RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261590.12

DSG2-201, Transcript of desmoglein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DSG2, Length 5,831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG2-201ENST00000261590 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa26.08■■□□□ 1.76
DSG2-201ENST00000261590 URI1O94763 535 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.76
DSG2-201ENST00000261590 MICALCLQ6ZW33 695 aa26.07■■□□□ 1.76
DSG2-201ENST00000261590 KIF18AQ8NI77 898 aa26.07■■□□□ 1.76
DSG2-201ENST00000261590 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.07■■□□□ 1.76
DSG2-201ENST00000261590 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa26.07■■□□□ 1.76
DSG2-201ENST00000261590 CTNNA3Q9UI47 895 aa26.07■■□□□ 1.76
DSG2-201ENST00000261590 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
DSG2-201ENST00000261590 TDO2P48775 406 aa26.07■■□□□ 1.76
DSG2-201ENST00000261590 UBE4AQ14139 1066 aa26.06■■□□□ 1.76
DSG2-201ENST00000261590 AACSQ86V21 672 aa26.06■■□□□ 1.76
DSG2-201ENST00000261590 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
DSG2-201ENST00000261590 CEP131Q9UPN4 1083 aa26.06■■□□□ 1.76
DSG2-201ENST00000261590 BCAR3O75815 825 aa26.06■■□□□ 1.76
DSG2-201ENST00000261590 CCDC178Q5BJE1 867 aa26.06■■□□□ 1.76
DSG2-201ENST00000261590 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
DSG2-201ENST00000261590 PIBF1Q8WXW3 757 aa26.06■■□□□ 1.76
DSG2-201ENST00000261590 DDX11Q96FC9 970 aa26.06■■□□□ 1.76
DSG2-201ENST00000261590 CHD1LQ86WJ1 897 aa26.05■■□□□ 1.76
DSG2-201ENST00000261590 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa26.05■■□□□ 1.76
DSG2-201ENST00000261590 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP26.05■■□□□ 1.76
DSG2-201ENST00000261590 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
DSG2-201ENST00000261590 MYZAPP0CAP1 466 aa26.05■■□□□ 1.76
DSG2-201ENST00000261590 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
DSG2-201ENST00000261590 KRT32Q14532 448 aa26.05■■□□□ 1.76
DSG2-201ENST00000261590 ZNF428Q96B54 188 aa26.05■■□□□ 1.76
DSG2-201ENST00000261590 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP26.03■■□□□ 1.76
DSG2-201ENST00000261590 FKBP15Q5T1M5 1219 aa26.03■■□□□ 1.76
DSG2-201ENST00000261590 TRERF1Q96PN7 1200 aa26.03■■□□□ 1.76
DSG2-201ENST00000261590 PPM1EQ8WY54 764 aa26.03■■□□□ 1.76
DSG2-201ENST00000261590 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
DSG2-201ENST00000261590 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
DSG2-201ENST00000261590 RAI14Q9P0K7 980 aa26.03■■□□□ 1.76
DSG2-201ENST00000261590 PPP2R1AP30153 589 aa26.02■■□□□ 1.76
DSG2-201ENST00000261590 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
DSG2-201ENST00000261590 FAM107BQ9H098 131 aa26.02■■□□□ 1.76
DSG2-201ENST00000261590 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
DSG2-201ENST00000261590 MPHOSPH8Q99549 860 aa26.02■■□□□ 1.76
DSG2-201ENST00000261590 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa26.01■■□□□ 1.76
DSG2-201ENST00000261590 GPATCH11Q8N954 259 aa26.01■■□□□ 1.76
DSG2-201ENST00000261590 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.01■■□□□ 1.75
DSG2-201ENST00000261590 USP5P45974 858 aa26.01■■□□□ 1.75
DSG2-201ENST00000261590 CCDC175P0C221 793 aa26.01■■□□□ 1.75
DSG2-201ENST00000261590 JPH4Q96JJ6 628 aa26.01■■□□□ 1.75
DSG2-201ENST00000261590 DNA2P51530 1060 aa26■■□□□ 1.75
DSG2-201ENST00000261590 TOP1P11387 765 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
DSG2-201ENST00000261590 ABTB2Q8N961 1025 aa26■■□□□ 1.75
DSG2-201ENST00000261590 VPS36Q86VN1 386 aa25.99■■□□□ 1.75
DSG2-201ENST00000261590 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
DSG2-201ENST00000261590 ANO10Q9NW15 660 aa25.99■■□□□ 1.75
DSG2-201ENST00000261590 KLHL10Q6JEL2 608 aa25.99■■□□□ 1.75
DSG2-201ENST00000261590 CASTP20810 708 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
DSG2-201ENST00000261590 NACADO15069 1562 aa25.99■■□□□ 1.75
DSG2-201ENST00000261590 HOOK3Q86VS8 718 aa25.99■■□□□ 1.75
DSG2-201ENST00000261590 PAFAH1B1P43034 410 aa25.98■■□□□ 1.75
DSG2-201ENST00000261590 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
DSG2-201ENST00000261590 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.98■■□□□ 1.75
DSG2-201ENST00000261590 STAC3Q96MF2 364 aa25.98■■□□□ 1.75
DSG2-201ENST00000261590 TSG101Q99816 390 aa25.98■■□□□ 1.75
DSG2-201ENST00000261590 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP25.98■■□□□ 1.757e-13■■■□□ 15.5
DSG2-201ENST00000261590 MVPQ14764 893 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
DSG2-201ENST00000261590 SPECC1Q5M775 1068 aa25.98■■□□□ 1.75
DSG2-201ENST00000261590 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
DSG2-201ENST00000261590 FERMT3Q86UX7 667 aa25.97■■□□□ 1.75
DSG2-201ENST00000261590 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
DSG2-201ENST00000261590 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.97■■□□□ 1.75
DSG2-201ENST00000261590 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
DSG2-201ENST00000261590 SRGAP3O43295 1099 aa25.96■■□□□ 1.75
DSG2-201ENST00000261590 CLIP2Q9UDT6 1046 aa25.96■■□□□ 1.75
DSG2-201ENST00000261590 GPRASP1Q5JY77 1395 aa25.96■■□□□ 1.75
DSG2-201ENST00000261590 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa25.96■■□□□ 1.75
DSG2-201ENST00000261590 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
DSG2-201ENST00000261590 MACROD2A1Z1Q3 448 aa25.95■■□□□ 1.74
DSG2-201ENST00000261590 USO1O60763 962 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
DSG2-201ENST00000261590 MYL6BP14649 208 aa25.95■■□□□ 1.74
DSG2-201ENST00000261590 TATP17735 454 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
DSG2-201ENST00000261590 CCDC183Q5T5S1 534 aa25.95■■□□□ 1.74
DSG2-201ENST00000261590 SPATA24Q86W54 205 aa25.94■■□□□ 1.74
DSG2-201ENST00000261590 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa25.94■■□□□ 1.74
DSG2-201ENST00000261590 TNNT1P13805 278 aa25.94■■□□□ 1.74
DSG2-201ENST00000261590 TMX1Q9H3N1 280 aa25.94■■□□□ 1.74
DSG2-201ENST00000261590 CABP4P57796 275 aa25.94■■□□□ 1.74
DSG2-201ENST00000261590 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
DSG2-201ENST00000261590 DNAI2Q9GZS0 605 aa25.94■■□□□ 1.74
DSG2-201ENST00000261590 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
DSG2-201ENST00000261590 CCDC83Q8IWF9 413 aa25.93■■□□□ 1.74
DSG2-201ENST00000261590 RBM25P49756 843 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
DSG2-201ENST00000261590 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
DSG2-201ENST00000261590 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
DSG2-201ENST00000261590 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
DSG2-201ENST00000261590 CEP126Q9P2H0 1117 aa25.93■■□□□ 1.74
DSG2-201ENST00000261590 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP25.92■■□□□ 1.74
DSG2-201ENST00000261590 LRP2BPQ9P2M1 347 aa25.92■■□□□ 1.74
DSG2-201ENST00000261590 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
DSG2-201ENST00000261590 AKNAQ7Z591 1439 aa25.91■■□□□ 1.74
DSG2-201ENST00000261590 UBA5Q9GZZ9 404 aa25.91■■□□□ 1.74
DSG2-201ENST00000261590 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
DSG2-201ENST00000261590 CTR9Q6PD62 1173 aa25.91■■□□□ 1.74
DSG2-201ENST00000261590 POTEB2H3BUK9 544 aa25.91■■□□□ 1.74
DSG2-201ENST00000261590 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.7 ms