RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPRED1Q7Z699 444 aa26.16■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TSPAN33Q86UF1 283 aa26.16■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NDUFAF2Q8N183 169 aa26.16■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPBAR1Q8TDU6 330 aa26.16■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SEMA3CQ99985 751 aa26.16■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa26.16■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPIL1Q9Y3C6 166 aa26.16■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATMQ13315 3056 aa26.15■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CFAP46Q8IYW2 2715 aa26.15■■□□□ 1.78
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MFSD11O43934 449 aa26.15■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C1QL1O75973 258 aa26.15■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GYPCP04921 128 aa26.15■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDK3Q00526 305 aa26.15■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP26.15■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DPYSL3Q14195 570 aa26.15■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCSK4Q6UW60 755 aa26.15■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PIH1D2Q8WWB5 315 aa26.15■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GSDMCQ9BYG8 508 aa26.15■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TEAD1P28347 426 aa26.14■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GJC1P36383 396 aa26.14■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GARSP41250 739 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GNPDA1P46926 289 aa26.14■■□□□ 1.78
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GALNT2Q10471 571 aa26.14■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLN3Q13286 438 aa26.14■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 JAMLQ86YT9 394 aa26.14■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IFNKQ9P0W0 207 aa26.14■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SUFUQ9UMX1 484 aa26.14■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa26.14■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UNC13CQ8NB66 2214 aa26.13■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FUCA1P04066 466 aa26.13■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDHA1P08559 390 aa26.13■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 JMJD7P0C870 316 aa26.13■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HGFP14210 728 aa26.13■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC5A2P31639 672 aa26.13■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DPTQ07507 201 aa26.13■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa26.13■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa26.13■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa26.13■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NRROSQ86YC3 692 aa26.13■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCTD6Q8NC69 237 aa26.13■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa26.13■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa26.13■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MATN3O15232 486 aa26.12■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FZD6O60353 706 aa26.12■■□□□ 1.77
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPR1P46091 355 aa26.12■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa26.12■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAML1Q92585 1016 aa26.12■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF670Q9BS34 389 aa26.12■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HAUS2Q9NVX0 235 aa26.12■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TAAR2Q9P1P5 351 aa26.12■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PISDQ9UG56 409 aa26.12■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa26.12■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LOXL2Q9Y4K0 774 aa26.12■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A0U1RQS6 177 aa26.11■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 K7ENP7 123 aa26.11■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PROSCO94903 275 aa26.11■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAP3K6O95382 1288 aa26.11■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CES1P23141 567 aa26.11■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CASP14P31944 242 aa26.11■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POLD2P49005 469 aa26.11■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EPHB1P54762 984 aa26.11■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAZP56270 477 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 B4GALNT1Q00973 533 aa26.11■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CFHR1Q03591 330 aa26.11■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDK2Q15119 407 aa26.11■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa26.11■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC66Q68CR7 880 aa26.11■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC81Q6ZN84 652 aa26.11■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CPNE8Q86YQ8 564 aa26.11■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAP7D3Q8IWC1 876 aa26.11■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP26.11■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM159Q96B96 161 aa26.11■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AP2M1Q96CW1 435 aa26.11■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WBP1Q96G27 269 aa26.11■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABCG8Q9H221 673 aa26.11■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP26.11■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WDR70Q9NW82 654 aa26.11■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UVRAGQ9P2Y5 699 aa26.11■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AMACRQ9UHK6 382 aa26.11■■□□□ 1.77
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