RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa6.61□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 DTNBO60941 627 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 SSFA2P28290 1259 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 C8orf58Q8NAV2 365 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 DMRT2Q9Y5R5 561 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 PSMA5P28066 241 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 PHACTR3Q96KR7 559 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 TCEANC2Q96MN5 208 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 ACEP12821 1306 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 PI4KAP2A4QPH2 592 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 IDH1O75874 414 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 SEC24BO95487 1268 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 GUCY1B3Q02153 619 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 CCDC57Q2TAC2 916 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 CCDC83Q8IWF9 413 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 CEP126Q9P2H0 1117 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 PHF8Q9UPP1 1060 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 MX1P20591 662 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 CASTP20810 708 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 FLIIQ13045 1269 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 PDILTQ8N807 584 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 MYD88Q99836 296 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 GRPEL1Q9HAV7 217 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 NINLQ9Y2I6 1382 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 ATP10BO94823 1461 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 SYCE3A1L190 88 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 ZBTB3Q9H5J0 574 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 SNRKQ9NRH2 765 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 ABCF2Q9UG63 623 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 UGGT2Q9NYU1 1516 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa6.59□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 KINO60870 393 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 ADAMTS2O95450 1211 aa6.59□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 GPTP24298 496 aa6.59□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 ME1P48163 572 aa6.59□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 SLC39A6Q13433 755 aa6.59□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 TTC39AQ5SRH9 613 aa6.59□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa6.59□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 NUP133Q8WUM0 1156 aa6.59□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa6.59□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 ATP2B2Q01814 1243 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 STK38Q15208 465 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 CAMK4Q16566 473 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 KIF6Q6ZMV9 814 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 MPHOSPH8Q99549 860 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 MBD3O95983 291 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 CCDC158Q5M9N0 1113 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 PDRG1Q9NUG6 133 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 CABLES1Q8TDN4 633 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 KIF1BPQ96EK5 621 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 TSPY26PQ9H489 355 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 POLKQ9UBT6 870 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 A0A087WZG4 1122 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 SMC2O95347 1197 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 PDCP20941 246 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 MCM2P49736 904 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 IKQ13123 557 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 ERC1Q8IUD2 1116 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 AMOTL1Q8IY63 956 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 TRIM34Q9BYJ4 488 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 FANCAO15360 1455 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 MAP3K1Q13233 1512 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 DNAAF4Q8WXU2 420 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa6.56□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 RAB11FIP3O75154 756 aa6.56□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 ALDH1L2Q3SY69 923 aa6.56□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 TPM1P09493 284 aa6.56□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 KRT85P78386 507 aa6.56□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 ESPNB1AK53 854 aa6.56□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 CCT2P78371 535 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 TNMDQ9H2S6 317 aa6.56□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
LMO3-201ENST00000261169 HAND2P61296 217 aa6.55□□□□□ -1.36
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