RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354833.7

SERF1A-202, Transcript of small EDRK-rich factor 1A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SERF1A, Length 1,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1A-202ENST00000354833 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP31.2■■■□□ 2.58
SERF1A-202ENST00000354833 ANKRD24Q8TF21 1146 aa31.18■■■□□ 2.58
SERF1A-202ENST00000354833 NCAPD2Q15021 1401 aa31.18■■■□□ 2.58
SERF1A-202ENST00000354833 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP31.18■■■□□ 2.58
SERF1A-202ENST00000354833 AXIN2Q9Y2T1 843 aa31.18■■■□□ 2.58
SERF1A-202ENST00000354833 GNAT3A8MTJ3 354 aa31.17■■■□□ 2.58
SERF1A-202ENST00000354833 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
SERF1A-202ENST00000354833 AAMPQ13685 434 aa31.17■■■□□ 2.58
SERF1A-202ENST00000354833 C8orf58Q8NAV2 365 aa31.17■■■□□ 2.58
SERF1A-202ENST00000354833 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
SERF1A-202ENST00000354833 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP31.16■■■□□ 2.58
SERF1A-202ENST00000354833 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP31.16■■■□□ 2.58
SERF1A-202ENST00000354833 KDM2BQ8NHM5 1336 aa31.16■■■□□ 2.58
SERF1A-202ENST00000354833 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa31.16■■■□□ 2.58
SERF1A-202ENST00000354833 CLUAP1Q96AJ1 413 aa31.16■■■□□ 2.58
SERF1A-202ENST00000354833 MAP3K5Q99683 1374 aa31.16■■■□□ 2.58
SERF1A-202ENST00000354833 TRIM27P14373 513 aa31.15■■■□□ 2.58
SERF1A-202ENST00000354833 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP31.14■■■□□ 2.58
SERF1A-202ENST00000354833 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP31.14■■■□□ 2.58
SERF1A-202ENST00000354833 RGPD2P0DJD1 1756 aa31.13■■■□□ 2.57
SERF1A-202ENST00000354833 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
SERF1A-202ENST00000354833 KIAA0232Q92628 1395 aa31.13■■■□□ 2.57
SERF1A-202ENST00000354833 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa31.13■■■□□ 2.57
SERF1A-202ENST00000354833 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
SERF1A-202ENST00000354833 LRRC37A3O60309 1634 aa31.13■■■□□ 2.57
SERF1A-202ENST00000354833 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
SERF1A-202ENST00000354833 MVPQ14764 893 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
SERF1A-202ENST00000354833 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa31.12■■■□□ 2.57
SERF1A-202ENST00000354833 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP31.11■■■□□ 2.57
SERF1A-202ENST00000354833 CABLES1Q8TDN4 633 aa31.11■■■□□ 2.57
SERF1A-202ENST00000354833 ERBB3P21860 1342 aa31.11■■■□□ 2.57
SERF1A-202ENST00000354833 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP31.1■■■□□ 2.57
SERF1A-202ENST00000354833 ABCC6O95255 1503 aa31.09■■■□□ 2.57
SERF1A-202ENST00000354833 TSPYL4Q9UJ04 414 aa31.08■■■□□ 2.57
SERF1A-202ENST00000354833 IL17REQ8NFR9 667 aa31.07■■■□□ 2.56
SERF1A-202ENST00000354833 CPDO75976 1380 aa31.07■■■□□ 2.56
SERF1A-202ENST00000354833 ARHGAP45Q92619 1136 aa31.06■■■□□ 2.56
SERF1A-202ENST00000354833 COL18A1P39060 1754 aa31.06■■■□□ 2.56
SERF1A-202ENST00000354833 RGPD5Q99666 1765 aa31.06■■■□□ 2.56
SERF1A-202ENST00000354833 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP31.06■■■□□ 2.56
SERF1A-202ENST00000354833 LMO7Q8WWI1 1683 aa31.05■■■□□ 2.56
SERF1A-202ENST00000354833 AMOTQ4VCS5 1084 aa31.05■■■□□ 2.56
SERF1A-202ENST00000354833 MIS18AQ9NYP9 233 aa31.04■■■□□ 2.56
SERF1A-202ENST00000354833 KRT24Q2M2I5 525 aa31.04■■■□□ 2.56
SERF1A-202ENST00000354833 BABAM1Q9NWV8 329 aa31.03■■■□□ 2.56
SERF1A-202ENST00000354833 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa31.02■■■□□ 2.56
SERF1A-202ENST00000354833 DDX19BQ9UMR2 479 aa31.01■■■□□ 2.56
SERF1A-202ENST00000354833 AKAP4Q5JQC9 854 aa31.01■■■□□ 2.55
SERF1A-202ENST00000354833 TMEM57Q8N5G2 664 aa31■■■□□ 2.55
SERF1A-202ENST00000354833 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP30.99■■■□□ 2.55
SERF1A-202ENST00000354833 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP30.99■■■□□ 2.55
SERF1A-202ENST00000354833 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP30.99■■■□□ 2.55
SERF1A-202ENST00000354833 ITPRIPQ8IWB1 547 aa30.99■■■□□ 2.55
SERF1A-202ENST00000354833 NHSL1Q5SYE7 1610 aa30.99■■■□□ 2.55
SERF1A-202ENST00000354833 CHRNA2Q15822 529 aa30.98■■■□□ 2.55
SERF1A-202ENST00000354833 IGHDP01880 384 aa30.97■■■□□ 2.55
SERF1A-202ENST00000354833 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP30.97■■■□□ 2.55
SERF1A-202ENST00000354833 NLRP2Q9NX02 1062 aa30.96■■■□□ 2.55
SERF1A-202ENST00000354833 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa30.96■■■□□ 2.55
SERF1A-202ENST00000354833 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
SERF1A-202ENST00000354833 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
SERF1A-202ENST00000354833 C1orf141Q5JVX7 400 aa30.93■■■□□ 2.54
SERF1A-202ENST00000354833 LGR6Q9HBX8 967 aa30.93■■■□□ 2.54
SERF1A-202ENST00000354833 ABCC4O15439 1325 aa30.93■■■□□ 2.54
SERF1A-202ENST00000354833 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa30.93■■■□□ 2.54
SERF1A-202ENST00000354833 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa30.92■■■□□ 2.54
SERF1A-202ENST00000354833 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP30.91■■■□□ 2.54
SERF1A-202ENST00000354833 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa30.91■■■□□ 2.54
SERF1A-202ENST00000354833 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa30.9■■■□□ 2.54
SERF1A-202ENST00000354833 PRDM11Q9NQV5 511 aa30.89■■■□□ 2.54
SERF1A-202ENST00000354833 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa30.89■■■□□ 2.54
SERF1A-202ENST00000354833 LTBP4Q8N2S1 1624 aa30.88■■■□□ 2.53
SERF1A-202ENST00000354833 RNMTO43148 476 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
SERF1A-202ENST00000354833 ABCA3Q99758 1704 aa30.88■■■□□ 2.53
SERF1A-202ENST00000354833 TATP17735 454 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
SERF1A-202ENST00000354833 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa30.87■■■□□ 2.53
SERF1A-202ENST00000354833 SKAP1Q86WV1 359 aa30.87■■■□□ 2.53
SERF1A-202ENST00000354833 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
SERF1A-202ENST00000354833 PTPRCP08575 1304 aa30.86■■■□□ 2.53
SERF1A-202ENST00000354833 TEFQ10587 303 aa30.86■■■□□ 2.53
SERF1A-202ENST00000354833 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
SERF1A-202ENST00000354833 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP30.86■■■□□ 2.53
SERF1A-202ENST00000354833 MEGF6O75095 1541 aa30.84■■■□□ 2.53
SERF1A-202ENST00000354833 SLC4A2P04920 1241 aa30.84■■■□□ 2.53
SERF1A-202ENST00000354833 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP30.82■■■□□ 2.53
SERF1A-202ENST00000354833 SPG7Q9UQ90 795 aa30.82■■■□□ 2.53
SERF1A-202ENST00000354833 RGS12O14924 1447 aa30.82■■■□□ 2.52
SERF1A-202ENST00000354833 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa30.81■■■□□ 2.52
SERF1A-202ENST00000354833 WDR17Q8IZU2 1322 aa30.81■■■□□ 2.52
SERF1A-202ENST00000354833 CCDC30Q5VVM6 783 aa30.81■■■□□ 2.52
SERF1A-202ENST00000354833 KDM3BQ7LBC6 1761 aa30.81■■■□□ 2.52
SERF1A-202ENST00000354833 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa30.8■■■□□ 2.52
SERF1A-202ENST00000354833 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
SERF1A-202ENST00000354833 STK31Q9BXU1 1019 aa30.8■■■□□ 2.52
SERF1A-202ENST00000354833 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP30.79■■■□□ 2.52
SERF1A-202ENST00000354833 BTBD11A6QL63 1104 aa30.79■■■□□ 2.52
SERF1A-202ENST00000354833 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP30.79■■■□□ 2.52
SERF1A-202ENST00000354833 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
SERF1A-202ENST00000354833 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP30.77■■■□□ 2.52
SERF1A-202ENST00000354833 PHKG2P15735 406 aa30.76■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms