RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530295.5

NDUFS3-208, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S3, humanhuman

TSL 3

Gene NDUFS3, Length 253 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS3-208ENST00000530295 SLC9B2Q86UD5 537 aa14.96□□□□□ -0.01
NDUFS3-208ENST00000530295 RASGRP3Q8IV61 690 aa14.96□□□□□ -0.01
NDUFS3-208ENST00000530295 SH3KBP1Q96B97 665 aa14.96□□□□□ -0.01
NDUFS3-208ENST00000530295 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa14.96□□□□□ -0.01
NDUFS3-208ENST00000530295 SMIM14Q96QK8 99 aa14.96□□□□□ -0.01
NDUFS3-208ENST00000530295 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
NDUFS3-208ENST00000530295 AGAP2Q99490 1192 aa14.96□□□□□ -0.01
NDUFS3-208ENST00000530295 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
NDUFS3-208ENST00000530295 TBC1D29Q9UFV1 150 aa14.96□□□□□ -0.01
NDUFS3-208ENST00000530295 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
NDUFS3-208ENST00000530295 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa14.95□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 EPHB6O15197 1021 aa14.95□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 KIAA0754O94854 1291 aa14.95□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 TNFRSF8P28908 595 aa14.95□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 PMS2P54278 862 aa14.95□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 GFERP55789 205 aa14.95□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 JAM2P57087 298 aa14.95□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 MAXP61244 160 aa14.95□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 DPTQ07507 201 aa14.95□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 IYDQ6PHW0 289 aa14.95□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa14.95□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 MON1BQ7L1V2 547 aa14.95□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 PGBD5Q8N414 524 aa14.95□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 SCRN2Q96FV2 425 aa14.95□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 NUDCD1Q96RS6 583 aa14.95□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 CASS4Q9NQ75 786 aa14.95□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa14.95□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 NDUFA10O95299 355 aa14.94□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 PGLSO95336 258 aa14.94□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 ACP5P13686 325 aa14.94□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 TYRP1P17643 537 aa14.94□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 PSMA2P25787 234 aa14.94□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 CASP14P31944 242 aa14.94□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 EPHA4P54764 986 aa14.94□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 SH3BP2P78314 561 aa14.94□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 NADK2Q4G0N4 442 aa14.94□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 ERMARDQ5T6L9 678 aa14.94□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 ARMC12Q5T9G4 340 aa14.94□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 LRRC66Q68CR7 880 aa14.94□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 PLXDC1Q8IUK5 500 aa14.94□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 SPOCK2Q92563 424 aa14.94□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 TGM7Q96PF1 710 aa14.94□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 OR6C1Q96RD1 312 aa14.94□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 TRIM55Q9BYV6 548 aa14.94□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 KCND3Q9UK17 655 aa14.94□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 CELSR2Q9HCU4 2923 aa14.93□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 CREG1O75629 220 aa14.93□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 CCNYL3P0C7X3 344 aa14.93□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 DNASE1L3Q13609 305 aa14.93□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 DPCR1Q3MIW9 517 aa14.93□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 TCP11X2Q5H9J9 407 aa14.93□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa14.93□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 BBS5Q8N3I7 341 aa14.93□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 EXD1Q8NHP7 514 aa14.93□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 C9orf72Q96LT7 481 aa14.93□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 ZNF599Q96NL3 588 aa14.93□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 PEBP4Q96S96 227 aa14.93□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 MAP10Q9P2G4 905 aa14.93□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 CPNE7Q9UBL6 633 aa14.93□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa14.93□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 A6NCN8 305 aa14.92□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 DNAJC6O75061 913 aa14.92□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 RASSF9O75901 435 aa14.92□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 PDHA1P08559 390 aa14.92□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 SLC2A4P14672 509 aa14.92□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 AMD1P17707 334 aa14.92□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 PGDP52209 483 aa14.92□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 PTSQ03393 145 aa14.92□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 CHAF1BQ13112 559 aa14.92□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa14.92□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 NDUFAF2Q8N183 169 aa14.92□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 PIH1D2Q8WWB5 315 aa14.92□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 COX14Q96I36 57 aa14.92□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 AGPAT1Q99943 283 aa14.92□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 HERPUD2Q9BSE4 406 aa14.92□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 SLC25A23Q9BV35 468 aa14.92□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 LUZP4Q9P127 313 aa14.92□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 PADI1Q9ULC6 663 aa14.92□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa14.91□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 A0A0G2JNG1 304 aa14.91□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 KIR2DS3K7RE56 304 aa14.91□□□□□ -0.02
NDUFS3-208ENST00000530295 PRPSAP2O60256 369 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms