RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VAMP4O75379 141 aa28.09■■■□□ 2.09
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PANK1Q8TE04 598 aa28.09■■■□□ 2.09
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KIF16BQ96L93 1317 aa28.09■■■□□ 2.09
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZBTB7CA1YPR0 619 aa28.09■■■□□ 2.09
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAP3K5Q99683 1374 aa28.07■■■□□ 2.08
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NHSL1Q5SYE7 1610 aa28.07■■■□□ 2.08
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GNAT3A8MTJ3 354 aa28.06■■■□□ 2.08
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USHBP1Q8N6Y0 703 aa28.06■■■□□ 2.08
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANKRD24Q8TF21 1146 aa28.06■■■□□ 2.08
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KIAA0232Q92628 1395 aa28.06■■■□□ 2.08
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RLBP1P12271 317 aa28.05■■■□□ 2.08
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AXIN2Q9Y2T1 843 aa28.05■■■□□ 2.08
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COG6Q9Y2V7 657 aa28.05■■■□□ 2.08
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KDM2BQ8NHM5 1336 aa28.05■■■□□ 2.08
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TSPYL6Q8N831 410 aa28.04■■■□□ 2.08
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CPDO75976 1380 aa28.04■■■□□ 2.08
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa28.03■■■□□ 2.08
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C8orf58Q8NAV2 365 aa28.03■■■□□ 2.08
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ERBB3P21860 1342 aa28.03■■■□□ 2.08
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLEKHG5O94827 1062 aa28.02■■■□□ 2.08
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRIM27P14373 513 aa28.02■■■□□ 2.08
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TNNQ9UQP3 1299 aa28.02■■■□□ 2.08
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.08
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.08
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CLUAP1Q96AJ1 413 aa28.01■■■□□ 2.07
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MVPQ14764 893 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ABCA3Q99758 1704 aa27.99■■■□□ 2.07
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARHGAP45Q92619 1136 aa27.98■■■□□ 2.07
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BABAM1Q9NWV8 329 aa27.98■■■□□ 2.07
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AMOTQ4VCS5 1084 aa27.97■■■□□ 2.07
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa27.97■■■□□ 2.07
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CABLES1Q8TDN4 633 aa27.96■■■□□ 2.07
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IL17REQ8NFR9 667 aa27.96■■■□□ 2.07
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa27.95■■■□□ 2.07
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TSPYL4Q9UJ04 414 aa27.94■■■□□ 2.06
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa27.93■■■□□ 2.06
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LTBP4Q8N2S1 1624 aa27.92■■■□□ 2.06
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AKAP4Q5JQC9 854 aa27.91■■■□□ 2.06
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DDX19BQ9UMR2 479 aa27.91■■■□□ 2.06
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa27.9■■■□□ 2.06
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KRT24Q2M2I5 525 aa27.88■■■□□ 2.05
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KDM3BQ7LBC6 1761 aa27.88■■■□□ 2.05
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MIS18AQ9NYP9 233 aa27.88■■■□□ 2.05
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM57Q8N5G2 664 aa27.87■■■□□ 2.05
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ABCC4O15439 1325 aa27.86■■■□□ 2.05
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CACNA1FO60840 1977 aa27.85■■■□□ 2.05
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CHRNA2Q15822 529 aa27.85■■■□□ 2.05
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ITPRIPQ8IWB1 547 aa27.85■■■□□ 2.05
GADD45GIP1-201ENST00000316939 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa27.85■■■□□ 2.05
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NLRP2Q9NX02 1062 aa27.84■■■□□ 2.05
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C1orf141Q5JVX7 400 aa27.83■■■□□ 2.05
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PKD1L3Q7Z443 1732 aa27.83■■■□□ 2.05
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IGHDP01880 384 aa27.83■■■□□ 2.05
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa27.83■■■□□ 2.05
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa27.82■■■□□ 2.04
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP27.82■■■□□ 2.04
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LGR6Q9HBX8 967 aa27.81■■■□□ 2.04
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRDM11Q9NQV5 511 aa27.81■■■□□ 2.04
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MEGF6O75095 1541 aa27.81■■■□□ 2.04
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa27.8■■■□□ 2.04
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa27.8■■■□□ 2.04
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PTPRCP08575 1304 aa27.79■■■□□ 2.04
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SCN11AQ9UI33 1791 aa27.79■■■□□ 2.04
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RNMTO43148 476 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TATP17735 454 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RGS12O14924 1447 aa27.78■■■□□ 2.04
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WDR17Q8IZU2 1322 aa27.77■■■□□ 2.04
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TEFQ10587 303 aa27.76■■■□□ 2.03
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa27.76■■■□□ 2.03
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPG7Q9UQ90 795 aa27.76■■■□□ 2.03
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC4A2P04920 1241 aa27.73■■■□□ 2.03
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HOXB7P09629 217 aa27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms