RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296425.9

PGRMC2-201, Transcript of progesterone receptor membrane component 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGRMC2, Length 2,767 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRMC2-201ENST00000296425 TNNQ9UQP3 1299 aa27.34■■□□□ 1.97
PGRMC2-201ENST00000296425 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
PGRMC2-201ENST00000296425 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
PGRMC2-201ENST00000296425 TSPYL6Q8N831 410 aa27.32■■□□□ 1.96
PGRMC2-201ENST00000296425 CRB1P82279 1406 aa27.32■■□□□ 1.96
PGRMC2-201ENST00000296425 ALS2Q96Q42 1657 aa27.31■■□□□ 1.96
PGRMC2-201ENST00000296425 C8orf58Q8NAV2 365 aa27.3■■□□□ 1.96
PGRMC2-201ENST00000296425 KIAA0232Q92628 1395 aa27.29■■□□□ 1.96
PGRMC2-201ENST00000296425 ARHGAP45Q92619 1136 aa27.29■■□□□ 1.96
PGRMC2-201ENST00000296425 ZBTB7CA1YPR0 619 aa27.28■■□□□ 1.96
PGRMC2-201ENST00000296425 GNAT3A8MTJ3 354 aa27.28■■□□□ 1.96
PGRMC2-201ENST00000296425 NBPF6Q5VWK0 638 aa27.28■■□□□ 1.96
PGRMC2-201ENST00000296425 NBPF4Q96M43 638 aa27.28■■□□□ 1.96
PGRMC2-201ENST00000296425 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
PGRMC2-201ENST00000296425 DDX19BQ9UMR2 479 aa27.27■■□□□ 1.96
PGRMC2-201ENST00000296425 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.96
PGRMC2-201ENST00000296425 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
PGRMC2-201ENST00000296425 USHBP1Q8N6Y0 703 aa27.25■■□□□ 1.95
PGRMC2-201ENST00000296425 MAP3K5Q99683 1374 aa27.25■■□□□ 1.95
PGRMC2-201ENST00000296425 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
PGRMC2-201ENST00000296425 TNS3Q68CZ2 1445 aa27.23■■□□□ 1.95
PGRMC2-201ENST00000296425 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
PGRMC2-201ENST00000296425 NCAPD2Q15021 1401 aa27.22■■□□□ 1.95
PGRMC2-201ENST00000296425 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
PGRMC2-201ENST00000296425 IGHDP01880 384 aa27.22■■□□□ 1.95
PGRMC2-201ENST00000296425 ITPRIPQ8IWB1 547 aa27.22■■□□□ 1.95
PGRMC2-201ENST00000296425 ANKRD24Q8TF21 1146 aa27.21■■□□□ 1.95
PGRMC2-201ENST00000296425 PXDNQ92626 1479 aa27.21■■□□□ 1.95
PGRMC2-201ENST00000296425 PLEKHG5O94827 1062 aa27.2■■□□□ 1.95
PGRMC2-201ENST00000296425 TSPYL4Q9UJ04 414 aa27.2■■□□□ 1.95
PGRMC2-201ENST00000296425 TMEM57Q8N5G2 664 aa27.2■■□□□ 1.94
PGRMC2-201ENST00000296425 BABAM1Q9NWV8 329 aa27.2■■□□□ 1.94
PGRMC2-201ENST00000296425 BRINP3Q76B58 766 aa27.2■■□□□ 1.94
PGRMC2-201ENST00000296425 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa27.2■■□□□ 1.94
PGRMC2-201ENST00000296425 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa27.19■■□□□ 1.94
PGRMC2-201ENST00000296425 LRRC37A3O60309 1634 aa27.19■■□□□ 1.94
PGRMC2-201ENST00000296425 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
PGRMC2-201ENST00000296425 AXIN2Q9Y2T1 843 aa27.18■■□□□ 1.94
PGRMC2-201ENST00000296425 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
PGRMC2-201ENST00000296425 IL17REQ8NFR9 667 aa27.17■■□□□ 1.94
PGRMC2-201ENST00000296425 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
PGRMC2-201ENST00000296425 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
PGRMC2-201ENST00000296425 SLAIN2Q9P270 581 aa27.17■■□□□ 1.94
PGRMC2-201ENST00000296425 AMOTQ4VCS5 1084 aa27.16■■□□□ 1.94
PGRMC2-201ENST00000296425 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
PGRMC2-201ENST00000296425 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
PGRMC2-201ENST00000296425 ERBB3P21860 1342 aa27.15■■□□□ 1.94
PGRMC2-201ENST00000296425 MIS18AQ9NYP9 233 aa27.14■■□□□ 1.94
PGRMC2-201ENST00000296425 KRT24Q2M2I5 525 aa27.14■■□□□ 1.94
PGRMC2-201ENST00000296425 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa27.14■■□□□ 1.93
PGRMC2-201ENST00000296425 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.93
PGRMC2-201ENST00000296425 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa27.14■■□□□ 1.93
PGRMC2-201ENST00000296425 ABCC4O15439 1325 aa27.13■■□□□ 1.93
PGRMC2-201ENST00000296425 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa27.13■■□□□ 1.93
PGRMC2-201ENST00000296425 RGPD2P0DJD1 1756 aa27.12■■□□□ 1.93
PGRMC2-201ENST00000296425 ABCC6O95255 1503 aa27.12■■□□□ 1.93
PGRMC2-201ENST00000296425 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
PGRMC2-201ENST00000296425 AKAP4Q5JQC9 854 aa27.11■■□□□ 1.93
PGRMC2-201ENST00000296425 SKAP1Q86WV1 359 aa27.11■■□□□ 1.93
PGRMC2-201ENST00000296425 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
PGRMC2-201ENST00000296425 PDE4AP27815 886 aa27.09■■□□□ 1.93
PGRMC2-201ENST00000296425 CPDO75976 1380 aa27.09■■□□□ 1.93
PGRMC2-201ENST00000296425 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
PGRMC2-201ENST00000296425 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
PGRMC2-201ENST00000296425 CABLES1Q8TDN4 633 aa27.08■■□□□ 1.92
PGRMC2-201ENST00000296425 PTPRCP08575 1304 aa27.08■■□□□ 1.92
PGRMC2-201ENST00000296425 BACH2Q9BYV9 841 aa27.07■■□□□ 1.92
PGRMC2-201ENST00000296425 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
PGRMC2-201ENST00000296425 LMO7Q8WWI1 1683 aa27.06■■□□□ 1.92
PGRMC2-201ENST00000296425 C1orf141Q5JVX7 400 aa27.05■■□□□ 1.92
PGRMC2-201ENST00000296425 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa27.05■■□□□ 1.92
PGRMC2-201ENST00000296425 COL18A1P39060 1754 aa27.05■■□□□ 1.92
PGRMC2-201ENST00000296425 RGPD5Q99666 1765 aa27.04■■□□□ 1.92
PGRMC2-201ENST00000296425 SLC4A2P04920 1241 aa27.03■■□□□ 1.92
PGRMC2-201ENST00000296425 RGS3P49796 1198 aa27.03■■□□□ 1.92
PGRMC2-201ENST00000296425 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa27.03■■□□□ 1.92
PGRMC2-201ENST00000296425 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa27.02■■□□□ 1.92
PGRMC2-201ENST00000296425 LGR6Q9HBX8 967 aa27.02■■□□□ 1.92
PGRMC2-201ENST00000296425 NLRP2Q9NX02 1062 aa27.02■■□□□ 1.92
PGRMC2-201ENST00000296425 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
PGRMC2-201ENST00000296425 CCDC30Q5VVM6 783 aa27.01■■□□□ 1.91
PGRMC2-201ENST00000296425 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa27.01■■□□□ 1.91
PGRMC2-201ENST00000296425 STK31Q9BXU1 1019 aa27.01■■□□□ 1.91
PGRMC2-201ENST00000296425 TEFQ10587 303 aa27■■□□□ 1.91
PGRMC2-201ENST00000296425 RGS12O14924 1447 aa26.99■■□□□ 1.91
PGRMC2-201ENST00000296425 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
PGRMC2-201ENST00000296425 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.98■■□□□ 1.91
PGRMC2-201ENST00000296425 RNMTO43148 476 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
PGRMC2-201ENST00000296425 CHRNA2Q15822 529 aa26.98■■□□□ 1.91
PGRMC2-201ENST00000296425 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa26.97■■□□□ 1.91
PGRMC2-201ENST00000296425 CHMP4AQ9BY43 222 aa26.97■■□□□ 1.91
PGRMC2-201ENST00000296425 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP26.97■■□□□ 1.913e-7■□□□□ 9.1
PGRMC2-201ENST00000296425 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa26.97■■□□□ 1.91
PGRMC2-201ENST00000296425 TATP17735 454 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
PGRMC2-201ENST00000296425 FAM161AQ3B820 660 aa26.96■■□□□ 1.91
PGRMC2-201ENST00000296425 SMC5Q8IY18 1101 aa26.96■■□□□ 1.91
PGRMC2-201ENST00000296425 HOXB7P09629 217 aa26.95■■□□□ 1.91
PGRMC2-201ENST00000296425 SPG7Q9UQ90 795 aa26.94■■□□□ 1.9
PGRMC2-201ENST00000296425 BTBD11A6QL63 1104 aa26.93■■□□□ 1.9
PGRMC2-201ENST00000296425 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.3 ms