RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376215.9

PDSS1-201, Transcript of decaprenyl diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDSS1, Length 1,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1-201ENST00000376215 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa31.3■■■□□ 2.6
PDSS1-201ENST00000376215 SHANK3Q9BYB0 1731 aa31.29■■■□□ 2.6
PDSS1-201ENST00000376215 LRRC37A3O60309 1634 aa31.29■■■□□ 2.6
PDSS1-201ENST00000376215 TATP17735 454 aaPredicted RBP31.28■■■□□ 2.6
PDSS1-201ENST00000376215 PHACTR3Q96KR7 559 aa31.28■■■□□ 2.6
PDSS1-201ENST00000376215 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP31.27■■■□□ 2.6
PDSS1-201ENST00000376215 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP31.25■■■□□ 2.59
PDSS1-201ENST00000376215 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP31.25■■■□□ 2.59
PDSS1-201ENST00000376215 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP31.24■■■□□ 2.59
PDSS1-201ENST00000376215 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa31.24■■■□□ 2.59
PDSS1-201ENST00000376215 RUNDC1Q96C34 613 aa31.24■■■□□ 2.59
PDSS1-201ENST00000376215 RXRBP28702 533 aa31.22■■■□□ 2.59
PDSS1-201ENST00000376215 DLG5Q8TDM6 1919 aa31.22■■■□□ 2.59
PDSS1-201ENST00000376215 TNS2Q63HR2 1409 aa31.21■■■□□ 2.59
PDSS1-201ENST00000376215 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa31.2■■■□□ 2.59
PDSS1-201ENST00000376215 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP31.2■■■□□ 2.59
PDSS1-201ENST00000376215 BRWD3Q6RI45 1802 aa31.2■■■□□ 2.59
PDSS1-201ENST00000376215 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP31.2■■■□□ 2.58
PDSS1-201ENST00000376215 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP31.2■■■□□ 2.58
PDSS1-201ENST00000376215 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP31.19■■■□□ 2.58
PDSS1-201ENST00000376215 AMOTQ4VCS5 1084 aa31.18■■■□□ 2.58
PDSS1-201ENST00000376215 A0A0G2JS52 829 aa31.17■■■□□ 2.58
PDSS1-201ENST00000376215 MYT1Q01538 1121 aa31.17■■■□□ 2.58
PDSS1-201ENST00000376215 DDB1Q16531 1140 aa31.17■■■□□ 2.58
PDSS1-201ENST00000376215 SEPT12Q8IYM1 358 aa31.17■■■□□ 2.58
PDSS1-201ENST00000376215 NEFMP07197 916 aa31.16■■■□□ 2.58
PDSS1-201ENST00000376215 SPG7Q9UQ90 795 aa31.16■■■□□ 2.58
PDSS1-201ENST00000376215 EXOC5O00471 708 aa31.16■■■□□ 2.58
PDSS1-201ENST00000376215 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa31.15■■■□□ 2.58
PDSS1-201ENST00000376215 APAF1O14727 1248 aa31.15■■■□□ 2.58
PDSS1-201ENST00000376215 RGS12O14924 1447 aa31.14■■■□□ 2.58
PDSS1-201ENST00000376215 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.58
PDSS1-201ENST00000376215 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP31.14■■■□□ 2.57
PDSS1-201ENST00000376215 CYP27B1O15528 508 aa31.13■■■□□ 2.57
PDSS1-201ENST00000376215 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa31.13■■■□□ 2.57
PDSS1-201ENST00000376215 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa31.13■■■□□ 2.57
PDSS1-201ENST00000376215 GAS2L2Q8NHY3 880 aa31.13■■■□□ 2.57
PDSS1-201ENST00000376215 TMPOP42166 694 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
PDSS1-201ENST00000376215 NFE2L2Q16236 605 aa31.12■■■□□ 2.57
PDSS1-201ENST00000376215 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
PDSS1-201ENST00000376215 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP31.11■■■□□ 2.57
PDSS1-201ENST00000376215 PHKG2P15735 406 aa31.09■■■□□ 2.57
PDSS1-201ENST00000376215 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP31.09■■■□□ 2.57
PDSS1-201ENST00000376215 NEUROD2Q15784 382 aa31.08■■■□□ 2.57
PDSS1-201ENST00000376215 AKAP4Q5JQC9 854 aa31.07■■■□□ 2.56
PDSS1-201ENST00000376215 IFNL2Q8IZJ0 200 aa31.07■■■□□ 2.56
PDSS1-201ENST00000376215 MAP3K5Q99683 1374 aa31.07■■■□□ 2.56
PDSS1-201ENST00000376215 RIPK4P57078 832 aa31.06■■■□□ 2.56
PDSS1-201ENST00000376215 C1orf141Q5JVX7 400 aa31.06■■■□□ 2.56
PDSS1-201ENST00000376215 SCN11AQ9UI33 1791 aa31.05■■■□□ 2.56
PDSS1-201ENST00000376215 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa31.05■■■□□ 2.56
PDSS1-201ENST00000376215 PDE3BQ13370 1112 aa31.05■■■□□ 2.56
PDSS1-201ENST00000376215 GNAT3A8MTJ3 354 aa31.04■■■□□ 2.56
PDSS1-201ENST00000376215 EP400Q96L91 3159 aa31.04■■■□□ 2.56
PDSS1-201ENST00000376215 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa31.03■■■□□ 2.56
PDSS1-201ENST00000376215 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
PDSS1-201ENST00000376215 TRIM35Q9UPQ4 493 aa31.02■■■□□ 2.56
PDSS1-201ENST00000376215 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
PDSS1-201ENST00000376215 FAM182BQ5T319 152 aa31.01■■■□□ 2.55
PDSS1-201ENST00000376215 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa31.01■■■□□ 2.55
PDSS1-201ENST00000376215 KRT27Q7Z3Y8 459 aa31.01■■■□□ 2.55
PDSS1-201ENST00000376215 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP31.01■■■□□ 2.55
PDSS1-201ENST00000376215 DOT1LQ8TEK3 1739 aa31■■■□□ 2.55
PDSS1-201ENST00000376215 KAT6BQ8WYB5 2073 aa30.99■■■□□ 2.55
PDSS1-201ENST00000376215 DCTN1Q14203 1278 aa30.98■■■□□ 2.55
PDSS1-201ENST00000376215 LGR6Q9HBX8 967 aa30.98■■■□□ 2.55
PDSS1-201ENST00000376215 MCM10Q7L590 875 aa30.98■■■□□ 2.55
PDSS1-201ENST00000376215 IL17REQ8NFR9 667 aa30.98■■■□□ 2.55
PDSS1-201ENST00000376215 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP30.97■■■□□ 2.55
PDSS1-201ENST00000376215 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP30.97■■■□□ 2.55
PDSS1-201ENST00000376215 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP30.97■■■□□ 2.55
PDSS1-201ENST00000376215 DCAF5Q96JK2 942 aa30.97■■■□□ 2.55
PDSS1-201ENST00000376215 SBF2Q86WG5 1849 aa30.97■■■□□ 2.55
PDSS1-201ENST00000376215 ITGB4P16144 1822 aa30.96■■■□□ 2.55
PDSS1-201ENST00000376215 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa30.96■■■□□ 2.55
PDSS1-201ENST00000376215 RNMTO43148 476 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.55
PDSS1-201ENST00000376215 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.55
PDSS1-201ENST00000376215 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.55
PDSS1-201ENST00000376215 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.55
PDSS1-201ENST00000376215 LMOD3Q0VAK6 560 aa30.95■■■□□ 2.54
PDSS1-201ENST00000376215 CCDC27Q2M243 656 aa30.95■■■□□ 2.54
PDSS1-201ENST00000376215 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
PDSS1-201ENST00000376215 BCL9O00512 1426 aa30.93■■■□□ 2.54
PDSS1-201ENST00000376215 WWC1Q8IX03 1113 aa30.93■■■□□ 2.54
PDSS1-201ENST00000376215 NGEFQ8N5V2 710 aa30.92■■■□□ 2.54
PDSS1-201ENST00000376215 MRC1P22897 1456 aa30.91■■■□□ 2.54
PDSS1-201ENST00000376215 ZNF521Q96K83 1311 aa30.89■■■□□ 2.54
PDSS1-201ENST00000376215 NHSQ6T4R5 1651 aa30.88■■■□□ 2.53
PDSS1-201ENST00000376215 ACSBG1Q96GR2 724 aa30.87■■■□□ 2.53
PDSS1-201ENST00000376215 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
PDSS1-201ENST00000376215 ERVV-2B6SEH9 535 aa30.87■■■□□ 2.53
PDSS1-201ENST00000376215 FAM196AQ6ZSG2 479 aa30.86■■■□□ 2.53
PDSS1-201ENST00000376215 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP30.85■■■□□ 2.53
PDSS1-201ENST00000376215 SLC52A2Q9HAB3 445 aa30.85■■■□□ 2.53
PDSS1-201ENST00000376215 KCNQ2O43526 872 aa30.84■■■□□ 2.53
PDSS1-201ENST00000376215 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa30.84■■■□□ 2.53
PDSS1-201ENST00000376215 CABP4P57796 275 aa30.83■■■□□ 2.53
PDSS1-201ENST00000376215 TEFQ10587 303 aa30.83■■■□□ 2.53
PDSS1-201ENST00000376215 PTF1AQ7RTS3 328 aa30.82■■■□□ 2.52
PDSS1-201ENST00000376215 ZBED9Q6R2W3 1325 aa30.82■■■□□ 2.52
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