RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258424.2

COX5B-201, Transcript of cytochrome c oxidase subunit 5B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COX5B, Length 712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5B-201ENST00000258424 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
COX5B-201ENST00000258424 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa28.5■■■□□ 2.15
COX5B-201ENST00000258424 EXOC5O00471 708 aa28.48■■■□□ 2.15
COX5B-201ENST00000258424 NBPF14Q5TI25 921 aa28.48■■■□□ 2.15
COX5B-201ENST00000258424 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
COX5B-201ENST00000258424 SBF2Q86WG5 1849 aa28.48■■■□□ 2.15
COX5B-201ENST00000258424 IGSF1Q8N6C5 1336 aa28.47■■■□□ 2.15
COX5B-201ENST00000258424 PPP2R1AP30153 589 aa28.47■■■□□ 2.15
COX5B-201ENST00000258424 PKD1L3Q7Z443 1732 aa28.46■■■□□ 2.15
COX5B-201ENST00000258424 IL13P35225 146 aa28.45■■■□□ 2.14
COX5B-201ENST00000258424 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa28.43■■■□□ 2.14
COX5B-201ENST00000258424 LRP5O75197 1615 aa28.43■■■□□ 2.14
COX5B-201ENST00000258424 PLSCR1O15162 318 aa28.42■■■□□ 2.14
COX5B-201ENST00000258424 TATP17735 454 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
COX5B-201ENST00000258424 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
COX5B-201ENST00000258424 BCL9O00512 1426 aa28.39■■■□□ 2.14
COX5B-201ENST00000258424 AEBP1Q8IUX7 1158 aa28.39■■■□□ 2.14
COX5B-201ENST00000258424 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
COX5B-201ENST00000258424 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
COX5B-201ENST00000258424 PTF1AQ7RTS3 328 aa28.37■■■□□ 2.13
COX5B-201ENST00000258424 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
COX5B-201ENST00000258424 KDRP35968 1356 aa28.36■■■□□ 2.13
COX5B-201ENST00000258424 NHSQ6T4R5 1651 aa28.35■■■□□ 2.13
COX5B-201ENST00000258424 DOT1LQ8TEK3 1739 aa28.35■■■□□ 2.13
COX5B-201ENST00000258424 RALBP1Q15311 655 aa28.34■■■□□ 2.13
COX5B-201ENST00000258424 SULT6B1Q6IMI4 303 aa28.34■■■□□ 2.13
COX5B-201ENST00000258424 CFAP53Q96M91 514 aa28.32■■■□□ 2.12
COX5B-201ENST00000258424 KAT6BQ8WYB5 2073 aa28.31■■■□□ 2.12
COX5B-201ENST00000258424 RREB1Q92766 1687 aa28.31■■■□□ 2.12
COX5B-201ENST00000258424 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa28.3■■■□□ 2.12
COX5B-201ENST00000258424 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa28.3■■■□□ 2.12
COX5B-201ENST00000258424 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa28.3■■■□□ 2.12
COX5B-201ENST00000258424 CYP27B1O15528 508 aa28.29■■■□□ 2.12
COX5B-201ENST00000258424 HMOX1P09601 288 aa28.29■■■□□ 2.12
COX5B-201ENST00000258424 PROM2Q8N271 834 aa28.29■■■□□ 2.12
COX5B-201ENST00000258424 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa28.29■■■□□ 2.12
COX5B-201ENST00000258424 NUP188Q5SRE5 1749 aa28.27■■■□□ 2.12
COX5B-201ENST00000258424 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
COX5B-201ENST00000258424 ACSBG1Q96GR2 724 aa28.27■■■□□ 2.12
COX5B-201ENST00000258424 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
COX5B-201ENST00000258424 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP28.27■■■□□ 2.12
COX5B-201ENST00000258424 SPG7Q9UQ90 795 aa28.27■■■□□ 2.12
COX5B-201ENST00000258424 BTAF1O14981 1849 aa28.27■■■□□ 2.12
COX5B-201ENST00000258424 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
COX5B-201ENST00000258424 KCNQ2O43526 872 aa28.25■■■□□ 2.11
COX5B-201ENST00000258424 SPON1Q9HCB6 807 aa28.25■■■□□ 2.11
COX5B-201ENST00000258424 TXNRD1Q16881 649 aa28.23■■■□□ 2.11
COX5B-201ENST00000258424 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
COX5B-201ENST00000258424 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
COX5B-201ENST00000258424 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa28.22■■■□□ 2.11
COX5B-201ENST00000258424 ITGB4P16144 1822 aa28.22■■■□□ 2.11
COX5B-201ENST00000258424 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
COX5B-201ENST00000258424 PHKG2P15735 406 aa28.2■■■□□ 2.1
COX5B-201ENST00000258424 NUDCQ9Y266 331 aa28.2■■■□□ 2.1
COX5B-201ENST00000258424 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
COX5B-201ENST00000258424 AMOTQ4VCS5 1084 aa28.18■■■□□ 2.1
COX5B-201ENST00000258424 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
COX5B-201ENST00000258424 IFNL2Q8IZJ0 200 aa28.18■■■□□ 2.1
COX5B-201ENST00000258424 STK32BQ9NY57 414 aa28.18■■■□□ 2.1
COX5B-201ENST00000258424 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
COX5B-201ENST00000258424 RSPH6AQ9H0K4 717 aa28.17■■■□□ 2.1
COX5B-201ENST00000258424 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
COX5B-201ENST00000258424 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
COX5B-201ENST00000258424 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
COX5B-201ENST00000258424 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP28.16■■■□□ 2.1
COX5B-201ENST00000258424 SLC15A2Q16348 729 aa28.14■■■□□ 2.1
COX5B-201ENST00000258424 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
COX5B-201ENST00000258424 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
COX5B-201ENST00000258424 PRKAR2BP31323 418 aa28.13■■■□□ 2.09
COX5B-201ENST00000258424 SCN11AQ9UI33 1791 aa28.13■■■□□ 2.09
COX5B-201ENST00000258424 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
COX5B-201ENST00000258424 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
COX5B-201ENST00000258424 C1orf141Q5JVX7 400 aa28.09■■■□□ 2.09
COX5B-201ENST00000258424 PHACTR3Q96KR7 559 aa28.09■■■□□ 2.09
COX5B-201ENST00000258424 LY75O60449 1722 aa28.09■■■□□ 2.09
COX5B-201ENST00000258424 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa28.08■■■□□ 2.09
COX5B-201ENST00000258424 FCHSD2O94868 740 aa28.08■■■□□ 2.09
COX5B-201ENST00000258424 ZBTB7AO95365 584 aa28.08■■■□□ 2.09
COX5B-201ENST00000258424 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
COX5B-201ENST00000258424 AKAP4Q5JQC9 854 aa28.06■■■□□ 2.08
COX5B-201ENST00000258424 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa28.06■■■□□ 2.08
COX5B-201ENST00000258424 DCAF5Q96JK2 942 aa28.06■■■□□ 2.08
COX5B-201ENST00000258424 ANP32CO43423 234 aa28.05■■■□□ 2.08
COX5B-201ENST00000258424 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
COX5B-201ENST00000258424 PIGBQ92521 554 aa28.03■■■□□ 2.08
COX5B-201ENST00000258424 DCAF8L1A6NGE4 600 aa28.02■■■□□ 2.08
COX5B-201ENST00000258424 CCDC184Q52MB2 194 aa28.02■■■□□ 2.08
COX5B-201ENST00000258424 GAS2L2Q8NHY3 880 aa28.02■■■□□ 2.08
COX5B-201ENST00000258424 DLG5Q8TDM6 1919 aa28.02■■■□□ 2.08
COX5B-201ENST00000258424 PLEKHF1Q96S99 279 aa28.01■■■□□ 2.07
COX5B-201ENST00000258424 LRRC4BQ9NT99 713 aa28.01■■■□□ 2.07
COX5B-201ENST00000258424 TMOD3Q9NYL9 352 aa28.01■■■□□ 2.07
COX5B-201ENST00000258424 MRC1P22897 1456 aa28.01■■■□□ 2.07
COX5B-201ENST00000258424 MAP3K5Q99683 1374 aa28■■■□□ 2.07
COX5B-201ENST00000258424 ERVV-2B6SEH9 535 aa28■■■□□ 2.07
COX5B-201ENST00000258424 PTGER2P43116 358 aa28■■■□□ 2.07
COX5B-201ENST00000258424 SLC27A3Q5K4L6 730 aa28■■■□□ 2.07
COX5B-201ENST00000258424 PAPPAQ13219 1627 aa28■■■□□ 2.07
COX5B-201ENST00000258424 MTFR1LQ9H019 292 aa27.99■■■□□ 2.07
COX5B-201ENST00000258424 LGR6Q9HBX8 967 aa27.99■■■□□ 2.07
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