RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359238.6

SNX11-201, Transcript of sorting nexin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX11, Length 2,315 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11-201ENST00000359238 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
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SNX11-201ENST00000359238 KIF24Q5T7B8 1368 aa23.66■■□□□ 1.38
SNX11-201ENST00000359238 ZNF853P0CG23 659 aa23.65■■□□□ 1.38
SNX11-201ENST00000359238 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
SNX11-201ENST00000359238 USP19O94966 1318 aa23.65■■□□□ 1.38
SNX11-201ENST00000359238 KDRP35968 1356 aa23.65■■□□□ 1.38
SNX11-201ENST00000359238 FAM161AQ3B820 660 aa23.64■■□□□ 1.38
SNX11-201ENST00000359238 SLIT3O75094 1523 aa23.64■■□□□ 1.37
SNX11-201ENST00000359238 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
SNX11-201ENST00000359238 RTL1A6NKG5 1358 aa23.64■■□□□ 1.37
SNX11-201ENST00000359238 IP6K1Q92551 441 aa23.63■■□□□ 1.37
SNX11-201ENST00000359238 ALS2Q96Q42 1657 aa23.63■■□□□ 1.37
SNX11-201ENST00000359238 KRT24Q2M2I5 525 aa23.62■■□□□ 1.37
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SNX11-201ENST00000359238 PDE3AQ14432 1141 aa23.62■■□□□ 1.37
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SNX11-201ENST00000359238 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
SNX11-201ENST00000359238 C8orf34Q49A92 452 aa23.6■■□□□ 1.37
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SNX11-201ENST00000359238 RGPD5Q99666 1765 aa23.58■■□□□ 1.37
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SNX11-201ENST00000359238 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa23.54■■□□□ 1.36
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SNX11-201ENST00000359238 KIAA0232Q92628 1395 aa23.45■■□□□ 1.34
SNX11-201ENST00000359238 LRRC37A3O60309 1634 aa23.45■■□□□ 1.34
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SNX11-201ENST00000359238 ERBB3P21860 1342 aa23.45■■□□□ 1.34
SNX11-201ENST00000359238 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa23.44■■□□□ 1.34
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SNX11-201ENST00000359238 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SNX11-201ENST00000359238 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SNX11-201ENST00000359238 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa23.43■■□□□ 1.34
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SNX11-201ENST00000359238 GNAT3A8MTJ3 354 aa23.42■■□□□ 1.34
SNX11-201ENST00000359238 KIF16BQ96L93 1317 aa23.41■■□□□ 1.34
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SNX11-201ENST00000359238 MAP3K5Q99683 1374 aa23.4■■□□□ 1.34
SNX11-201ENST00000359238 TSPYL4Q9UJ04 414 aa23.4■■□□□ 1.34
SNX11-201ENST00000359238 COL18A1P39060 1754 aa23.4■■□□□ 1.34
SNX11-201ENST00000359238 NHSL1Q5SYE7 1610 aa23.4■■□□□ 1.34
SNX11-201ENST00000359238 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
SNX11-201ENST00000359238 NLRP2Q9NX02 1062 aa23.38■■□□□ 1.33
SNX11-201ENST00000359238 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SNX11-201ENST00000359238 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa23.37■■□□□ 1.33
SNX11-201ENST00000359238 RGS3P49796 1198 aa23.37■■□□□ 1.33
SNX11-201ENST00000359238 CPDO75976 1380 aa23.37■■□□□ 1.33
SNX11-201ENST00000359238 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa23.37■■□□□ 1.33
SNX11-201ENST00000359238 ZNF428Q96B54 188 aa23.37■■□□□ 1.33
SNX11-201ENST00000359238 PRDM11Q9NQV5 511 aa23.37■■□□□ 1.33
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SNX11-201ENST00000359238 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa23.36■■□□□ 1.33
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SNX11-201ENST00000359238 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa23.33■■□□□ 1.33
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SNX11-201ENST00000359238 LMO7Q8WWI1 1683 aa23.33■■□□□ 1.33
SNX11-201ENST00000359238 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa23.33■■□□□ 1.33
SNX11-201ENST00000359238 NECTIN2Q92692 538 aa23.33■■□□□ 1.33
SNX11-201ENST00000359238 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
SNX11-201ENST00000359238 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
SNX11-201ENST00000359238 G2E3Q7L622 706 aa23.32■■□□□ 1.32
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