RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021380.9

Trappc6b-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6b, Length 1,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm21663A0A0G2JE01 267 aa30.47■■■□□ 2.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm7361D3Z6R1 267 aa30.47■■■□□ 2.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 5031410I06RikE9Q4E0 267 aa30.47■■■□□ 2.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm1979E9QAN3 267 aa30.47■■■□□ 2.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm5862K7N5V5 267 aa30.47■■■□□ 2.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm10220K7N660 267 aa30.47■■■□□ 2.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ankrd13dQ6PD24 605 aa30.47■■■□□ 2.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PappaQ8R4K8 1624 aa30.46■■■□□ 2.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 TnikP83510 1323 aa30.46■■■□□ 2.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tsen2Q6P7W5 460 aa30.45■■■□□ 2.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa30.45■■■□□ 2.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Amotl1Q9D4H4 968 aa30.45■■■□□ 2.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Abca3Q8R420 1704 aa30.44■■■□□ 2.46
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccnl1Q52KE7 532 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc5a1Q8C3K6 665 aa30.44■■■□□ 2.46
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kiaa0319lQ8K135 1048 aa30.44■■■□□ 2.46
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Phkg2Q9DB30 406 aa30.44■■■□□ 2.46
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Klc3Q91W40 508 aa30.43■■■□□ 2.46
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 GsdmaQ9EST1 446 aa30.41■■■□□ 2.46
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mcm10Q0VBD2 885 aa30.4■■■□□ 2.46
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Chmp7Q8R1T1 451 aa30.39■■■□□ 2.46
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ssfa2Q922B9 1252 aa30.39■■■□□ 2.46
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pdzd9Q9D9M4 266 aa30.39■■■□□ 2.46
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Asic4Q7TNS7 539 aa30.38■■■□□ 2.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Spef2Q8C9J3 1734 aa30.38■■■□□ 2.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Shank3Q4ACU6 1730 aa30.37■■■□□ 2.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Stk31Q99MW1 1018 aa30.37■■■□□ 2.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Crb1Q8VHS2 1405 aa30.35■■■□□ 2.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Aox2Q5SGK3 1345 aa30.34■■■□□ 2.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccdc85cE9Q6B2 420 aa30.33■■■□□ 2.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hdac6Q9Z2V5 1149 aa30.3■■■□□ 2.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Iqcf3Q9D498 203 aa30.29■■■□□ 2.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kif23E9Q5G3 953 aa30.28■■■□□ 2.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ints5Q8CHT3 1018 aa30.28■■■□□ 2.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fchsd2Q3USJ8 740 aa30.27■■■□□ 2.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 TmpoQ61033 693 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tjp1P39447 1745 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Akt1s1Q9D1F4 257 aa30.26■■■□□ 2.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fam198bQ3UPI1 517 aa30.25■■■□□ 2.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gpr150Q8BL07 427 aa30.24■■■□□ 2.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa30.24■■■□□ 2.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Q7TT23 1179 aa30.23■■■□□ 2.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PsdQ5DTT2 1024 aa30.22■■■□□ 2.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa30.22■■■□□ 2.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Bicdl1A0JNT9 577 aa30.21■■■□□ 2.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Jmjd4Q8BFT6 427 aa30.21■■■□□ 2.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cabp2Q9JLK4 216 aa30.21■■■□□ 2.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Trpm3Q5F4S9 1721 aa30.21■■■□□ 2.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Igsf1Q7TQA1 1317 aa30.21■■■□□ 2.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.43
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Atg3Q9CPX6 314 aa30.18■■■□□ 2.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 En2P09066 324 aa30.15■■■□□ 2.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccdc155Q80VJ8 648 aa30.15■■■□□ 2.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CoblQ5NBX1 1337 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 MeiocA2AG06 965 aa30.14■■■□□ 2.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Trpc5Q9QX29 975 aa30.14■■■□□ 2.42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Q4VA45 678 aa30.13■■■□□ 2.41
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dcaf5Q80T85 946 aa30.13■■■□□ 2.41
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa30.13■■■□□ 2.41
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Abcc12Q80WJ6 1366 aa30.13■■■□□ 2.41
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Snap23O09044 210 aa30.12■■■□□ 2.41
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nkx2-3P97334 362 aa30.12■■■□□ 2.41
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa30.12■■■□□ 2.41
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Atf7ipQ7TT18 1306 aa30.12■■■□□ 2.41
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ubr2Q6WKZ8 1755 aa30.12■■■□□ 2.41
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rtf1A2AQ19 715 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Magea1O89006 320 aa30.11■■■□□ 2.41
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Magea5O89009 320 aa30.11■■■□□ 2.41
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Magea2Q9R2A2 320 aa30.11■■■□□ 2.41
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Smg7Q5RJH6 1138 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cap2Q9CYT6 476 aa30.1■■■□□ 2.41
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 AtrnQ9WU60 1428 aa30.1■■■□□ 2.41
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 NppbP40753 121 aa30.09■■■□□ 2.41
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Exoc6Q8R313 802 aa30.08■■■□□ 2.41
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Smarcc1P97496 1104 aa30.07■■■□□ 2.4
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Jdp2P97875 163 aa30.07■■■□□ 2.4
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 IncenpQ9WU62 880 aa30.07■■■□□ 2.4
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 AceP09470 1312 aa30.05■■■□□ 2.4
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Msh6P54276 1358 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sos1Q62245 1319 aa30.04■■■□□ 2.4
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm13023A2A8N2 498 aa30.04■■■□□ 2.4
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Apaf1O88879 1249 aa30.04■■■□□ 2.4
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ric1Q69ZJ7 1422 aa30.04■■■□□ 2.4
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Efcab2Q9CQ46 164 aa30.02■■■□□ 2.4
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Miga2Q8BK03 593 aa30.01■■■□□ 2.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kcnq2Q9Z351 759 aa30■■■□□ 2.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pde4dQ01063 747 aa29.99■■■□□ 2.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 ErfeQ6PGN1 340 aa29.99■■■□□ 2.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Golga2Q921M4 999 aa29.97■■■□□ 2.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Znf541Q0GGX2 1363 aa29.97■■■□□ 2.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tiam2Q6ZPF3 1715 aa29.96■■■□□ 2.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Adcy9P51830 1353 aa29.96■■■□□ 2.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Btbd11Q6GQW0 1109 aa29.96■■■□□ 2.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Emilin1Q99K41 1017 aa29.96■■■□□ 2.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Map4k4P97820 1233 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Chrna2Q91X60 512 aa29.95■■■□□ 2.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Spata31d1bE9QA57 1361 aa29.94■■■□□ 2.38
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cavin4A2AMM0 362 aa29.94■■■□□ 2.38
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zscan21Q07231 555 aa29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.5 ms