RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243108.4

HOXC6-201, Transcript of homeobox C6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC6, Length 1,733 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6-201ENST00000243108 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.58■■□□□ 1.37
HOXC6-201ENST00000243108 USHBP1Q8N6Y0 703 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXC6-201ENST00000243108 ACSBG1Q96GR2 724 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXC6-201ENST00000243108 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
HOXC6-201ENST00000243108 INSRP06213 1382 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXC6-201ENST00000243108 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXC6-201ENST00000243108 FLT4P35916 1363 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXC6-201ENST00000243108 PANK3Q9H999 370 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXC6-201ENST00000243108 BTAF1O14981 1849 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXC6-201ENST00000243108 KIF24Q5T7B8 1368 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXC6-201ENST00000243108 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
HOXC6-201ENST00000243108 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
HOXC6-201ENST00000243108 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
HOXC6-201ENST00000243108 NBPF14Q5TI25 921 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXC6-201ENST00000243108 POLKQ9UBT6 870 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXC6-201ENST00000243108 DOT1LQ8TEK3 1739 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXC6-201ENST00000243108 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
HOXC6-201ENST00000243108 TXNRD1Q16881 649 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXC6-201ENST00000243108 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
HOXC6-201ENST00000243108 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
HOXC6-201ENST00000243108 NCAPD2Q15021 1401 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXC6-201ENST00000243108 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
HOXC6-201ENST00000243108 CASZ1Q86V15 1759 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXC6-201ENST00000243108 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXC6-201ENST00000243108 NSD2O96028 1365 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXC6-201ENST00000243108 PAPPAQ13219 1627 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXC6-201ENST00000243108 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
HOXC6-201ENST00000243108 EYA1Q99502 592 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXC6-201ENST00000243108 PKD1L3Q7Z443 1732 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXC6-201ENST00000243108 TATP17735 454 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
HOXC6-201ENST00000243108 LRRC4BQ9NT99 713 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXC6-201ENST00000243108 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXC6-201ENST00000243108 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
HOXC6-201ENST00000243108 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
HOXC6-201ENST00000243108 LY75O60449 1722 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXC6-201ENST00000243108 CYP27B1O15528 508 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXC6-201ENST00000243108 CCDC184Q52MB2 194 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXC6-201ENST00000243108 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXC6-201ENST00000243108 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
HOXC6-201ENST00000243108 SLC15A2Q16348 729 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXC6-201ENST00000243108 KNSTRNQ9Y448 316 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXC6-201ENST00000243108 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXC6-201ENST00000243108 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXC6-201ENST00000243108 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
HOXC6-201ENST00000243108 KCNQ4P56696 695 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXC6-201ENST00000243108 MORC1Q86VD1 984 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXC6-201ENST00000243108 STK32BQ9NY57 414 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXC6-201ENST00000243108 ITGB4P16144 1822 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXC6-201ENST00000243108 MRS2Q9HD23 443 aa23.33■■□□□ 1.33
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF827Q17R98 1081 aa23.33■■□□□ 1.32
HOXC6-201ENST00000243108 RALBP1Q15311 655 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXC6-201ENST00000243108 SPON1Q9HCB6 807 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXC6-201ENST00000243108 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXC6-201ENST00000243108 IGSF1Q8N6C5 1336 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXC6-201ENST00000243108 ZBTB7AO95365 584 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXC6-201ENST00000243108 SLC27A3Q5K4L6 730 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXC6-201ENST00000243108 AKT1S1Q96B36 256 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXC6-201ENST00000243108 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
HOXC6-201ENST00000243108 QSER1Q2KHR3 1735 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXC6-201ENST00000243108 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXC6-201ENST00000243108 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP23.26■■□□□ 1.31
HOXC6-201ENST00000243108 SPG7Q9UQ90 795 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXC6-201ENST00000243108 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
HOXC6-201ENST00000243108 PTGER2P43116 358 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXC6-201ENST00000243108 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
HOXC6-201ENST00000243108 AEBP1Q8IUX7 1158 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXC6-201ENST00000243108 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
HOXC6-201ENST00000243108 PHKG2P15735 406 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXC6-201ENST00000243108 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
HOXC6-201ENST00000243108 TAF1LQ8IZX4 1826 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXC6-201ENST00000243108 IL13P35225 146 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXC6-201ENST00000243108 PIGBQ92521 554 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXC6-201ENST00000243108 C5P01031 1676 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXC6-201ENST00000243108 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.21■■□□□ 1.31
HOXC6-201ENST00000243108 SGIP1Q9BQI5 828 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXC6-201ENST00000243108 MTHFSP49914 203 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXC6-201ENST00000243108 IFNL2Q8IZJ0 200 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXC6-201ENST00000243108 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
HOXC6-201ENST00000243108 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXC6-201ENST00000243108 PALLDQ8WX93 1383 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXC6-201ENST00000243108 MTFR1LQ9H019 292 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXC6-201ENST00000243108 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
HOXC6-201ENST00000243108 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXC6-201ENST00000243108 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXC6-201ENST00000243108 KDRP35968 1356 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXC6-201ENST00000243108 SULT6B1Q6IMI4 303 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXC6-201ENST00000243108 COL24A1Q17RW2 1714 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXC6-201ENST00000243108 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXC6-201ENST00000243108 UTRNP46939 3433 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXC6-201ENST00000243108 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXC6-201ENST00000243108 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
HOXC6-201ENST00000243108 ASAP1Q9ULH1 1129 aa23.14■■□□□ 1.3
HOXC6-201ENST00000243108 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
HOXC6-201ENST00000243108 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
HOXC6-201ENST00000243108 TMOD3Q9NYL9 352 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
HOXC6-201ENST00000243108 C4BP0C0L5 1744 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXC6-201ENST00000243108 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
HOXC6-201ENST00000243108 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
HOXC6-201ENST00000243108 AMIGO3Q86WK7 504 aa23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms