RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 CTF1Q16619 201 aa9.93□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 NDUFA5Q16718 116 aa9.93□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 BTLAQ7Z6A9 289 aa9.93□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 SPPL2CQ8IUH8 684 aa9.93□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 SFRP1Q8N474 314 aa9.93□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 S100ZQ8WXG8 99 aa9.93□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 TMEM125Q96AQ2 219 aa9.93□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 SCYL1Q96KG9 808 aa9.93□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 TRMOQ9BU70 441 aa9.93□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 TRIM54Q9BYV2 358 aa9.93□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 ACAD9Q9H845 621 aa9.93□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 RMND5AQ9H871 391 aa9.93□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP9.93□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 BRWD3Q6RI45 1802 aa9.93□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 NCAM2O15394 837 aa9.93□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 CLIC3O95833 236 aa9.93□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 PCMT1P22061 227 aa9.93□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 SLC6A2P23975 617 aa9.93□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 GLRBP48167 497 aa9.93□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 PLA2G16P53816 162 aa9.93□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 AIF1P55008 147 aa9.93□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 RBP5P82980 135 aa9.93□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 STXBP2Q15833 593 aa9.93□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 KCNJ8Q15842 424 aa9.93□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 BSPRYQ5W0U4 402 aa9.93□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 GALNT7Q86SF2 657 aa9.93□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 LINC00523Q86TU6 105 aa9.93□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 UNC93AQ86WB7 457 aa9.93□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 TBC1D21Q8IYX1 336 aa9.93□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 OFCC1Q8IZS5 231 aa9.93□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 SPARTQ8N0X7 666 aa9.93□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 FBLIM1Q8WUP2 373 aa9.93□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 HEXDCQ8WVB3 486 aa9.93□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 CYGBQ8WWM9 190 aa9.93□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 RDH12Q96NR8 316 aa9.93□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 TPK1Q9H3S4 243 aa9.93□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 SLC22A1O15245 554 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 MSI1O43347 362 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 SNAP29O95721 258 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 ITIH1P19827 911 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 GSSP48637 474 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 BST2Q10589 180 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 NEDD8Q15843 81 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 Q3C1V9 767 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 SLC22A17Q8WUG5 538 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 OTUD5Q96G74 571 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 CPB2Q96IY4 423 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 TSGA13Q96PP4 275 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 SLC30A3Q99726 388 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 SLC39A3Q9BRY0 314 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 MINDY3Q9H8M7 445 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 HMG20AQ9NP66 347 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 DAPK2Q9UIK4 370 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 FAM149AA5PLN7 773 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 MTSS1O43312 755 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 IPO13O94829 963 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 STMN1P16949 149 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 CAPN3P20807 821 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 KCNA5P22460 613 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 ACADSBP45954 432 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 POU4F1Q01851 419 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 SELENBP1Q13228 472 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 TMEM132DQ14C87 1099 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 PIGZQ86VD9 579 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 LACC1Q8IV20 430 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 TP53INP2Q8IXH6 220 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 LINC01465Q8N7H1 131 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 OR9I1Q8NGQ6 314 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 SLC2A13Q96QE2 648 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 NPY6RQ99463 290 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 VAT1Q99536 393 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 NTN4Q9HB63 628 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 FAM49BQ9NUQ9 324 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 GTSE1Q9NYZ3 720 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 GPRC5DQ9NZD1 345 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 SHROOM3Q8TF72 1996 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 PSMD3O43242 534 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 GABARAPO95166 117 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 OSTNP61366 133 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 CDH17Q12864 832 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 ZNF460Q14592 562 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 PITRM1Q5JRX3 1037 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 PKN3Q6P5Z2 889 aa9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms