RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 TBC1D13Q9NVG8 400 aa9.96□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa9.96□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 CLOCKO15516 846 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 F7P08709 466 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
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HCG18-242ENST00000602319 RAB10P61026 200 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 SLC14A2Q15849 920 aa9.96□□□□□ -0.82
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HCG18-242ENST00000602319 ZNF484Q5JVG2 852 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 CADM3Q8N126 398 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 PYROXD2Q8N2H3 581 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 SNX31Q8N9S9 440 aa9.96□□□□□ -0.82
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HCG18-242ENST00000602319 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
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HCG18-242ENST00000602319 ABCB7O75027 752 aa9.95□□□□□ -0.82
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HCG18-242ENST00000602319 EXOC8Q8IYI6 725 aa9.95□□□□□ -0.82
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HCG18-242ENST00000602319 RNF139Q8WU17 664 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 MAGED4Q96JG8 741 aa9.95□□□□□ -0.82
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HCG18-242ENST00000602319 PPP1R3AQ16821 1122 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 UGT3A2Q3SY77 523 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 FAM160B1Q5W0V3 765 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 AGMOQ6ZNB7 445 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 SCUBE3Q8IX30 993 aa9.95□□□□□ -0.82
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