RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384540.1

RNU6-601P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 601, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-601P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-601P-201ENST00000384540 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
RNU6-601P-201ENST00000384540 IRF5Q13568 498 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-601P-201ENST00000384540 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-601P-201ENST00000384540 CYP2U1Q7Z449 544 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-601P-201ENST00000384540 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-601P-201ENST00000384540 TRAK2O60296 914 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-601P-201ENST00000384540 ITGA6P23229 1130 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-601P-201ENST00000384540 SCTRP47872 440 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-601P-201ENST00000384540 OSBPL3Q9H4L5 887 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-601P-201ENST00000384540 MCM6Q14566 821 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-601P-201ENST00000384540 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
RNU6-601P-201ENST00000384540 CEP126Q9P2H0 1117 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-601P-201ENST00000384540 A0A1W2PRU2 124 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-601P-201ENST00000384540 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.39
RNU6-601P-201ENST00000384540 KRT76Q01546 638 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-601P-201ENST00000384540 CLN3Q13286 438 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-601P-201ENST00000384540 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RNU6-601P-201ENST00000384540 MEN1O00255 615 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-601P-201ENST00000384540 SV2AQ7L0J3 742 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 PHTF2Q8N3S3 785 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 GDPD2Q9HCC8 539 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 CDC14CA4D256 554 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 MYCP01106 439 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 GNRH1P01148 92 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 RHOQP17081 205 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 VAC14Q08AM6 782 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 WASHC4Q2M389 1173 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 VWA5B2Q8N398 1253 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 NLRP3Q96P20 1036 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 GRIP2Q9C0E4 1043 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 CHIC2Q9UKJ5 165 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 ABL2P42684 1182 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLFNL1Q499Z3 407 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC27A3Q5K4L6 730 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 RNFT1Q5M7Z0 435 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 GMCL1Q96IK5 515 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 DOLKQ9UPQ8 538 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 IL2RAP01589 272 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 SOX11P35716 441 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 WDR44Q5JSH3 913 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 RNF135Q8IUD6 432 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 RAB6BQ9NRW1 208 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 DYRK1BQ9Y463 629 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 HRH3Q9Y5N1 445 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 TRIM22Q8IYM9 498 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 NBPF15Q8N660 670 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 CNKSR1Q969H4 720 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 COG6Q9Y2V7 657 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 WASLO00401 505 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLURP2P0DP57 97 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 POU4F2Q12837 409 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 TSGA10IPQ3SY00 556 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 TAS1R3Q7RTX0 852 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 XAGE2Q96GT9 111 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 USP4Q13107 963 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 GAS6Q14393 721 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 MAP7D1Q3KQU3 841 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 ESCO1Q5FWF5 840 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 SIRT1Q96EB6 747 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 H7C1W4 665 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 CENPCQ03188 943 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 SEMA3FQ13275 785 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 PLPP7Q8NBV4 271 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 DBN1Q16643 649 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 ETNK1Q9HBU6 452 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 ADAMTS2O95450 1211 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 FLIIQ13045 1269 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 SVOPQ8N4V2 548 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 MBIPQ9NS73 344 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 A0A1B0GTH6 734 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 F11P03951 625 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 SCNN1DP51172 638 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 GNASQ5JWF2 1037 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 FOXR1Q6PIV2 292 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 WWC1Q8IX03 1113 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 RHBDD1Q8TEB9 315 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 WHAMMQ8TF30 809 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 POM121Q96HA1 1249 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 GPR25O00155 361 aa6.22□□□□□ -1.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 PIK3CDO00329 1044 aa6.22□□□□□ -1.41
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