RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455157.6

SSUH2-208, Transcript of ssu-2 homolog (C. elegans), human

TSL 2

Gene SSUH2, Length 3,219 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSUH2-208	ENST00000455157	NUP205	Q92621	2012 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	GMNN	O75496	209 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	RECQL4	O94761	1208 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	C22orf31	O95567	290 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	CLIC3	O95833	236 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	AHSG	P02765	367 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	NOS2	P35228	1153 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	GLUD2	P49448	558 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	RAB10	P61026	200 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	CHRNE	Q04844	493 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	IKBKE	Q14164	716 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	NEDD8	Q15843	81 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	KYAT1	Q16773	422 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	CLEC6A	Q6EIG7	209 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	CARM1	Q86X55	608 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	WNT8B	Q93098	351 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	KLRG1	Q96E93	195 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC29A1	Q99808	456 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	FICD	Q9BVA6	458 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	ELP3	Q9H9T3	547 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	OLAH	Q9NV23	265 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	HACD3	Q9P035	362 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	C7orf72	A4D263	438 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	ARHGAP33	O14559	1287 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	TSPAN1	O60635	241 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	LGALS2	P05162	132 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	MSL3P1	P0C860	447 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	BMPR1A	P36894	532 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC26A2	P50443	739 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	LAMC2	Q13753	1193 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	FIBCD1	Q8N539	461 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	CNTD1	Q8N815	330 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	WDCP	Q9H6R7	721 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	MAGEB16	A2A368	324 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	ANGPT2	O15123	496 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	MT-ND1	P03886	318 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	FYN	P06241	537 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	ALOX5	P09917	674 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	IL10	P22301	178 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	DCK	P27707	260 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	ADRA1B	P35368	520 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	NPY2R	P49146	381 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	CDH13	P55290	713 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	CCNA1	P78396	465 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	FUT11	Q495W5	492 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	11.4	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	TADA2A	O75478	443 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	USP17L7	P0C7H9	530 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	TAS2R39	P59534	338 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	GPR107	Q5VW38	600 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	REP15	Q6BDI9	236 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	TMEM135	Q86UB9	458 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	CBR4	Q8N4T8	237 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	ASB9	Q96DX5	294 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	C12orf42	Q96LP6	360 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157		H3BRB1	525 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	SNAP91	O60641	907 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	JRK	O75564	520 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	PAM	P19021	973 aa		11.39	□□□□□ -0.59

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