RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392449.4

PTPRK-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 1,456 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-208ENST00000392449 STK32BQ9NY57 414 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRK-208ENST00000392449 SLC15A2Q16348 729 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRK-208ENST00000392449 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
PTPRK-208ENST00000392449 LRRC4BQ9NT99 713 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRK-208ENST00000392449 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRK-208ENST00000392449 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
PTPRK-208ENST00000392449 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
PTPRK-208ENST00000392449 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
PTPRK-208ENST00000392449 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
PTPRK-208ENST00000392449 INSRP06213 1382 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRK-208ENST00000392449 FLT4P35916 1363 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRK-208ENST00000392449 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
PTPRK-208ENST00000392449 KCNQ4P56696 695 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRK-208ENST00000392449 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
PTPRK-208ENST00000392449 NSD2O96028 1365 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRK-208ENST00000392449 ZNF827Q17R98 1081 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRK-208ENST00000392449 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
PTPRK-208ENST00000392449 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
PTPRK-208ENST00000392449 PTGER2P43116 358 aa23■■□□□ 1.27
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PTPRK-208ENST00000392449 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PTPRK-208ENST00000392449 LY75O60449 1722 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRK-208ENST00000392449 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRK-208ENST00000392449 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRK-208ENST00000392449 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRK-208ENST00000392449 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PTPRK-208ENST00000392449 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.27
PTPRK-208ENST00000392449 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PTPRK-208ENST00000392449 AKT1S1Q96B36 256 aa22.94■■□□□ 1.26
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PTPRK-208ENST00000392449 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRK-208ENST00000392449 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.92■■□□□ 1.26
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PTPRK-208ENST00000392449 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRK-208ENST00000392449 POLKQ9UBT6 870 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRK-208ENST00000392449 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRK-208ENST00000392449 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRK-208ENST00000392449 CYP27B1O15528 508 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRK-208ENST00000392449 NCAPD2Q15021 1401 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRK-208ENST00000392449 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRK-208ENST00000392449 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRK-208ENST00000392449 PANK3Q9H999 370 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRK-208ENST00000392449 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRK-208ENST00000392449 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
PTPRK-208ENST00000392449 EYA1Q99502 592 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRK-208ENST00000392449 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PTPRK-208ENST00000392449 ITGB4P16144 1822 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRK-208ENST00000392449 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRK-208ENST00000392449 UTRNP46939 3433 aa22.86■■□□□ 1.25
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PTPRK-208ENST00000392449 SYT17Q9BSW7 474 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRK-208ENST00000392449 C5P01031 1676 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRK-208ENST00000392449 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PTPRK-208ENST00000392449 ARXQ96QS3 562 aa22.84■■□□□ 1.25
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PTPRK-208ENST00000392449 PALLDQ8WX93 1383 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRK-208ENST00000392449 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRK-208ENST00000392449 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRK-208ENST00000392449 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.79■■□□□ 1.24
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PTPRK-208ENST00000392449 PIGBQ92521 554 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRK-208ENST00000392449 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PTPRK-208ENST00000392449 KLHL34Q8N239 644 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRK-208ENST00000392449 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
PTPRK-208ENST00000392449 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRK-208ENST00000392449 PHKG2P15735 406 aa22.75■■□□□ 1.23
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PTPRK-208ENST00000392449 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRK-208ENST00000392449 C4BP0C0L5 1744 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRK-208ENST00000392449 MSL1Q68DK7 614 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRK-208ENST00000392449 SMIM5Q71RC9 77 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRK-208ENST00000392449 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRK-208ENST00000392449 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
PTPRK-208ENST00000392449 POLD1P28340 1107 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRK-208ENST00000392449 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRK-208ENST00000392449 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.73■■□□□ 1.237e-19■□□□□ 9.8
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PTPRK-208ENST00000392449 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRK-208ENST00000392449 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRK-208ENST00000392449 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRK-208ENST00000392449 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
PTPRK-208ENST00000392449 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.71■■□□□ 1.23
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PTPRK-208ENST00000392449 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
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PTPRK-208ENST00000392449 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRK-208ENST00000392449 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRK-208ENST00000392449 PHF14O94880 888 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRK-208ENST00000392449 SIK1P57059 783 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRK-208ENST00000392449 AK7Q96M32 723 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRK-208ENST00000392449 ITPK1Q13572 414 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRK-208ENST00000392449 ATG3Q9NT62 314 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRK-208ENST00000392449 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
PTPRK-208ENST00000392449 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
PTPRK-208ENST00000392449 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PTPRK-208ENST00000392449 GPR162Q16538 588 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRK-208ENST00000392449 CHD4Q14839 1912 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRK-208ENST00000392449 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
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