RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CPLX3Q8WVH0 158 aa26.22■■□□□ 1.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CPNE5Q9HCH3 593 aa26.22■■□□□ 1.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EPB41L5Q9HCM4 733 aa26.22■■□□□ 1.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SYCE3A1L190 88 aa26.21■■□□□ 1.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa26.21■■□□□ 1.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRB1P04280 392 aa26.21■■□□□ 1.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYP1A2P05177 515 aa26.21■■□□□ 1.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SKOR1P84550 965 aa26.21■■□□□ 1.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NFKBIBQ15653 356 aa26.21■■□□□ 1.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa26.21■■□□□ 1.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IQCDQ96DY2 449 aa26.21■■□□□ 1.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STRADBQ9C0K7 418 aa26.21■■□□□ 1.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRN3Q9H3W5 708 aa26.21■■□□□ 1.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CAPN11Q9UMQ6 739 aa26.21■■□□□ 1.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A087X0T9 212 aa26.2■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A1W2PQM1 296 aa26.2■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRSS38A1L453 326 aa26.2■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 B4DGG1 531 aa26.2■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM228BP0C875 321 aa26.2■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GLB1P16278 677 aa26.2■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SSR1P43307 286 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 INHBCP55103 352 aa26.2■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CERCAMQ5T4B2 595 aa26.2■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARHGAP40Q5TG30 622 aa26.2■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLEC14AQ86T13 490 aa26.2■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCNJLQ8IV13 435 aa26.2■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DPEP2Q9H4A9 486 aa26.2■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 APPL1Q9UKG1 709 aa26.2■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYO1FO00160 1098 aa26.19■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLD2O14939 933 aa26.19■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NOBOXO60393 691 aa26.19■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PGLSO95336 258 aa26.19■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ITGA2BP08514 1039 aa26.19■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ETV3P41162 512 aa26.19■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C19orf57Q0VDD7 668 aa26.19■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C14orf28Q4W4Y0 310 aa26.19■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARMC12Q5T9G4 340 aa26.19■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAB11FIP2Q7L804 512 aa26.19■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa26.19■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HEATR4Q86WZ0 1026 aa26.19■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC49Q8IUZ0 686 aa26.19■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCL4L1Q8NHW4 92 aa26.19■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DTD2Q96FN9 168 aa26.19■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SCRN2Q96FV2 425 aa26.19■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM74Q96NL1 305 aa26.19■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TEX101Q9BY14 249 aa26.19■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FOXP3Q9BZS1 431 aa26.19■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NT5MQ9NPB1 228 aa26.19■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PSMD11O00231 422 aa26.18■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PNLIPP16233 465 aa26.18■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LHCGRP22888 699 aa26.18■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IL4RP24394 825 aa26.18■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MMRN1Q13201 1228 aa26.18■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARHGEF7Q14155 803 aa26.18■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HADHQ16836 314 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC122Q5T0U0 273 aa26.18■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa26.18■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP45Q70EL2 814 aa26.18■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SFTPA2Q8IWL1 248 aa26.18■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FBXO39Q8N4B4 442 aa26.18■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRIT1Q9P2V4 623 aa26.18■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa26.17■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CD48P09326 243 aa26.17■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCKBRP32239 447 aa26.17■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VAC14Q08AM6 782 aa26.17■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP26.17■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TEX26Q8N6G2 289 aa26.17■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM71BQ8TC56 605 aa26.17■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIAA1524Q8TCG1 905 aa26.17■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SSUH2Q9Y2M2 353 aa26.17■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNF215Q9Y6U7 377 aa26.17■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GOLGA6CA6NDK9 693 aa26.16■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GOLGA6BA6NDN3 693 aa26.16■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ERVH48-1M5A8F1 160 aa26.16■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CEACAM5P06731 702 aa26.16■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GOLGA6DP0CG33 693 aa26.16■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRT10P13645 584 aa26.16■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCNB1P14635 433 aa26.16■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CTPS1P17812 591 aa26.16■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UGT1A5P35504 534 aa26.16■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RHDQ02161 417 aa26.16■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ITKQ08881 620 aa26.16■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTPRRQ15256 657 aa26.16■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAET1GQ6H3X3 334 aa26.16■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 Q6ZVL8 140 aa26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.6 ms