RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301021.7

TRAPPC2L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 2 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC2L, Length 2,215 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MBD3O95983 291 aa21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC2L-201ENST00000301021 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SYCE3A1L190 88 aa21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ARHGAP23Q9P227 1491 aa21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PIBF1Q8WXW3 757 aa21.83■■□□□ 1.08
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SLIT1O75093 1534 aa21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PTMAP06454 111 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC2L-201ENST00000301021 IL16Q14005 1332 aa21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PKP1Q13835 747 aa21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ANKRD45Q5TZF3 282 aa21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC2L-201ENST00000301021 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC2L-201ENST00000301021 EID1Q9Y6B2 187 aa21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MTHFSP49914 203 aa21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CBX1P83916 185 aa21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ADAMTSL3P82987 1691 aa21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TAF3Q5VWG9 929 aa21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CDK19Q9BWU1 502 aa21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KIF3AQ9Y496 699 aa21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ALDH1L2Q3SY69 923 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC2L-201ENST00000301021 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZDHHC9Q9Y397 364 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TECPR2O15040 1411 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ATP2B3Q16720 1220 aa21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SLC26A8Q96RN1 970 aa21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TSPY26PQ9H489 355 aa21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ATAD2Q6PL18 1390 aa21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PDE4CQ08493 712 aa21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SIRT1Q96EB6 747 aa21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SPTLC3Q9NUV7 552 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ST18O60284 1047 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RNF214Q8ND24 703 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FAM135BQ49AJ0 1406 aa21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 UVSSAQ2YD98 709 aa21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 USP26Q9BXU7 913 aa21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KNDC1Q76NI1 1749 aa21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FAM184AQ8NB25 1140 aa21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CPS1P31327 1500 aa21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 A0A1W2PP64 1363 aa21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ROBO2Q9HCK4 1378 aa21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TSC1Q92574 1164 aa21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TRIM35Q9UPQ4 493 aa21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NSD2O96028 1365 aa21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PIK3R4Q99570 1358 aa21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TMPOP42166 694 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 BCL2L12Q9HB09 334 aa21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PTPRUQ92729 1446 aa21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PDCL2Q8N4E4 241 aa21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNF428Q96B54 188 aa21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PHF14O94880 888 aa21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PLEKHF1Q96S99 279 aa21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CD163L1Q9NR16 1453 aa21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TBX22Q9Y458 520 aa21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC2L-201ENST00000301021 WASLO00401 505 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CABP1Q9NZU7 370 aa21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ANKRD7Q92527 254 aa21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC2L-201ENST00000301021 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FEZ1Q99689 392 aa21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TERF2IPQ9NYB0 399 aa21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PTCH1Q13635 1447 aa21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ARHGAP45Q92619 1136 aa21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC2L-201ENST00000301021 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TTC22Q5TAA0 569 aa21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SIRT2Q8IXJ6 389 aa21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TMEM51Q9NW97 253 aa21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC2L-201ENST00000301021 BRD1O95696 1058 aa21.64■■□□□ 1.06
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CTIFO43310 598 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DIP2AQ14689 1571 aa21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SPDYE4A6NLX3 237 aa21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CASC1Q6TDU7 716 aa21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CHAMP1Q96JM3 812 aa21.61■■□□□ 1.05
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