RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229384.5

GATC-201, Transcript of glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C, humanhuman

TSL 2

Gene GATC, Length 372 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATC-201ENST00000229384 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.23■■■■□ 3.55
GATC-201ENST00000229384 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.31■■■□□ 2.92
GATC-201ENST00000229384 ABCC9O60706 1549 aa32.99■■■□□ 2.87
GATC-201ENST00000229384 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.53■■■□□ 2.64
GATC-201ENST00000229384 NACADO15069 1562 aa31.4■■■□□ 2.62
GATC-201ENST00000229384 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.16■■■□□ 2.58
GATC-201ENST00000229384 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.07■■■□□ 2.56
GATC-201ENST00000229384 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.98■■■□□ 2.55
GATC-201ENST00000229384 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.91■■■□□ 2.54
GATC-201ENST00000229384 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.79■■■□□ 2.52
GATC-201ENST00000229384 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.78■■■□□ 2.52
GATC-201ENST00000229384 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.74■■■□□ 2.51
GATC-201ENST00000229384 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.71■■■□□ 2.51
GATC-201ENST00000229384 SCRIBQ14160 1630 aa30.33■■■□□ 2.45
GATC-201ENST00000229384 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.2■■■□□ 2.43
GATC-201ENST00000229384 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.87■■■□□ 2.37
GATC-201ENST00000229384 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
GATC-201ENST00000229384 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.68■■■□□ 2.34
GATC-201ENST00000229384 NCAPD3P42695 1498 aa28.99■■■□□ 2.23
GATC-201ENST00000229384 SMARCA4P51532 1647 aa28.99■■■□□ 2.23
GATC-201ENST00000229384 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.94■■■□□ 2.22
GATC-201ENST00000229384 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
GATC-201ENST00000229384 SMARCA2P51531 1590 aa28.84■■■□□ 2.21
GATC-201ENST00000229384 HMGXB3Q12766 1538 aa28.79■■■□□ 2.2
GATC-201ENST00000229384 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.73■■■□□ 2.19
GATC-201ENST00000229384 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.71■■■□□ 2.19
GATC-201ENST00000229384 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
GATC-201ENST00000229384 NESP48681 1621 aa28.46■■■□□ 2.15
GATC-201ENST00000229384 WIZO95785 1651 aa28.39■■■□□ 2.14
GATC-201ENST00000229384 ERCC6Q03468 1493 aa28.39■■■□□ 2.13
GATC-201ENST00000229384 CUX2O14529 1486 aa28.32■■■□□ 2.12
GATC-201ENST00000229384 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.28■■■□□ 2.12
GATC-201ENST00000229384 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
GATC-201ENST00000229384 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
GATC-201ENST00000229384 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.14■■■□□ 2.1
GATC-201ENST00000229384 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.09■■■□□ 2.09
GATC-201ENST00000229384 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.05■■■□□ 2.08
GATC-201ENST00000229384 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.01■■■□□ 2.07
GATC-201ENST00000229384 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
GATC-201ENST00000229384 CFTRP13569 1480 aa27.86■■■□□ 2.05
GATC-201ENST00000229384 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.83■■■□□ 2.04
GATC-201ENST00000229384 WDR62O43379 1518 aa27.79■■■□□ 2.04
GATC-201ENST00000229384 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.76■■■□□ 2.04
GATC-201ENST00000229384 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.76■■■□□ 2.03
GATC-201ENST00000229384 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.7■■■□□ 2.02
GATC-201ENST00000229384 PRDM2Q13029 1718 aa27.69■■■□□ 2.02
GATC-201ENST00000229384 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
GATC-201ENST00000229384 TOPBP1Q92547 1522 aa27.3■■□□□ 1.96
GATC-201ENST00000229384 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.22■■□□□ 1.95
GATC-201ENST00000229384 ABCC8Q09428 1581 aa27.21■■□□□ 1.95
GATC-201ENST00000229384 IFT140Q96RY7 1462 aa27.19■■□□□ 1.94
GATC-201ENST00000229384 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
GATC-201ENST00000229384 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
GATC-201ENST00000229384 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
GATC-201ENST00000229384 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
GATC-201ENST00000229384 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
GATC-201ENST00000229384 OSCARQ8IYS5 282 aa27.03■■□□□ 1.92
GATC-201ENST00000229384 CUX1P39880 1505 aa26.95■■□□□ 1.91
GATC-201ENST00000229384 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.94■■□□□ 1.9
GATC-201ENST00000229384 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.93■■□□□ 1.9
GATC-201ENST00000229384 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.89■■□□□ 1.9
GATC-201ENST00000229384 SOGA1O94964 1423 aa26.88■■□□□ 1.89
GATC-201ENST00000229384 CHD1O14646 1710 aa26.83■■□□□ 1.89
GATC-201ENST00000229384 TRIM41Q8WV44 630 aa26.81■■□□□ 1.88
GATC-201ENST00000229384 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
GATC-201ENST00000229384 WDR97A6NE52 1622 aa26.78■■□□□ 1.88
GATC-201ENST00000229384 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.74■■□□□ 1.87
GATC-201ENST00000229384 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.74■■□□□ 1.87
GATC-201ENST00000229384 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.74■■□□□ 1.87
GATC-201ENST00000229384 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.66■■□□□ 1.86
GATC-201ENST00000229384 ARHGEF11O15085 1522 aa26.65■■□□□ 1.86
GATC-201ENST00000229384 GRIN2BQ13224 1484 aa26.62■■□□□ 1.85
GATC-201ENST00000229384 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.61■■□□□ 1.85
GATC-201ENST00000229384 PBRM1Q86U86 1689 aa26.61■■□□□ 1.85
GATC-201ENST00000229384 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.61■■□□□ 1.85
GATC-201ENST00000229384 FBLN2P98095 1184 aa26.6■■□□□ 1.85
GATC-201ENST00000229384 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
GATC-201ENST00000229384 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.59■■□□□ 1.85
GATC-201ENST00000229384 TOP2BQ02880 1626 aa26.58■■□□□ 1.85
GATC-201ENST00000229384 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.57■■□□□ 1.84
GATC-201ENST00000229384 SYNJ1O43426 1573 aa26.57■■□□□ 1.84
GATC-201ENST00000229384 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.53■■□□□ 1.84
GATC-201ENST00000229384 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.5■■□□□ 1.83
GATC-201ENST00000229384 SYNJ2O15056 1496 aa26.5■■□□□ 1.83
GATC-201ENST00000229384 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
GATC-201ENST00000229384 ARAP1Q96P48 1450 aa26.42■■□□□ 1.82
GATC-201ENST00000229384 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.38■■□□□ 1.81
GATC-201ENST00000229384 ADAMTS12P58397 1594 aa26.34■■□□□ 1.81
GATC-201ENST00000229384 GRIN2AQ12879 1464 aa26.3■■□□□ 1.8
GATC-201ENST00000229384 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.28■■□□□ 1.8
GATC-201ENST00000229384 CEP170Q5SW79 1584 aa26.23■■□□□ 1.79
GATC-201ENST00000229384 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.22■■□□□ 1.79
GATC-201ENST00000229384 NUP160Q12769 1436 aa26.22■■□□□ 1.79
GATC-201ENST00000229384 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.13■■□□□ 1.77
GATC-201ENST00000229384 SHROOM2Q13796 1616 aa26.12■■□□□ 1.77
GATC-201ENST00000229384 IGF1RP08069 1367 aa26.01■■□□□ 1.75
GATC-201ENST00000229384 KIF27Q86VH2 1401 aa25.99■■□□□ 1.75
GATC-201ENST00000229384 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.97■■□□□ 1.75
GATC-201ENST00000229384 CUL7Q14999 1698 aa25.95■■□□□ 1.74
GATC-201ENST00000229384 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
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