RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229384.5

GATC-201, Transcript of glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C, humanhuman

TSL 2

Gene GATC, Length 372 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATC-201ENST00000229384 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa20.68■□□□□ 0.9
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GATC-201ENST00000229384 SGIP1Q9BQI5 828 aa20.53■□□□□ 0.88
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GATC-201ENST00000229384 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa20.53■□□□□ 0.88
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GATC-201ENST00000229384 PALLDQ8WX93 1383 aa20.41■□□□□ 0.86
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GATC-201ENST00000229384 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
GATC-201ENST00000229384 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa20.4■□□□□ 0.86
GATC-201ENST00000229384 UBR3Q6ZT12 1888 aa20.39■□□□□ 0.86
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GATC-201ENST00000229384 SYT17Q9BSW7 474 aa20.39■□□□□ 0.85
GATC-201ENST00000229384 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
GATC-201ENST00000229384 AEBP1Q8IUX7 1158 aa20.37■□□□□ 0.85
GATC-201ENST00000229384 ARXQ96QS3 562 aa20.37■□□□□ 0.85
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GATC-201ENST00000229384 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
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GATC-201ENST00000229384 TMOD3Q9NYL9 352 aa20.32■□□□□ 0.84
GATC-201ENST00000229384 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa20.31■□□□□ 0.84
GATC-201ENST00000229384 SIK1P57059 783 aa20.31■□□□□ 0.84
GATC-201ENST00000229384 SULT6B1Q6IMI4 303 aa20.31■□□□□ 0.84
GATC-201ENST00000229384 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa20.31■□□□□ 0.84
GATC-201ENST00000229384 AMOTQ4VCS5 1084 aa20.3■□□□□ 0.84
GATC-201ENST00000229384 LINC00116Q8NCU8 138 aa20.3■□□□□ 0.84
GATC-201ENST00000229384 CHD4Q14839 1912 aa20.29■□□□□ 0.84
GATC-201ENST00000229384 ERVV-2B6SEH9 535 aa20.29■□□□□ 0.84
GATC-201ENST00000229384 ITPK1Q13572 414 aa20.29■□□□□ 0.84
GATC-201ENST00000229384 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
GATC-201ENST00000229384 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
GATC-201ENST00000229384 DCAF5Q96JK2 942 aa20.29■□□□□ 0.84
GATC-201ENST00000229384 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
GATC-201ENST00000229384 SMIM5Q71RC9 77 aa20.28■□□□□ 0.84
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