RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325897.4

CLVS1-201, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLVS1, Length 3,486 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-201ENST00000325897 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 MMP27Q9H306 513 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 PIGUQ9H490 435 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF556Q9HAH1 456 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 EPB41L5Q9HCM4 733 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ACOXLQ9NUZ1 547 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 NPAP1Q9NZP6 1156 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF221Q9UK13 617 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 SNX12Q9UMY4 172 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 HYOU1Q9Y4L1 999 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 MYH10P35580 1976 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 H3BMM5 538 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 H7C0S8 307 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 CXCL11O14625 94 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 SLC31A2O15432 143 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 OAZ2O95190 189 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 MBP02144 154 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 SMIM6P0DI80 62 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 PSKH1P11801 424 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 KLRC1P26715 233 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 CASP3P42574 277 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 CCR9P51686 369 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 AKR1D1P51857 326 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 PGDP52209 483 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 DRG2P55039 364 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 NCKAP1LP55160 1127 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 PRKCZQ05513 592 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 LMAN2Q12907 356 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 FADDQ13158 208 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 FLOT2Q14254 428 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 EMC2Q15006 297 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 PON3Q15166 354 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 INAVAQ3KP66 663 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 SFT2D3Q587I9 215 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 FBXL19Q6PCT2 694 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 BRAT1Q6PJG6 821 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ABHD15Q6UXT9 468 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF767PQ75MW2 155 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 C16orf59Q7L2K0 433 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 CBWD2Q8IUF1 395 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ULK2Q8IYT8 1036 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 NAGSQ8N159 534 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 PDIK1LQ8N165 341 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 PPM1KQ8N3J5 372 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF248Q8NDW4 579 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 OR8K5Q8NH50 307 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 TCEAL3Q969E4 200 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 TMEM143Q96AN5 459 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ISOC1Q96CN7 298 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 LRRC37BQ96QE4 947 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF347Q96SE7 839 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 SLC9A7Q96T83 725 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 DOK1Q99704 481 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 MIPEPQ99797 713 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 TBCDQ9BTW9 1192 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 C1orf50Q9BV19 199 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 CHID1Q9BWS9 393 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 STRA6Q9BX79 667 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 RACGAP1Q9H0H5 632 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 AP5M1Q9H0R1 490 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 OR51M1Q9H341 326 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 C11orf49Q9H6J7 331 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 B3GNT2Q9NY97 397 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 GDE1Q9NZC3 331 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 CD274Q9NZQ7 290 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 DCDC2Q9UHG0 476 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 NAGPAQ9UK23 515 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 AP4E1Q9UPM8 1137 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ST14Q9Y5Y6 855 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ATP8B3O60423 1300 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 A0A1B0GVC2 190 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 FAM92AA1XBS5 289 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 KRT87PA6NCN2 255 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 EFCAB7A8K855 629 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 PJA2O43164 708 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 FKBP6O75344 327 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 TADA2AO75478 443 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 KRT37O76014 449 aa4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84 ms