RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 FAM135BQ49AJ0 1406 aa7.6□□□□□ -1.19
SETX-201ENST00000224140 CAVIN2O95810 425 aa7.6□□□□□ -1.19
SETX-201ENST00000224140 CHD1LQ86WJ1 897 aa7.6□□□□□ -1.19
SETX-201ENST00000224140 TXLNBQ8N3L3 684 aa7.6□□□□□ -1.19
SETX-201ENST00000224140 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
SETX-201ENST00000224140 TSPOAP1O95153 1857 aa7.6□□□□□ -1.19
SETX-201ENST00000224140 CCP110O43303 1012 aa7.6□□□□□ -1.19
SETX-201ENST00000224140 KLHL34Q8N239 644 aa7.6□□□□□ -1.19
SETX-201ENST00000224140 SMC3Q9UQE7 1217 aa7.6□□□□□ -1.19
SETX-201ENST00000224140 CPLX1O14810 134 aa7.59□□□□□ -1.19
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SETX-201ENST00000224140 CCDC70Q6NSX1 233 aa7.59□□□□□ -1.19
SETX-201ENST00000224140 SLC4A2P04920 1241 aa7.59□□□□□ -1.19
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SETX-201ENST00000224140 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa7.58□□□□□ -1.2
SETX-201ENST00000224140 MED14O60244 1454 aa7.58□□□□□ -1.2
SETX-201ENST00000224140 CABP4P57796 275 aa7.58□□□□□ -1.2
SETX-201ENST00000224140 AATKQ6ZMQ8 1374 aa7.58□□□□□ -1.2
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SETX-201ENST00000224140 DUSP27Q5VZP5 1158 aa7.58□□□□□ -1.2
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SETX-201ENST00000224140 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
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SETX-201ENST00000224140 BECN2A8MW95 431 aa7.58□□□□□ -1.2
SETX-201ENST00000224140 ANAPC15P60006 121 aa7.58□□□□□ -1.2
SETX-201ENST00000224140 WASF1Q92558 559 aa7.58□□□□□ -1.2
SETX-201ENST00000224140 DACH1Q9UI36 760 aa7.58□□□□□ -1.2
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SETX-201ENST00000224140 DISP3Q9P2K9 1392 aa7.58□□□□□ -1.2
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SETX-201ENST00000224140 RSPH6AQ9H0K4 717 aa7.57□□□□□ -1.2
SETX-201ENST00000224140 QRICH2Q9H0J4 1663 aa7.57□□□□□ -1.2
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SETX-201ENST00000224140 PLCB2Q00722 1185 aa7.57□□□□□ -1.2
SETX-201ENST00000224140 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
SETX-201ENST00000224140 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
SETX-201ENST00000224140 YEATS2Q9ULM3 1422 aa7.57□□□□□ -1.2
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SETX-201ENST00000224140 CERS3Q8IU89 383 aa7.56□□□□□ -1.2
SETX-201ENST00000224140 BCL2L13Q9BXK5 485 aa7.56□□□□□ -1.2
SETX-201ENST00000224140 UGGT1Q9NYU2 1555 aa7.56□□□□□ -1.2
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SETX-201ENST00000224140 NUTM2FA1L443 756 aa7.56□□□□□ -1.2
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SETX-201ENST00000224140 NT5C2P49902 561 aa7.55□□□□□ -1.2
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SETX-201ENST00000224140 IFNL2Q8IZJ0 200 aa7.55□□□□□ -1.2
SETX-201ENST00000224140 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa7.55□□□□□ -1.2
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SETX-201ENST00000224140 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SETX-201ENST00000224140 TRAF1Q13077 416 aa7.55□□□□□ -1.2
SETX-201ENST00000224140 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa7.55□□□□□ -1.2
SETX-201ENST00000224140 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SETX-201ENST00000224140 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SETX-201ENST00000224140 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
SETX-201ENST00000224140 CACNA1FO60840 1977 aa7.54□□□□□ -1.2
SETX-201ENST00000224140 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa7.54□□□□□ -1.2
SETX-201ENST00000224140 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa7.54□□□□□ -1.2
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SETX-201ENST00000224140 PRDM11Q9NQV5 511 aa7.54□□□□□ -1.2
SETX-201ENST00000224140 AKAP4Q5JQC9 854 aa7.54□□□□□ -1.2
SETX-201ENST00000224140 PLIN1O60240 522 aa7.54□□□□□ -1.2
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