RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608842.1

DGCR6-208, Transcript of DiGeorge syndrome critical region gene 6, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene DGCR6, Length 1,837 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DGCR6-208ENST00000608842 RMDN2Q96LZ7 410 aa23.35■■□□□ 1.33
DGCR6-208ENST00000608842 LYSMD1Q96S90 227 aa23.35■■□□□ 1.33
DGCR6-208ENST00000608842 SUV39H2Q9H5I1 410 aa23.35■■□□□ 1.33
DGCR6-208ENST00000608842 IGSF5Q9NSI5 407 aa23.35■■□□□ 1.33
DGCR6-208ENST00000608842 OBP2AQ9NY56 170 aa23.35■■□□□ 1.33
DGCR6-208ENST00000608842 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
DGCR6-208ENST00000608842 PPIL1Q9Y3C6 166 aa23.35■■□□□ 1.33
DGCR6-208ENST00000608842 CAPN8A6NHC0 703 aa23.34■■□□□ 1.33
DGCR6-208ENST00000608842 WASH3PC4AMC7 463 aa23.34■■□□□ 1.33
DGCR6-208ENST00000608842 TGDSO95455 350 aa23.34■■□□□ 1.33
DGCR6-208ENST00000608842 POP4O95707 220 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
DGCR6-208ENST00000608842 ADH1CP00326 375 aa23.34■■□□□ 1.33
DGCR6-208ENST00000608842 FDXRP22570 491 aa23.34■■□□□ 1.33
DGCR6-208ENST00000608842 DGKGP49619 791 aa23.34■■□□□ 1.33
DGCR6-208ENST00000608842 VASPP50552 380 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
DGCR6-208ENST00000608842 PTPRNQ16849 979 aa23.34■■□□□ 1.33
DGCR6-208ENST00000608842 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa23.34■■□□□ 1.33
DGCR6-208ENST00000608842 TMEM207Q6UWW9 146 aa23.34■■□□□ 1.33
DGCR6-208ENST00000608842 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
DGCR6-208ENST00000608842 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
DGCR6-208ENST00000608842 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa23.34■■□□□ 1.33
DGCR6-208ENST00000608842 LPGAT1Q92604 370 aa23.34■■□□□ 1.33
DGCR6-208ENST00000608842 UBXN10Q96LJ8 280 aa23.34■■□□□ 1.33
DGCR6-208ENST00000608842 EBF3Q9H4W6 596 aa23.34■■□□□ 1.33
DGCR6-208ENST00000608842 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
DGCR6-208ENST00000608842 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa23.34■■□□□ 1.33
DGCR6-208ENST00000608842 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
DGCR6-208ENST00000608842 CCT8L1PA6NM43 557 aa23.33■■□□□ 1.33
DGCR6-208ENST00000608842 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
DGCR6-208ENST00000608842 TK2O00142 265 aa23.33■■□□□ 1.33
DGCR6-208ENST00000608842 SLC12A2P55011 1212 aa23.33■■□□□ 1.33
DGCR6-208ENST00000608842 MESP2Q0VG99 397 aa23.33■■□□□ 1.33
DGCR6-208ENST00000608842 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
DGCR6-208ENST00000608842 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
DGCR6-208ENST00000608842 FAM45BPQ6NSW5 357 aa23.33■■□□□ 1.33
DGCR6-208ENST00000608842 SPATA6LQ8N4H0 392 aa23.33■■□□□ 1.33
DGCR6-208ENST00000608842 FAM45AQ8TCE6 357 aa23.33■■□□□ 1.33
DGCR6-208ENST00000608842 PPP2R3CQ969Q6 453 aa23.33■■□□□ 1.33
DGCR6-208ENST00000608842 TCF12Q99081 682 aa23.33■■□□□ 1.33
DGCR6-208ENST00000608842 C19orf43Q9BQ61 176 aa23.33■■□□□ 1.33
DGCR6-208ENST00000608842 GPR63Q9BZJ6 419 aa23.33■■□□□ 1.33
DGCR6-208ENST00000608842 NPHS2Q9NP85 383 aa23.33■■□□□ 1.33
DGCR6-208ENST00000608842 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 BNIP3LO60238 219 aa23.33■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 TULP3O75386 442 aa23.33■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 SP100P23497 879 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 ARRB2P32121 409 aa23.33■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 GLRBP48167 497 aa23.33■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 STX3Q13277 289 aa23.33■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa23.33■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 RFWD2Q8NHY2 731 aa23.33■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 TIFAQ96CG3 184 aa23.33■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 TSPAN17Q96FV3 270 aa23.33■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 KCNK13Q9HB14 408 aa23.33■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa23.33■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 ABCF3Q9NUQ8 709 aa23.33■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 APOA4P06727 396 aa23.32■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 SUOXP51687 545 aa23.32■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 SPRED3Q2MJR0 410 aa23.32■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 TANGO2Q6ICL3 276 aa23.32■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa23.32■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 RDH11Q8TC12 318 aa23.32■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 HEXDCQ8WVB3 486 aa23.32■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 ANKRD49Q8WVL7 239 aa23.32■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 FAM96AQ9H5X1 160 aa23.32■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa23.32■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 HPS4Q9NQG7 708 aa23.32■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 MED16Q9Y2X0 877 aa23.32■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 PKP3Q9Y446 797 aa23.32■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 TTC34A8MYJ7 566 aa23.31■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 ITM2AO43736 263 aa23.31■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 CLDN7O95471 211 aa23.31■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 NFATC1O95644 943 aa23.31■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 SERPINE1P05121 402 aa23.31■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 DLDP09622 509 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 PMLP29590 882 aa23.31■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 SLC6A11P48066 632 aa23.31■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa23.31■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 ZYG11AQ6WRX3 759 aa23.31■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 PIM3Q86V86 326 aa23.31■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 ZNF398Q8TD17 642 aa23.31■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 SCRN2Q96FV2 425 aa23.31■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 GPAMQ9HCL2 828 aa23.31■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 THAP1Q9NVV9 213 aa23.31■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa23.31■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 RALBP11234 206 aa23.31■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 ITGA9Q13797 1035 aa23.31■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 VITQ6UXI7 678 aa23.31■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 TSPAN33Q86UF1 283 aa23.31■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 TTC8Q8TAM2 541 aa23.31■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa23.31■■□□□ 1.32
DGCR6-208ENST00000608842 TSNARE1Q96NA8 513 aa23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms