RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481518.1

PSME4-208, Transcript of proteasome activator subunit 4, humanhuman

TSL 5

Gene PSME4, Length 886 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4-208ENST00000481518 ALS2CLQ60I27 953 aa22.84■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 FOXR1Q6PIV2 292 aa22.84■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 IGF2-ASQ6U949 168 aa22.84■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa22.84■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 ZNF438Q7Z4V0 828 aa22.84■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 GALNT13Q8IUC8 556 aa22.84■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 ARL14Q8N4G2 192 aa22.84■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 LRRC57Q8N9N7 239 aa22.84■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 SLC46A1Q96NT5 459 aa22.84■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 VPS18Q9P253 973 aa22.84■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa22.84■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 CCDC187A0A096LP49 1063 aa22.83■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 A0A0U1RQJ8 604 aa22.83■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 GRID2IPA4D2P6 1211 aa22.83■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 RRP8O43159 456 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 PJA2O43164 708 aa22.83■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 MTSS1O43312 755 aa22.83■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 B4GAT1O43505 415 aa22.83■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 CHRNA4P43681 627 aa22.83■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 WNT3AP56704 352 aa22.83■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 DCDC1P59894 354 aa22.83■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 ERVPABLB-1P60509 514 aa22.83■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 AADACL2Q6P093 401 aa22.83■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa22.83■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 HTR3CQ8WXA8 447 aa22.83■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 ALG3Q92685 438 aa22.83■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 GPR63Q9BZJ6 419 aa22.83■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 EPB41L5Q9HCM4 733 aa22.83■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 FAM153AQ9UHL3 310 aa22.83■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 SCN8AQ9UQD0 1980 aa22.83■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa22.82■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 HACD1B0YJ81 288 aa22.82■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa22.82■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 EML2O95834 649 aa22.82■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 APOC2P02655 101 aa22.82■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 CTNNA2P26232 953 aa22.82■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 INHBCP55103 352 aa22.82■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 COPS2P61201 443 aa22.82■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 NR1D2Q14995 579 aa22.82■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 PID1Q7Z2X4 250 aa22.82■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 SPACA3Q8IXA5 215 aa22.82■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 FCRL5Q96RD9 977 aa22.82■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 SPATA16Q9BXB7 569 aa22.82■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 ARFGAP3Q9NP61 516 aa22.82■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 THSD1Q9NS62 852 aa22.82■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 TRIM10Q9UDY6 481 aa22.82■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa22.82■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 BPIP17213 487 aa22.81■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 RBL1P28749 1068 aa22.81■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 CCKBRP32239 447 aa22.81■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 OR1D5P58170 312 aa22.81■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 LRP8Q14114 963 aa22.81■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 SIRPB2Q5JXA9 342 aa22.81■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 ZNF248Q8NDW4 579 aa22.81■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 ACTL9Q8TC94 416 aa22.81■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 MRGPRX2Q96LB1 330 aa22.81■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 VAT1Q99536 393 aa22.81■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 DESI2Q9BSY9 194 aa22.81■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 OSBPL8Q9BZF1 889 aa22.81■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 RDH14Q9HBH5 336 aa22.81■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 CCDC66A2RUB6 948 aa22.8■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 RHPN2P1A8MT19 583 aa22.8■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 CDRT15L2A8MXV6 281 aa22.8■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 PPM1DO15297 605 aa22.8■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 TNFSF15O95150 251 aa22.8■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 CDC25BP30305 580 aa22.8■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 PTPN7P35236 360 aa22.8■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 TLE3Q04726 772 aa22.8■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 XRCC4Q13426 336 aa22.8■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 ZNF569Q5MCW4 686 aa22.8■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 CCDC70Q6NSX1 233 aa22.8■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 KIAA1328Q86T90 577 aa22.8■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 SLITRK4Q8IW52 837 aa22.8■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 SLC25A41Q8N5S1 370 aa22.8■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 TRAM1L1Q8N609 369 aa22.8■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 SPC24Q8NBT2 197 aa22.8■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 TMEM74Q96NL1 305 aa22.8■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 FAM118BQ9BPY3 351 aa22.8■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 GORASP1Q9BQQ3 440 aa22.8■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 ATXN10Q9UBB4 475 aa22.8■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 EFR3BQ9Y2G0 817 aa22.8■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 ADGRG1Q9Y653 693 aa22.8■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 NBEAQ8NFP9 2946 aa22.8■■□□□ 1.24
PSME4-208ENST00000481518 MACROD2A1Z1Q3 448 aa22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms