RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 ACSBG1Q96GR2 724 aa20.34■□□□□ 0.85
CSAG1-201ENST00000361211 NHSQ6T4R5 1651 aa20.33■□□□□ 0.85
CSAG1-201ENST00000361211 TATP17735 454 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CSAG1-201ENST00000361211 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CSAG1-201ENST00000361211 KCNQ2O43526 872 aa20.32■□□□□ 0.84
CSAG1-201ENST00000361211 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CSAG1-201ENST00000361211 RREB1Q92766 1687 aa20.32■□□□□ 0.84
CSAG1-201ENST00000361211 PKD1L3Q7Z443 1732 aa20.3■□□□□ 0.84
CSAG1-201ENST00000361211 IGSF1Q8N6C5 1336 aa20.3■□□□□ 0.84
CSAG1-201ENST00000361211 MTHFSP49914 203 aa20.29■□□□□ 0.84
CSAG1-201ENST00000361211 NUP188Q5SRE5 1749 aa20.28■□□□□ 0.84
CSAG1-201ENST00000361211 DOT1LQ8TEK3 1739 aa20.28■□□□□ 0.84
CSAG1-201ENST00000361211 PARD3Q8TEW0 1356 aa20.28■□□□□ 0.84
CSAG1-201ENST00000361211 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CSAG1-201ENST00000361211 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa20.28■□□□□ 0.84
CSAG1-201ENST00000361211 IL13P35225 146 aa20.27■□□□□ 0.84
CSAG1-201ENST00000361211 CYP27B1O15528 508 aa20.26■□□□□ 0.83
CSAG1-201ENST00000361211 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa20.26■□□□□ 0.83
CSAG1-201ENST00000361211 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa20.26■□□□□ 0.83
CSAG1-201ENST00000361211 BTAF1O14981 1849 aa20.25■□□□□ 0.83
CSAG1-201ENST00000361211 PLSCR1O15162 318 aa20.25■□□□□ 0.83
CSAG1-201ENST00000361211 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CSAG1-201ENST00000361211 AEBP1Q8IUX7 1158 aa20.25■□□□□ 0.83
CSAG1-201ENST00000361211 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CSAG1-201ENST00000361211 KAT6BQ8WYB5 2073 aa20.23■□□□□ 0.83
CSAG1-201ENST00000361211 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa20.22■□□□□ 0.83
CSAG1-201ENST00000361211 PROM2Q8N271 834 aa20.22■□□□□ 0.83
CSAG1-201ENST00000361211 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CSAG1-201ENST00000361211 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CSAG1-201ENST00000361211 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CSAG1-201ENST00000361211 SPG7Q9UQ90 795 aa20.21■□□□□ 0.83
CSAG1-201ENST00000361211 KDRP35968 1356 aa20.21■□□□□ 0.83
CSAG1-201ENST00000361211 SULT6B1Q6IMI4 303 aa20.2■□□□□ 0.82
CSAG1-201ENST00000361211 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.82
CSAG1-201ENST00000361211 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa20.19■□□□□ 0.82
CSAG1-201ENST00000361211 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CSAG1-201ENST00000361211 PPP2R1AP30153 589 aa20.18■□□□□ 0.82
CSAG1-201ENST00000361211 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CSAG1-201ENST00000361211 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CSAG1-201ENST00000361211 TXNRD1Q16881 649 aa20.18■□□□□ 0.82
CSAG1-201ENST00000361211 PHKG2P15735 406 aa20.17■□□□□ 0.82
CSAG1-201ENST00000361211 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CSAG1-201ENST00000361211 HMOX1P09601 288 aa20.16■□□□□ 0.82
CSAG1-201ENST00000361211 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CSAG1-201ENST00000361211 IFNL2Q8IZJ0 200 aa20.15■□□□□ 0.82
CSAG1-201ENST00000361211 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
CSAG1-201ENST00000361211 ITGB4P16144 1822 aa20.13■□□□□ 0.81
CSAG1-201ENST00000361211 PAPPAQ13219 1627 aa20.13■□□□□ 0.81
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CSAG1-201ENST00000361211 NBPF14Q5TI25 921 aa20.12■□□□□ 0.81
CSAG1-201ENST00000361211 LRRC4BQ9NT99 713 aa20.12■□□□□ 0.81
CSAG1-201ENST00000361211 LY75O60449 1722 aa20.11■□□□□ 0.81
CSAG1-201ENST00000361211 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CSAG1-201ENST00000361211 AMOTQ4VCS5 1084 aa20.11■□□□□ 0.81
CSAG1-201ENST00000361211 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa20.11■□□□□ 0.81
CSAG1-201ENST00000361211 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
CSAG1-201ENST00000361211 KCNQ4P56696 695 aa20.1■□□□□ 0.81
CSAG1-201ENST00000361211 CFAP53Q96M91 514 aa20.1■□□□□ 0.81
CSAG1-201ENST00000361211 PIGBQ92521 554 aa20.09■□□□□ 0.81
CSAG1-201ENST00000361211 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa20.08■□□□□ 0.81
CSAG1-201ENST00000361211 PALLDQ8WX93 1383 aa20.07■□□□□ 0.8
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF827Q17R98 1081 aa20.06■□□□□ 0.8
CSAG1-201ENST00000361211 C1orf141Q5JVX7 400 aa20.06■□□□□ 0.8
CSAG1-201ENST00000361211 DCAF5Q96JK2 942 aa20.06■□□□□ 0.8
CSAG1-201ENST00000361211 STK32BQ9NY57 414 aa20.06■□□□□ 0.8
CSAG1-201ENST00000361211 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CSAG1-201ENST00000361211 SLC15A2Q16348 729 aa20.05■□□□□ 0.8
CSAG1-201ENST00000361211 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CSAG1-201ENST00000361211 SLC27A3Q5K4L6 730 aa20.05■□□□□ 0.8
CSAG1-201ENST00000361211 TMOD3Q9NYL9 352 aa20.05■□□□□ 0.8
CSAG1-201ENST00000361211 CASZ1Q86V15 1759 aa20.04■□□□□ 0.8
CSAG1-201ENST00000361211 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
CSAG1-201ENST00000361211 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
CSAG1-201ENST00000361211 LRP5O75197 1615 aa20.04■□□□□ 0.8
CSAG1-201ENST00000361211 RALBP1Q15311 655 aa20.03■□□□□ 0.8
CSAG1-201ENST00000361211 RSPH6AQ9H0K4 717 aa20.03■□□□□ 0.8
CSAG1-201ENST00000361211 ERVV-2B6SEH9 535 aa20.02■□□□□ 0.8
CSAG1-201ENST00000361211 AKAP4Q5JQC9 854 aa20.02■□□□□ 0.8
CSAG1-201ENST00000361211 AKT1S1Q96B36 256 aa20.02■□□□□ 0.8
CSAG1-201ENST00000361211 ASAP1Q9ULH1 1129 aa20.02■□□□□ 0.8
CSAG1-201ENST00000361211 NUDCQ9Y266 331 aa20.02■□□□□ 0.8
CSAG1-201ENST00000361211 SCN11AQ9UI33 1791 aa20.01■□□□□ 0.79
CSAG1-201ENST00000361211 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
CSAG1-201ENST00000361211 PRKAR2BP31323 418 aa20.01■□□□□ 0.79
CSAG1-201ENST00000361211 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.01■□□□□ 0.79
CSAG1-201ENST00000361211 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
CSAG1-201ENST00000361211 LGR6Q9HBX8 967 aa20■□□□□ 0.79
CSAG1-201ENST00000361211 ATG3Q9NT62 314 aa20■□□□□ 0.79
CSAG1-201ENST00000361211 C5P01031 1676 aa20■□□□□ 0.79
CSAG1-201ENST00000361211 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa19.99■□□□□ 0.79
CSAG1-201ENST00000361211 CABP4P57796 275 aa19.99■□□□□ 0.79
CSAG1-201ENST00000361211 PHACTR3Q96KR7 559 aa19.99■□□□□ 0.79
CSAG1-201ENST00000361211 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa19.99■□□□□ 0.79
CSAG1-201ENST00000361211 TAF1LQ8IZX4 1826 aa19.98■□□□□ 0.79
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
CSAG1-201ENST00000361211 RNMTO43148 476 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
CSAG1-201ENST00000361211 MRC1P22897 1456 aa19.98■□□□□ 0.79
CSAG1-201ENST00000361211 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
CSAG1-201ENST00000361211 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
CSAG1-201ENST00000361211 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.3 ms