RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000049074.12

Ptprf-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Ptprf, Length 7,656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Epb41l3Q9WV92 929 aa20.63■□□□□ 0.89
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rabep1O35551 862 aa20.62■□□□□ 0.89
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ccdc34Q3UI66 367 aa20.62■□□□□ 0.89
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Slc26a8Q8R0C3 999 aa20.62■□□□□ 0.89
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hs6st3Q9QYK4 470 aa20.62■□□□□ 0.89
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Glg1Q61543 1175 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fam13aQ8BGI4 693 aa20.62■□□□□ 0.89
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Q9D5Q8 446 aa20.62■□□□□ 0.89
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm7347D3YYI9 267 aa20.61■□□□□ 0.89
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Speer4aF8VPX6 267 aa20.61■□□□□ 0.89
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Stim1P70302 685 aa20.61■□□□□ 0.89
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Igflr1Q3U4N7 345 aa20.61■□□□□ 0.89
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Iqca1Q9CUL5 857 aa20.61■□□□□ 0.89
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ccdc39Q9D5Y1 937 aa20.6■□□□□ 0.89
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hmgn5Q9JL35 406 aa20.6■□□□□ 0.89
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Spg7Q3ULF4 781 aa20.6■□□□□ 0.89
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zrsr2Q62377 462 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ncf1Q09014 390 aa20.6■□□□□ 0.89
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Aplp1Q03157 653 aa20.6■□□□□ 0.89
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cnnm3Q32NY4 713 aa20.6■□□□□ 0.89
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cacna2d4Q5RJF7 1116 aa20.6■□□□□ 0.89
Ptprf-201ENSMUST00000049074 AidaQ8C4Q6 305 aa20.6■□□□□ 0.89
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Nsrp1Q5NCR9 542 aa20.59■□□□□ 0.89
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Slc4a8Q8JZR6 1089 aa20.59■□□□□ 0.89
Ptprf-201ENSMUST00000049074 NapbP28663 298 aa20.59■□□□□ 0.89
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Larp1Q6ZQ58 1072 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Atl3Q91YH5 541 aa20.59■□□□□ 0.89
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Crocc2F6XLV1 1638 aa20.58■□□□□ 0.89
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ces1aE9PYP1 563 aa20.58■□□□□ 0.88
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cul5Q9D5V5 780 aa20.58■□□□□ 0.88
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ppp1r21Q3TDD9 780 aa20.58■□□□□ 0.88
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zc3h12cQ5DTV4 884 aa20.57■□□□□ 0.88
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ccnl1Q52KE7 532 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pde4dQ01063 747 aa20.57■□□□□ 0.88
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Brf1Q8CFK2 676 aa20.57■□□□□ 0.88
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tpd52l2Q9CYZ2 220 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ush1cQ9ES64 910 aa20.57■□□□□ 0.88
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Slc7a3P70423 618 aa20.57■□□□□ 0.88
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Soga3Q6NZL0 945 aa20.57■□□□□ 0.88
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pdcd6ipQ9WU78 869 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Irgm2A0A140LIF8 407 aa20.56■□□□□ 0.88
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rhot2Q8JZN7 620 aa20.56■□□□□ 0.88
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Myd88P22366 296 aa20.56■□□□□ 0.88
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Abcd1P48410 736 aa20.56■□□□□ 0.88
Ptprf-201ENSMUST00000049074 IbtkQ6ZPR6 1352 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Myom3A2ABU4 1439 aa20.56■□□□□ 0.88
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mcm10Q0VBD2 885 aa20.56■□□□□ 0.88
Ptprf-201ENSMUST00000049074 AnlnQ8K298 1121 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zbtb21E9Q444 1094 aa20.56■□□□□ 0.88
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tmem132eQ6IEE6 982 aa20.55■□□□□ 0.88
Ptprf-201ENSMUST00000049074 TimelessQ9R1X4 1197 aa20.55■□□□□ 0.88
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Plekhh1Q80TI1 1356 aa20.55■□□□□ 0.88
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mcm2P97310 904 aa20.54■□□□□ 0.88
Ptprf-201ENSMUST00000049074 NefhP19246 1090 aa20.54■□□□□ 0.88
Ptprf-201ENSMUST00000049074 SnrkQ8VDU5 748 aa20.54■□□□□ 0.88
Ptprf-201ENSMUST00000049074 PtprkP35822 1457 aa20.54■□□□□ 0.88
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Sh3d21Q7TSG5 549 aa20.53■□□□□ 0.88
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Smarca5Q91ZW3 1051 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ttc21bQ0HA38 1315 aa20.53■□□□□ 0.88
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa20.53■□□□□ 0.88
Ptprf-201ENSMUST00000049074 OvosQ3UU35 1456 aa20.53■□□□□ 0.88
Ptprf-201ENSMUST00000049074 ItpripQ3TNL8 555 aa20.53■□□□□ 0.88
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ddrgk1Q80WW9 315 aa20.53■□□□□ 0.88
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Taf3Q5HZG4 932 aa20.52■□□□□ 0.88
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ift74Q8BKE9 600 aa20.52■□□□□ 0.88
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Znf287Q9EQB9 759 aa20.52■□□□□ 0.88
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cdkl5Q3UTQ8 938 aa20.52■□□□□ 0.88
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fam170aQ66LM6 333 aa20.52■□□□□ 0.87
Ptprf-201ENSMUST00000049074 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa20.52■□□□□ 0.87
Ptprf-201ENSMUST00000049074 2310002L09RikQ9D7L5 217 aa20.51■□□□□ 0.87
Ptprf-201ENSMUST00000049074 ParvgQ9ERD8 331 aa20.51■□□□□ 0.87
Ptprf-201ENSMUST00000049074 ImmtQ8CAQ8 757 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cog6Q8R3I3 657 aa20.51■□□□□ 0.87
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ddb1Q3U1J4 1140 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rufy2Q8R4C2 606 aa20.51■□□□□ 0.87
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zbtb3Q91X45 518 aa20.51■□□□□ 0.87
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Stxbp4Q9WV89 557 aa20.5■□□□□ 0.87
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Igf1rQ60751 1373 aa20.5■□□□□ 0.87
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ccdc172Q810N9 267 aa20.5■□□□□ 0.87
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mipol1Q9D9F8 279 aa20.49■□□□□ 0.87
Ptprf-201ENSMUST00000049074 CenphQ9QYM8 241 aa20.49■□□□□ 0.87
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa20.49■□□□□ 0.87
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olr1Q9EQ09 363 aa20.49■□□□□ 0.87
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cdc45Q9Z1X9 566 aa20.49■□□□□ 0.87
Ptprf-201ENSMUST00000049074 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ccdc183A2AJB1 534 aa20.49■□□□□ 0.87
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Top1mtQ8R4U6 593 aa20.49■□□□□ 0.87
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ptpdc1Q6NZK8 747 aa20.48■□□□□ 0.87
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ddx58Q6Q899 926 aa20.48■□□□□ 0.87
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Nap1l5Q9JJF0 156 aa20.48■□□□□ 0.87
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fez1Q8K0X8 392 aa20.48■□□□□ 0.87
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gimap8Q75N62 688 aa20.48■□□□□ 0.87
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Map3k2Q61083 619 aa20.48■□□□□ 0.87
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Qtrt2B8ZXI1 415 aa20.47■□□□□ 0.87
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Usp5P56399 858 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zmynd15Q8C0R7 736 aa20.47■□□□□ 0.87
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Slc52a2Q9D8F3 450 aa20.47■□□□□ 0.87
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cep55Q8BT07 462 aa20.47■□□□□ 0.87
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ppp2r3aB2RXC8 1150 aa20.46■□□□□ 0.87
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Irf9Q61179 399 aa20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 118.2 ms