RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254667.7

PTPRE-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type E, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRE, Length 5,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRE-201ENST00000254667 KRT85P78386 507 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRE-201ENST00000254667 ACBD3Q9H3P7 528 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRE-201ENST00000254667 PDILTQ8N807 584 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRE-201ENST00000254667 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
PTPRE-201ENST00000254667 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
PTPRE-201ENST00000254667 MCM10Q7L590 875 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRE-201ENST00000254667 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
PTPRE-201ENST00000254667 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRE-201ENST00000254667 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRE-201ENST00000254667 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
PTPRE-201ENST00000254667 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRE-201ENST00000254667 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRE-201ENST00000254667 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRE-201ENST00000254667 KDM4AO75164 1064 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRE-201ENST00000254667 CCP110O43303 1012 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRE-201ENST00000254667 SMARCE1Q969G3 411 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRE-201ENST00000254667 RNF214Q8ND24 703 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRE-201ENST00000254667 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRE-201ENST00000254667 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
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PTPRE-201ENST00000254667 ODF2Q5BJF6 829 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRE-201ENST00000254667 TEX35Q5T0J7 233 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRE-201ENST00000254667 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRE-201ENST00000254667 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PTPRE-201ENST00000254667 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PTPRE-201ENST00000254667 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
PTPRE-201ENST00000254667 NOS1P29475 1434 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRE-201ENST00000254667 SOGA3Q5TF21 947 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRE-201ENST00000254667 DACH1Q9UI36 760 aa22.47■■□□□ 1.19
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PTPRE-201ENST00000254667 TDO2P48775 406 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRE-201ENST00000254667 CCDC173Q0VFZ6 552 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRE-201ENST00000254667 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PTPRE-201ENST00000254667 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRE-201ENST00000254667 KRT18P05783 430 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
PTPRE-201ENST00000254667 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
PTPRE-201ENST00000254667 STK3Q13188 491 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRE-201ENST00000254667 SETQ01105 290 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
PTPRE-201ENST00000254667 RUFY1Q96T51 708 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRE-201ENST00000254667 RAI14Q9P0K7 980 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRE-201ENST00000254667 SMC2O95347 1197 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRE-201ENST00000254667 CCDC192P0DO97 292 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRE-201ENST00000254667 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
PTPRE-201ENST00000254667 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRE-201ENST00000254667 WASF1Q92558 559 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRE-201ENST00000254667 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRE-201ENST00000254667 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
PTPRE-201ENST00000254667 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRE-201ENST00000254667 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
PTPRE-201ENST00000254667 LRP2BPQ9P2M1 347 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRE-201ENST00000254667 PIP4K2BP78356 416 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRE-201ENST00000254667 ATP2B2Q01814 1243 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRE-201ENST00000254667 AK7Q96M32 723 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRE-201ENST00000254667 MX1P20591 662 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRE-201ENST00000254667 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRE-201ENST00000254667 CFAP45Q9UL16 551 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRE-201ENST00000254667 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
PTPRE-201ENST00000254667 STIM1Q13586 685 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRE-201ENST00000254667 ME1P48163 572 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRE-201ENST00000254667 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
PTPRE-201ENST00000254667 NUP133Q8WUM0 1156 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRE-201ENST00000254667 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRE-201ENST00000254667 METTL24Q5JXM2 366 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRE-201ENST00000254667 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PTPRE-201ENST00000254667 HYPKQ9NX55 129 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRE-201ENST00000254667 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRE-201ENST00000254667 AIDAQ96BJ3 306 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRE-201ENST00000254667 PTPRCP08575 1304 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRE-201ENST00000254667 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRE-201ENST00000254667 TNMDQ9H2S6 317 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRE-201ENST00000254667 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
PTPRE-201ENST00000254667 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
PTPRE-201ENST00000254667 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
PTPRE-201ENST00000254667 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.39■■□□□ 1.18
PTPRE-201ENST00000254667 DCTN1Q14203 1278 aa22.39■■□□□ 1.18
PTPRE-201ENST00000254667 IDH1O75874 414 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
PTPRE-201ENST00000254667 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
PTPRE-201ENST00000254667 RDXP35241 583 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
PTPRE-201ENST00000254667 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRE-201ENST00000254667 FOXO3O43524 673 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRE-201ENST00000254667 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
PTPRE-201ENST00000254667 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRE-201ENST00000254667 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRE-201ENST00000254667 ZNF287Q9HBT7 754 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRE-201ENST00000254667 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRE-201ENST00000254667 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
PTPRE-201ENST00000254667 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PTPRE-201ENST00000254667 WWC2Q6AWC2 1192 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRE-201ENST00000254667 HSP90B2PQ58FF3 399 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRE-201ENST00000254667 MYD88Q99836 296 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRE-201ENST00000254667 CAGE1Q8TC20 777 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRE-201ENST00000254667 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PTPRE-201ENST00000254667 MYO6Q9UM54 1294 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRE-201ENST00000254667 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRE-201ENST00000254667 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
PTPRE-201ENST00000254667 SPATA32Q96LK8 384 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRE-201ENST00000254667 ZPR1O75312 459 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRE-201ENST00000254667 TMEM132AQ24JP5 1023 aa22.36■■□□□ 1.17
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