RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 DACH1Q9UI36 760 aa23.98■■□□□ 1.43
CCSAP-203ENST00000366687 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa23.98■■□□□ 1.43
CCSAP-203ENST00000366687 MCM10Q7L590 875 aa23.98■■□□□ 1.43
CCSAP-203ENST00000366687 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
CCSAP-203ENST00000366687 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
CCSAP-203ENST00000366687 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
CCSAP-203ENST00000366687 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
CCSAP-203ENST00000366687 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
CCSAP-203ENST00000366687 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
CCSAP-203ENST00000366687 MAP7D2Q96T17 732 aa23.97■■□□□ 1.43
CCSAP-203ENST00000366687 ATP2B2Q01814 1243 aa23.97■■□□□ 1.43
CCSAP-203ENST00000366687 STARD3NLO95772 234 aa23.97■■□□□ 1.43
CCSAP-203ENST00000366687 TTLL5Q6EMB2 1281 aa23.97■■□□□ 1.43
CCSAP-203ENST00000366687 NUP133Q8WUM0 1156 aa23.97■■□□□ 1.43
CCSAP-203ENST00000366687 IQGAP2Q13576 1575 aa23.96■■□□□ 1.43
CCSAP-203ENST00000366687 SERPINC1P01008 464 aa23.96■■□□□ 1.43
CCSAP-203ENST00000366687 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
CCSAP-203ENST00000366687 ABCC5O15440 1437 aa23.96■■□□□ 1.43
CCSAP-203ENST00000366687 UBAC1Q9BSL1 405 aa23.96■■□□□ 1.43
CCSAP-203ENST00000366687 TDO2P48775 406 aa23.96■■□□□ 1.43
CCSAP-203ENST00000366687 STIM1Q13586 685 aa23.96■■□□□ 1.43
CCSAP-203ENST00000366687 SOGA3Q5TF21 947 aa23.96■■□□□ 1.43
CCSAP-203ENST00000366687 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
CCSAP-203ENST00000366687 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
CCSAP-203ENST00000366687 CD109Q6YHK3 1445 aa23.95■■□□□ 1.43
CCSAP-203ENST00000366687 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa23.95■■□□□ 1.42
CCSAP-203ENST00000366687 RAB11FIP3O75154 756 aa23.95■■□□□ 1.42
CCSAP-203ENST00000366687 MCM4P33991 863 aa23.95■■□□□ 1.42
CCSAP-203ENST00000366687 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
CCSAP-203ENST00000366687 MIS18AQ9NYP9 233 aa23.94■■□□□ 1.42
CCSAP-203ENST00000366687 AMOTQ4VCS5 1084 aa23.94■■□□□ 1.42
CCSAP-203ENST00000366687 SPATA32Q96LK8 384 aa23.94■■□□□ 1.42
CCSAP-203ENST00000366687 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.94■■□□□ 1.42
CCSAP-203ENST00000366687 MX1P20591 662 aa23.93■■□□□ 1.42
CCSAP-203ENST00000366687 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
CCSAP-203ENST00000366687 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
CCSAP-203ENST00000366687 RDXP35241 583 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
CCSAP-203ENST00000366687 STK11IPQ8N1F8 1099 aa23.92■■□□□ 1.42
CCSAP-203ENST00000366687 LRP2BPQ9P2M1 347 aa23.92■■□□□ 1.42
CCSAP-203ENST00000366687 DCTN1Q14203 1278 aa23.92■■□□□ 1.42
CCSAP-203ENST00000366687 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa23.92■■□□□ 1.42
CCSAP-203ENST00000366687 NME9Q86XW9 330 aa23.92■■□□□ 1.42
CCSAP-203ENST00000366687 NUTM1Q86Y26 1132 aa23.92■■□□□ 1.42
CCSAP-203ENST00000366687 SPC24Q8NBT2 197 aa23.92■■□□□ 1.42
CCSAP-203ENST00000366687 RAI14Q9P0K7 980 aa23.92■■□□□ 1.42
CCSAP-203ENST00000366687 IDH1O75874 414 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
CCSAP-203ENST00000366687 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
CCSAP-203ENST00000366687 MYO6Q9UM54 1294 aa23.91■■□□□ 1.42
CCSAP-203ENST00000366687 PPFIBP1Q86W92 1011 aa23.91■■□□□ 1.42
CCSAP-203ENST00000366687 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
CCSAP-203ENST00000366687 GRPEL1Q9HAV7 217 aa23.9■■□□□ 1.42
CCSAP-203ENST00000366687 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
CCSAP-203ENST00000366687 AKAP2Q9Y2D5 859 aa23.9■■□□□ 1.42
CCSAP-203ENST00000366687 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.9■■□□□ 1.42
CCSAP-203ENST00000366687 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.89■■□□□ 1.42
CCSAP-203ENST00000366687 CEP57L1Q8IYX8 460 aa23.89■■□□□ 1.42
CCSAP-203ENST00000366687 WASF1Q92558 559 aa23.89■■□□□ 1.42
CCSAP-203ENST00000366687 IDI1Q13907 227 aa23.89■■□□□ 1.41
CCSAP-203ENST00000366687 NCOA1Q15788 1441 aa23.89■■□□□ 1.41
CCSAP-203ENST00000366687 WASLO00401 505 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
CCSAP-203ENST00000366687 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
CCSAP-203ENST00000366687 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
CCSAP-203ENST00000366687 SYCP1Q15431 976 aa23.89■■□□□ 1.41
CCSAP-203ENST00000366687 AIDAQ96BJ3 306 aa23.89■■□□□ 1.41
CCSAP-203ENST00000366687 NUP62CLQ9H1M0 184 aa23.88■■□□□ 1.41
CCSAP-203ENST00000366687 BRPF3Q9ULD4 1205 aa23.88■■□□□ 1.41
CCSAP-203ENST00000366687 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
CCSAP-203ENST00000366687 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
CCSAP-203ENST00000366687 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
CCSAP-203ENST00000366687 METTL24Q5JXM2 366 aa23.88■■□□□ 1.41
CCSAP-203ENST00000366687 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa23.88■■□□□ 1.41
CCSAP-203ENST00000366687 PHF8Q9UPP1 1060 aa23.88■■□□□ 1.41
CCSAP-203ENST00000366687 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
CCSAP-203ENST00000366687 CASTP20810 708 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
CCSAP-203ENST00000366687 MAP3K1Q13233 1512 aa23.87■■□□□ 1.41
CCSAP-203ENST00000366687 ADGRL1O94910 1474 aa23.87■■□□□ 1.41
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM132AQ24JP5 1023 aa23.87■■□□□ 1.41
CCSAP-203ENST00000366687 CBFA2T2O43439 604 aa23.86■■□□□ 1.41
CCSAP-203ENST00000366687 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
CCSAP-203ENST00000366687 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
CCSAP-203ENST00000366687 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
CCSAP-203ENST00000366687 ABCF2Q9UG63 623 aa23.85■■□□□ 1.41
CCSAP-203ENST00000366687 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa23.85■■□□□ 1.41
CCSAP-203ENST00000366687 ZHX3Q9H4I2 956 aa23.84■■□□□ 1.41
CCSAP-203ENST00000366687 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
CCSAP-203ENST00000366687 TMOD3Q9NYL9 352 aa23.84■■□□□ 1.41
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF652Q9Y2D9 606 aa23.84■■□□□ 1.41
CCSAP-203ENST00000366687 C20orf194Q5TEA3 1177 aa23.83■■□□□ 1.41
CCSAP-203ENST00000366687 DNAAF4Q8WXU2 420 aa23.83■■□□□ 1.41
CCSAP-203ENST00000366687 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
CCSAP-203ENST00000366687 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
CCSAP-203ENST00000366687 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP23.83■■□□□ 1.41
CCSAP-203ENST00000366687 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP23.83■■□□□ 1.415e-7■■■■■ 32.4
CCSAP-203ENST00000366687 TXLNBQ8N3L3 684 aa23.83■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.83■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 FOXO3O43524 673 aa23.82■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 WWC2Q6AWC2 1192 aa23.82■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 DEF6Q9H4E7 631 aa23.82■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 NSD2O96028 1365 aa23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.8 ms