RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325897.4

CLVS1-201, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLVS1, Length 3,486 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-201ENST00000325897 C3orf58Q8NDZ4 430 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF398Q8TD17 642 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 TLCD1Q96CP7 247 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 ARHGEF26Q96DR7 871 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 ERLEC1Q96DZ1 483 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 CITED4Q96RK1 184 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 TWNKQ96RR1 684 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 LRRC1Q9BTT6 524 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 PRKD2Q9BZL6 878 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 HIPK3Q9H422 1215 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF696Q9H7X3 374 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 NMUR1Q9HB89 426 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 CMTM6Q9NX76 183 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 ZIM2Q9NZV7 527 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 DAPK2Q9UIK4 370 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 TLK1Q9UKI8 766 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 TFR2Q9UP52 801 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 RPTORQ8N122 1335 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 ATAD5Q96QE3 1844 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 H0YIV9 168 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 MEN1O00255 615 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 TERTO14746 1132 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 TXNL1O43396 289 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 DYRK3O43781 588 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 SMPD2O60906 423 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 CD48P09326 243 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 DSG3P32926 999 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 MEOX2P50222 304 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 GATMP50440 423 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 JAK3P52333 1124 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 ITGA8P53708 1063 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 DCDC1P59894 354 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 COPZ1P61923 177 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF844Q08AG5 666 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 ACSBG2Q5FVE4 666 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 MARCH8Q5T0T0 291 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 SLFN12LQ6IEE8 588 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 VSIG1Q86XK7 387 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 OR6Y1Q8NGX8 325 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 ASB16Q96NS5 453 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 SLC19A3Q9BZV2 496 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 BCAS3Q9H6U6 928 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 NPHS2Q9NP85 383 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 NUDT15Q9NV35 164 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 COA4Q9NYJ1 87 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 MAT2BQ9NZL9 334 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 APPL1Q9UKG1 709 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 ASTN1O14525 1302 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 A0A1W2PRG6 482 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 H3BNX3 289 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 H3BSA7 217 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 SORBS3O60504 671 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 UGT1A9O60656 530 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 HSPA4LO95757 839 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 WDPCPO95876 746 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 SERPINF2P08697 491 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 CLEC2LP0C7M8 214 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 CCDC130P13994 396 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 UGT1A6P19224 532 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 UGT1A1P22309 533 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 UGT1A4P22310 534 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 EPHB2P29323 1055 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 SFNP31947 248 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 UGT1A3P35503 534 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 UGT1A5P35504 534 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 CASP4P49662 377 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 OAZ1P54368 228 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 ORC1Q13415 861 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 RIN1Q13671 783 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 SCARB2Q14108 478 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 VGLL4Q14135 290 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 ARHGAP19Q14CB8 494 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 TMEM31Q5JXX7 168 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 FAM102BQ5T8I3 360 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 GADL1Q6ZQY3 521 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF720Q7Z2F6 126 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 C12orf40Q86WS4 652 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 AHI1Q8N157 1196 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 RDH13Q8NBN7 331 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 TBC1D15Q8TC07 691 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 FIG4Q92562 907 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 BTBD9Q96Q07 612 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 KRT12Q99456 494 aa4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms