST00000392991	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		42.96	■■■■■ 4.47
OLFM1-208	ENST00000392991	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	42.96	■■■■■ 4.47
OLFM1-208	ENST00000392991	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	42.94	■■■■■ 4.46
OLFM1-208	ENST00000392991	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		42.94	■■■■■ 4.46
OLFM1-208	ENST00000392991	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		42.94	■■■■■ 4.46
OLFM1-208	ENST00000392991	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		42.94	■■■■■ 4.46
OLFM1-208	ENST00000392991	KDR	P35968	1356 aa		42.93	■■■■■ 4.46
OLFM1-208	ENST00000392991	KCNQ2	O43526	872 aa		42.93	■■■■■ 4.46
OLFM1-208	ENST00000392991	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		42.92	■■■■■ 4.46
OLFM1-208	ENST00000392991	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		42.91	■■■■■ 4.46
OLFM1-208	ENST00000392991	CYP27B1	O15528	508 aa		42.9	■■■■■ 4.46
OLFM1-208	ENST00000392991	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		42.89	■■■■■ 4.46
OLFM1-208	ENST00000392991	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	42.89	■■■■■ 4.46
OLFM1-208	ENST00000392991	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		42.89	■■■■■ 4.46
OLFM1-208	ENST00000392991	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	42.89	■■■■■ 4.46
OLFM1-208	ENST00000392991	SPG7	Q9UQ90	795 aa		42.88	■■■■■ 4.45
OLFM1-208	ENST00000392991	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	42.87	■■■■■ 4.45
OLFM1-208	ENST00000392991	CFAP53	Q96M91	514 aa		42.84	■■■■■ 4.45
OLFM1-208	ENST00000392991	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	42.83	■■■■■ 4.45
OLFM1-208	ENST00000392991	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		42.83	■■■■■ 4.45
OLFM1-208	ENST00000392991	RREB1	Q92766	1687 aa		42.82	■■■■■ 4.44
OLFM1-208	ENST00000392991	HMOX1	P09601	288 aa		42.8	■■■■■ 4.44
OLFM1-208	ENST00000392991	BTAF1	O14981	1849 aa		42.8	■■■■■ 4.44
OLFM1-208	ENST00000392991	RALBP1	Q15311	655 aa		42.79	■■■■■ 4.44
OLFM1-208	ENST00000392991	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		42.78	■■■■■ 4.44
OLFM1-208	ENST00000392991	PLSCR1	O15162	318 aa		42.78	■■■■■ 4.44
OLFM1-208	ENST00000392991	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	42.78	■■■■■ 4.44
OLFM1-208	ENST00000392991	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	42.77	■■■■■ 4.44
OLFM1-208	ENST00000392991	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	42.76	■■■■■ 4.44
OLFM1-208	ENST00000392991	PHKG2	P15735	406 aa		42.76	■■■■■ 4.44
OLFM1-208	ENST00000392991	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	42.76	■■■■■ 4.44
OLFM1-208	ENST00000392991	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		42.74	■■■■■ 4.43
OLFM1-208	ENST00000392991	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		42.74	■■■■■ 4.43
OLFM1-208	ENST00000392991	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	42.73	■■■■■ 4.43
OLFM1-208	ENST00000392991	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		42.73	■■■■■ 4.43
OLFM1-208	ENST00000392991	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		42.71	■■■■■ 4.43
OLFM1-208	ENST00000392991	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	42.69	■■■■■ 4.42
OLFM1-208	ENST00000392991	PROM2	Q8N271	834 aa		42.67	■■■■■ 4.42
OLFM1-208	ENST00000392991	NUDC	Q9Y266	331 aa		42.66	■■■■■ 4.42
OLFM1-208	ENST00000392991	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	42.65	■■■■■ 4.42
OLFM1-208	ENST00000392991	ITGB4	P16144	1822 aa		42.64	■■■■■ 4.42
OLFM1-208	ENST00000392991	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	42.62	■■■■■ 4.41
OLFM1-208	ENST00000392991	TXNRD1	Q16881	649 aa		42.61	■■■■■ 4.41
OLFM1-208	ENST00000392991	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	42.61	■■■■■ 4.41
OLFM1-208	ENST00000392991	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		42.6	■■■■■ 4.41
OLFM1-208	ENST00000392991	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	42.59	■■■■■ 4.41
OLFM1-208	ENST00000392991	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	42.59	■■■■■ 4.41
OLFM1-208	ENST00000392991	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	42.58	■■■■■ 4.41
OLFM1-208	ENST00000392991	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		42.58	■■■■■ 4.41
OLFM1-208	ENST00000392991	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		42.58	■■■■■ 4.41
OLFM1-208	ENST00000392991	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	42.57	■■■■■ 4.41
OLFM1-208	ENST00000392991	DCAF5	Q96JK2	942 aa		42.56	■■■■■ 4.4
OLFM1-208	ENST00000392991	LY75	O60449	1722 aa		42.54	■■■■■ 4.4
OLFM1-208	ENST00000392991	PRKAR2B	P31323	418 aa		42.54	■■■■■ 4.4
OLFM1-208	ENST00000392991	PIGB	Q92521	554 aa		42.54	■■■■■ 4.4
OLFM1-208	ENST00000392991	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		42.53	■■■■■ 4.4
OLFM1-208	ENST00000392991	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		42.5	■■■■■ 4.39
OLFM1-208	ENST00000392991	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		42.49	■■■■■ 4.39
OLFM1-208	ENST00000392991	FCHSD2	O94868	740 aa		42.49	■■■■■ 4.39
OLFM1-208	ENST00000392991	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		42.49	■■■■■ 4.39
OLFM1-208	ENST00000392991	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		42.49	■■■■■ 4.39
OLFM1-208	ENST00000392991	PAPPA	Q13219	1627 aa		42.49	■■■■■ 4.39
OLFM1-208	ENST00000392991	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	42.48	■■■■■ 4.39
OLFM1-208	ENST00000392991	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	42.48	■■■■■ 4.39
OLFM1-208	ENST00000392991	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		42.47	■■■■■ 4.39
OLFM1-208	ENST00000392991	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	42.47	■■■■■ 4.39
OLFM1-208	ENST00000392991	NBPF14	Q5TI25	921 aa		42.46	■■■■■ 4.39
OLFM1-208	ENST00000392991	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		42.45	■■■■■ 4.39
OLFM1-208	ENST00000392991	PALLD	Q8WX93	1383 aa		42.45	■■■■■ 4.39
OLFM1-208	ENST00000392991	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		42.43	■■■■■ 4.38
OLFM1-208	ENST00000392991	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		42.43	■■■■■ 4.38
OLFM1-208	ENST00000392991	KCNQ4	P56696	695 aa		42.41	■■■■■ 4.38
OLFM1-208	ENST00000392991	LGR6	Q9HBX8	967 aa		42.41	■■■■■ 4.38
OLFM1-208	ENST00000392991	MAP3K5	Q99683	1374 aa		42.39	■■■■■ 4.38
OLFM1-208	ENST00000392991	CABP4	P57796	275 aa		42.39	■■■■■ 4.38
OLFM1-208	ENST00000392991	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	42.39	■■■■■ 4.38
OLFM1-208	ENST00000392991	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		42.39	■■■■■ 4.38
OLFM1-208	ENST00000392991	MRC1	P22897	1456 aa		42.38	■■■■■ 4.38
OLFM1-208	ENST00000392991	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	42.38	■■■■■ 4.37
OLFM1-208	ENST00000392991	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	42.38	■■■■■ 4.37
OLFM1-208	ENST00000392991	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	42.38	■■■■■ 4.37
OLFM1-208	ENST00000392991	ATG3	Q9NT62	314 aa		42.36	■■■■■ 4.37
OLFM1-208	ENST00000392991	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		42.34	■■■■■ 4.37
OLFM1-208	ENST00000392991	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		42.34	■■■■■ 4.37
OLFM1-208	ENST00000392991	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		42.33	■■■■■ 4.37
OLFM1-208	ENST00000392991	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		42.32	■■■■■ 4.37
OLFM1-208	ENST00000392991	STK32B	Q9NY57	414 aa		42.32	■■■■■ 4.37
OLFM1-208	ENST00000392991	SLC15A2	Q16348	729 aa		42.31	■■■■■ 4.36
OLFM1-208	ENST00000392991	ZNF827	Q17R98	1081 aa		42.31	■■■■■ 4.36
OLFM1-208	ENST00000392991	C5	P01031	1676 aa		42.28	■■■■■ 4.36

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